GCA_001436385.1 - 2 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaJMNGKCJH_106 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_106)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 51.1	RiPP-like	1	5,853

gnlProkkaJMNGKCJH_139 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_139)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 84.1	RiPP-like	1	8,062

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaJMNGKCJH_1 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_1); gnlProkkaJMNGKCJH_2 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_2); gnlProkkaJMNGKCJH_3 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_3); gnlProkkaJMNGKCJH_4 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_4); gnlProkkaJMNGKCJH_5 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_5); gnlProkkaJMNGKCJH_6 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_6); gnlProkkaJMNGKCJH_7 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_7); gnlProkkaJMNGKCJH_8 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_8); gnlProkkaJMNGKCJH_9 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_9); gnlProkkaJMNGKCJH_10 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_10); gnlProkkaJMNGKCJH_11 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_11); gnlProkkaJMNGKCJH_12 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_12); gnlProkkaJMNGKCJH_13 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_13); gnlProkkaJMNGKCJH_14 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_14); gnlProkkaJMNGKCJH_15 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_15); gnlProkkaJMNGKCJH_16 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_16); gnlProkkaJMNGKCJH_17 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_17); gnlProkkaJMNGKCJH_18 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_18); gnlProkkaJMNGKCJH_19 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_19); gnlProkkaJMNGKCJH_24 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_24); gnlProkkaJMNGKCJH_35 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_35); gnlProkkaJMNGKCJH_46 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_46); gnlProkkaJMNGKCJH_57 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_57); gnlProkkaJMNGKCJH_68 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_68); gnlProkkaJMNGKCJH_79 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_79); gnlProkkaJMNGKCJH_81 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_81); gnlProkkaJMNGKCJH_82 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_82); gnlProkkaJMNGKCJH_83 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_83); gnlProkkaJMNGKCJH_84 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_84); gnlProkkaJMNGKCJH_85 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_85); gnlProkkaJMNGKCJH_86 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_86); gnlProkkaJMNGKCJH_87 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_87); gnlProkkaJMNGKCJH_88 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_88); gnlProkkaJMNGKCJH_89 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_89); gnlProkkaJMNGKCJH_90 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_90); gnlProkkaJMNGKCJH_91 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_91); gnlProkkaJMNGKCJH_92 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_92); gnlProkkaJMNGKCJH_93 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_93); gnlProkkaJMNGKCJH_94 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_94); gnlProkkaJMNGKCJH_95 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_95); gnlProkkaJMNGKCJH_96 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_96); gnlProkkaJMNGKCJH_97 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_97); gnlProkkaJMNGKCJH_98 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_98); gnlProkkaJMNGKCJH_99 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_99); gnlProkkaJMNGKCJH_100 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_100); gnlProkkaJMNGKCJH_101 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_101); gnlProkkaJMNGKCJH_102 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_102); gnlProkkaJMNGKCJH_103 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_103); gnlProkkaJMNGKCJH_104 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_104); gnlProkkaJMNGKCJH_105 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_105); gnlProkkaJMNGKCJH_107 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_107); gnlProkkaJMNGKCJH_108 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_108); gnlProkkaJMNGKCJH_109 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_109); gnlProkkaJMNGKCJH_110 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_110); gnlProkkaJMNGKCJH_111 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_111); gnlProkkaJMNGKCJH_112 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_112); gnlProkkaJMNGKCJH_113 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_113); gnlProkkaJMNGKCJH_114 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_114); gnlProkkaJMNGKCJH_115 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_115); gnlProkkaJMNGKCJH_116 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_116); gnlProkkaJMNGKCJH_117 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_117); gnlProkkaJMNGKCJH_118 