GCA_001657165.1 - 1 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaAOGAALNK_56 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_56)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 51.1	RiPP-like	1	16,871

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaAOGAALNK_2 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_2); gnlProkkaAOGAALNK_3 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_3); gnlProkkaAOGAALNK_4 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_4); gnlProkkaAOGAALNK_5 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_5); gnlProkkaAOGAALNK_6 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_6); gnlProkkaAOGAALNK_7 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_7); gnlProkkaAOGAALNK_8 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_8); gnlProkkaAOGAALNK_9 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_9); gnlProkkaAOGAALNK_10 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_10); gnlProkkaAOGAALNK_11 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_11); gnlProkkaAOGAALNK_12 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_12); gnlProkkaAOGAALNK_13 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_13); gnlProkkaAOGAALNK_14 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_14); gnlProkkaAOGAALNK_16 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_16); gnlProkkaAOGAALNK_17 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_17); gnlProkkaAOGAALNK_18 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_18); gnlProkkaAOGAALNK_19 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_19); gnlProkkaAOGAALNK_20 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_20); gnlProkkaAOGAALNK_21 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_21); gnlProkkaAOGAALNK_22 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_22); gnlProkkaAOGAALNK_24 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_24); gnlProkkaAOGAALNK_25 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_25); gnlProkkaAOGAALNK_26 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_26); gnlProkkaAOGAALNK_27 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_27); gnlProkkaAOGAALNK_28 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_28); gnlProkkaAOGAALNK_29 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_29); gnlProkkaAOGAALNK_30 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_30); gnlProkkaAOGAALNK_31 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_31); gnlProkkaAOGAALNK_32 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_32); gnlProkkaAOGAALNK_33 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_33); gnlProkkaAOGAALNK_34 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_34); gnlProkkaAOGAALNK_35 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_35); gnlProkkaAOGAALNK_36 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_36); gnlProkkaAOGAALNK_38 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_38); gnlProkkaAOGAALNK_39 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_39); gnlProkkaAOGAALNK_40 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_40); gnlProkkaAOGAALNK_42 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_42); gnlProkkaAOGAALNK_43 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_43); gnlProkkaAOGAALNK_44 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_44); gnlProkkaAOGAALNK_45 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_45); gnlProkkaAOGAALNK_46 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_46); gnlProkkaAOGAALNK_47 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_47); gnlProkkaAOGAALNK_48 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_48); gnlProkkaAOGAALNK_49 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_49); gnlProkkaAOGAALNK_50 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_50); gnlProkkaAOGAALNK_51 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_51); gnlProkkaAOGAALNK_52 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_52); gnlProkkaAOGAALNK_53 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_53); gnlProkkaAOGAALNK_54 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_54); gnlProkkaAOGAALNK_55 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_55); gnlProkkaAOGAALNK_57 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_57); gnlProkkaAOGAALNK_58 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_58); gnlProkkaAOGAALNK_59 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_59); gnlProkkaAOGAALNK_60 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_60); gnlProkkaAOGAALNK_62 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_62); gnlProkkaAOGAALNK_63 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_63); gnlProkkaAOGAALNK_64 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_64); gnlProkkaAOGAALNK_65 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_65); gnlProkkaAOGAALNK_66 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_66); gnlProkkaAOGAALNK_67 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_67); gnlProkkaAOGAALNK_70 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_70); gnlProkkaAOGAALNK_72 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_72); gnlProkkaAOGAALNK_73 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_73); gnlProkkaAOGAALNK_75 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_75); gnlProkkaAOGAALNK_77 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_77); gnlProkkaAOGAALNK_79 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_79); gnlProkkaAOGAALNK_82 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_82); gnlProkkaAOGAALNK_83 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_83); gnlProkkaAOGAALNK_86 (original name was: gnl|Prokka|AOGAALNK_86)

Compact view

gnlProkkaAOGAALNK_56 - Region 1 - RiPP-like

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 16,871 nt. (total: 16,871 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

RiPP-like: (strepbact or Antimicrobial14 or Bacteriocin_IId or BacteriocIIc_cy or Bacteriocin_II or Bacteriocin_IIi or Lactococcin or Antimicrobial17 or Lactococcin_972 or Bacteriocin_IIc or LcnG-beta or Cloacin or Linocin_M18 or TIGR03651 or TIGR03693 or TIGR03601 or TIGR03795 or TIGR03975 or DUF692 or TIGR01193 or (YcaO or TIGR03604))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.