GCA_001656945.1 - 3 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaOIGACJCJ_10 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_10)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 10.1	RiPP-like	1	16,351

gnlProkkaOIGACJCJ_17 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_17)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 17.1	T3PKS	12,317	53,489

gnlProkkaOIGACJCJ_41 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_41)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 41.1	lanthipeptide-class-iv	3,364	19,114

Region	Type	From	To	Similarity
Region 10.1	RiPP-like	1	16,351
Region 17.1	T3PKS	12,317	53,489
Region 41.1	lanthipeptide-class-iv	3,364	19,114

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaOIGACJCJ_1 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_1); gnlProkkaOIGACJCJ_2 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_2); gnlProkkaOIGACJCJ_3 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_3); gnlProkkaOIGACJCJ_4 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_4); gnlProkkaOIGACJCJ_5 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_5); gnlProkkaOIGACJCJ_6 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_6); gnlProkkaOIGACJCJ_7 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_7); gnlProkkaOIGACJCJ_8 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_8); gnlProkkaOIGACJCJ_9 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_9); gnlProkkaOIGACJCJ_11 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_11); gnlProkkaOIGACJCJ_12 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_12); gnlProkkaOIGACJCJ_13 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_13); gnlProkkaOIGACJCJ_14 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_14); gnlProkkaOIGACJCJ_15 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_15); gnlProkkaOIGACJCJ_16 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_16); gnlProkkaOIGACJCJ_18 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_18); gnlProkkaOIGACJCJ_19 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_19); gnlProkkaOIGACJCJ_20 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_20); gnlProkkaOIGACJCJ_21 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_21); gnlProkkaOIGACJCJ_22 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_22); gnlProkkaOIGACJCJ_23 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_23); gnlProkkaOIGACJCJ_24 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_24); gnlProkkaOIGACJCJ_25 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_25); gnlProkkaOIGACJCJ_26 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_26); gnlProkkaOIGACJCJ_27 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_27); gnlProkkaOIGACJCJ_28 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_28); gnlProkkaOIGACJCJ_29 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_29); gnlProkkaOIGACJCJ_30 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_30); gnlProkkaOIGACJCJ_31 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_31); gnlProkkaOIGACJCJ_32 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_32); gnlProkkaOIGACJCJ_33 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_33); gnlProkkaOIGACJCJ_34 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_34); gnlProkkaOIGACJCJ_35 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_35); gnlProkkaOIGACJCJ_36 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_36); gnlProkkaOIGACJCJ_37 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_37); gnlProkkaOIGACJCJ_38 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_38); gnlProkkaOIGACJCJ_39 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_39); gnlProkkaOIGACJCJ_40 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_40); gnlProkkaOIGACJCJ_42 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_42); gnlProkkaOIGACJCJ_43 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_43); gnlProkkaOIGACJCJ_44 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_44); gnlProkkaOIGACJCJ_45 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_45); gnlProkkaOIGACJCJ_46 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_46); gnlProkkaOIGACJCJ_47 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_47); gnlProkkaOIGACJCJ_48 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_48); gnlProkkaOIGACJCJ_49 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_49); gnlProkkaOIGACJCJ_50 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_50); gnlProkkaOIGACJCJ_51 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_51); gnlProkkaOIGACJCJ_52 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_52); gnlProkkaOIGACJCJ_53 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_53); gnlProkkaOIGACJCJ_54 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_54); gnlProkkaOIGACJCJ_55 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_55); gnlProkkaOIGACJCJ_56 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_56); gnlProkkaOIGACJCJ_57 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_57); gnlProkkaOIGACJCJ_58 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_58); gnlProkkaOIGACJCJ_59 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_59); gnlProkkaOIGACJCJ_60 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_60); gnlProkkaOIGACJCJ_61 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_61); gnlProkkaOIGACJCJ_62 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_62); gnlProkkaOIGACJCJ_63 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_63); gnlProkkaOIGACJCJ_64 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_64); gnlProkkaOIGACJCJ_65 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_65); gnlProkkaOIGACJCJ_66 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_66); gnlProkkaOIGACJCJ_67 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_67); gnlProkkaOIGACJCJ_68 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_68); gnlProkkaOIGACJCJ_69 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_69); gnlProkkaOIGACJCJ_70 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_70); gnlProkkaOIGACJCJ_71 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_71); gnlProkkaOIGACJCJ_72 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_72); gnlProkkaOIGACJCJ_73 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_73); gnlProkkaOIGACJCJ_74 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_74); gnlProkkaOIGACJCJ_75 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_75); gnlProkkaOIGACJCJ_76 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_76); gnlProkkaOIGACJCJ_77 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_77); gnlProkkaOIGACJCJ_78 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_78); gnlProkkaOIGACJCJ_79 (original name was: gnl|Prokka|OIGACJCJ_79)

Compact view

gnlProkkaOIGACJCJ_10 - Region 1 - RiPP-like

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 16,351 nt. (total: 16,351 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

RiPP-like: (strepbact or Antimicrobial14 or Bacteriocin_IId or BacteriocIIc_cy or Bacteriocin_II or Bacteriocin_IIi or Lactococcin or Antimicrobial17 or Lactococcin_972 or Bacteriocin_IIc or LcnG-beta or Cloacin or Linocin_M18 or TIGR03651 or TIGR03693 or TIGR03601 or TIGR03795 or TIGR03975 or DUF692 or TIGR01193 or (YcaO or TIGR03604))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.

gnlProkkaOIGACJCJ_17 - Region 1 - T3PKS

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 12,317 - 53,489 nt. (total: 41,173 nt) Show pHMM detection rules used

T3PKS: (Chal_sti_synt_C or Chal_sti_synt_N)

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.

gnlProkkaOIGACJCJ_41 - Region 1 - lanthipeptide-class-iv

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 3,364 - 19,114 nt. (total: 15,751 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

lanthipeptide-class-iv: (cds(LANC_like and Pkinase) and not micKC)

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Lanthipeptides

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.

Lanthipeptide predictions

Lanthipeptides - No core peptides found.

Lanthipeptides

Core peptide predictions

No core peptides found.