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_118); gnlProkkaJMNGKCJH_119 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_119); gnlProkkaJMNGKCJH_120 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_120); gnlProkkaJMNGKCJH_121 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_121); gnlProkkaJMNGKCJH_122 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_122); gnlProkkaJMNGKCJH_123 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_123); gnlProkkaJMNGKCJH_124 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_124); gnlProkkaJMNGKCJH_125 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_125); gnlProkkaJMNGKCJH_126 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_126); gnlProkkaJMNGKCJH_127 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_127); gnlProkkaJMNGKCJH_128 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_128); gnlProkkaJMNGKCJH_129 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_129); gnlProkkaJMNGKCJH_130 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_130); gnlProkkaJMNGKCJH_131 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_131); gnlProkkaJMNGKCJH_132 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_132); gnlProkkaJMNGKCJH_133 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_133); gnlProkkaJMNGKCJH_134 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_134); gnlProkkaJMNGKCJH_135 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_135); gnlProkkaJMNGKCJH_136 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_136); gnlProkkaJMNGKCJH_137 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_137); gnlProkkaJMNGKCJH_138 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_138); gnlProkkaJMNGKCJH_140 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_140); gnlProkkaJMNGKCJH_141 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_141); gnlProkkaJMNGKCJH_142 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_142); gnlProkkaJMNGKCJH_143 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_143); gnlProkkaJMNGKCJH_144 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_144); gnlProkkaJMNGKCJH_145 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_145); gnlProkkaJMNGKCJH_146 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_146); gnlProkkaJMNGKCJH_147 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_147); gnlProkkaJMNGKCJH_148 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_148); gnlProkkaJMNGKCJH_149 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_149); gnlProkkaJMNGKCJH_150 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_150); gnlProkkaJMNGKCJH_151 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_151); gnlProkkaJMNGKCJH_152 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_152); gnlProkkaJMNGKCJH_153 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_153); gnlProkkaJMNGKCJH_154 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_154); gnlProkkaJMNGKCJH_155 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_155); gnlProkkaJMNGKCJH_156 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_156); gnlProkkaJMNGKCJH_157 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_157); gnlProkkaJMNGKCJH_158 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_158); gnlProkkaJMNGKCJH_159 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_159); gnlProkkaJMNGKCJH_160 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_160); gnlProkkaJMNGKCJH_161 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_161); gnlProkkaJMNGKCJH_162 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_162); gnlProkkaJMNGKCJH_163 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_163); gnlProkkaJMNGKCJH_164 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_164); gnlProkkaJMNGKCJH_165 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_165); gnlProkkaJMNGKCJH_166 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_166); gnlProkkaJMNGKCJH_167 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_167); gnlProkkaJMNGKCJH_168 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_168); gnlProkkaJMNGKCJH_169 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_169); gnlProkkaJMNGKCJH_170 (original name was: gnl|Prokka|JMNGKCJH_170)

Compact view

gnlProkkaJMNGKCJH_106 - Region 1 - RiPP-like

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 5,853 nt. (total: 5,853 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

RiPP-like: (strepbact or Antimicrobial14 or Bacteriocin_IId or BacteriocIIc_cy or Bacteriocin_II or Bacteriocin_IIi or Lactococcin or Antimicrobial17 or Lactococcin_972 or Bacteriocin_IIc or LcnG-beta or Cloacin or Linocin_M18 or TIGR03651 or TIGR03693 or TIGR03601 or TIGR03795 or TIGR03975 or DUF692 or TIGR01193 or (YcaO or TIGR03604))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.

gnlProkkaJMNGKCJH_139 - Region 1 - RiPP-like

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 8,062 nt. (total: 8,062 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

RiPP-like: (strepbact or Antimicrobial14 or Bacteriocin_IId or BacteriocIIc_cy or Bacteriocin_II or Bacteriocin_IIi or Lactococcin or Antimicrobial17 or Lactococcin_972 or Bacteriocin_IIc or LcnG-beta or Cloacin or Linocin_M18 or TIGR03651 or TIGR03693 or TIGR03601 or TIGR03795 or TIGR03975 or DUF692 or TIGR01193 or (YcaO or TIGR03604))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.