QueryID	Family	Cluster	IsBegin	IsEnd	IrId	IrLen	Ngaps	OrfBegin	OrfEnd	Strand	OrfLen	Evalue	Type
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	14462	16196	23	32	0	14582	15780	-	1199	5.6e-50	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	15883	17270	8	10	0	0	0		1	7.8e-63	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	42268	43089	7	8	0	0	0		1	8.5e-63	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	43201	43419	0	0	0	43201	43419	+	219	6.7e-29	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	78522	79298	10	14	0	78528	79345	-	818	8.5e-63	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	102075	103485	18	24	0	0	0		1	2.2e-47	c
HKCAJAIO_1	IS6	IS6_292	114085	115671	15	19	0	114119	115572	-	1454	9.7e-23	p
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	136952	137538	0	0	0	0	0		1	2.2e-47	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	200382	201585	19	23	0	0	0		1	7.8e-63	c
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	235717	236356	0	0	0	0	0		1	2e-47	p
HKCAJAIO_1	IS21	IS21_288	296326	297550	16	20	0	296759	297661	+	903	3.1e-11	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	300415	300609	0	0	0	300415	300609	-	195	2.5e-24	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	300682	301554	6	7	0	0	0		1	7.8e-63	p
HKCAJAIO_1	IS6	IS6_292	366036	366855	19	21	0	366117	366485	+	369	2e-65	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_111	369143	370165	16	17	0	369148	369986	-	839	3.4e-24	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_176	472186	473855	26	32	0	472220	473790	-	1571	3.6e-82	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	486234	487644	18	24	0	486267	487523	-	1257	2.2e-47	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	492095	493396	6	6	0	0	0		1	1.7e-63	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_176	493609	494117	31	48	0	493747	494108	-	362	5.3e-36	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_176	495191	496860	26	32	0	0	0		1	3.6e-82	c
HKCAJAIO_1	IS256	IS256_162	623373	624654	24	34	0	623390	624614	-	1225	1.8e-137	c
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_251	625297	626222	13	16	0	625620	626030	+	411	1.6e-77	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	649777	651187	18	24	0	0	0		1	2.2e-47	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	652490	653905	21	28	0	652567	653871	+	1305	1.1e-65	c
HKCAJAIO_1	new	new_7	655800	659107	20	26	0	656268	659153	-	2886	2.1e-79	c
HKCAJAIO_1	IS256	IS256_162	659173	660466	17	19	1	0	0		1	2.2e-147	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	712123	713222	23	31	0	712511	713094	-	584	2.1e-14	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	733434	734869	21	25	0	0	0		1	8.5e-63	c
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_176	759394	761063	26	32	0	0	0		1	3.6e-82	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	761092	762435	0	0	0	761220	762431	+	1212	1.7e-63	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_176	771258	772928	25	32	0	0	0		1	3.6e-82	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	772942	774357	21	28	0	0	0		1	1.1e-65	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	790695	791659	18	24	0	790676	791538	-	863	6.6e-18	c
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_176	801667	803336	26	32	0	801701	803271	-	1571	3.6e-82	c
HKCAJAIO_1	IS256	IS256_162	803387	804680	17	19	1	0	0		1	2.2e-147	c
HKCAJAIO_1	IS256	IS256_162	807004	808297	17	19	1	0	0		1	2.2e-147	c
HKCAJAIO_1	IS256	IS256_162	813153	814446	17	19	1	0	0		1	2.2e-147	c
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	824263	825157	22	27	0	824259	825129	+	871	2e-47	c
HKCAJAIO_1	IS256	IS256_162	859450	860743	17	19	1	0	0		1	2.2e-147	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	866942	868328	10	11	0	0	0		1	2.2e-47	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	983856	985268	19	25	0	0	0		1	2.2e-47	c
HKCAJAIO_1	IS982	IS982_260	994675	995683	22	25	0	994698	995588	-	891	2.4e-203	c
HKCAJAIO_1	IS256	IS256_162	1001459	1002752	17	19	1	0	0		1	2.2e-147	c
HKCAJAIO_1	IS200/IS605	IS200/IS605_384	1014518	1015219	0	0	0	0	0		1	1.4e-53	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	1069291	1070706	21	28	0	1069368	1070672	+	1305	1.1e-65	c
HKCAJAIO_1	IS5	IS5_200	1103293	1104521	22	26	0	1103424	1104428	-	1005	1.9e-88	c
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	1114545	1115904	7	7	0	0	0		1	8.5e-63	p
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	1123323	1124733	18	24	0	0	0		1	2.2e-47	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	1147066	1148481	21	28	0	0	0		1	1.1e-65	c
HKCAJAIO_1	IS110	IS110_113	1160142	1161185	14	18	0	1160233	1161222	+	990	3.3e-18	p
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	1188556	1189492	11	11	0	0	0		1	6.6e-18	c
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_469	1251294	1252972	20	27	0	1251427	1252606	+	1180	1.5e-17	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	1258333	1259793	39	48	0	1258382	1259776	-	1395	1.8e-107	c
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	1278041	1278253	0	0	0	1278041	1278253	-	213	4.3e-17	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	1278254	1278442	0	0	0	1278254	1278442	-	189	1.4e-13	p
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	1284377	1285418	11	13	0	1284783	1285275	+	493	3.9e-11	p
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	1316904	1317459	14	21	0	0	0		1	2.2e-47	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	1317516	1318212	6	6	0	0	0		1	2.2e-47	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_206	1320463	1321707	31	39	0	1320520	1321667	+	1148	3.9e-29	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	1324256	1325644	9	10	0	1324236	1324845	-	610	7.8e-63	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_480	1457074	1457364	0	0	0	1457074	1457364	-	291	6.5e-27	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_176	1525691	1527360	26	32	0	0	0		1	3.6e-82	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	1627662	1628598	9	9	0	0	0		1	6.6e-18	p
HKCAJAIO_1	IS3	IS3_61	1630415	1631781	0	0	0	0	0		1	7.8e-63	p
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	1631782	1633192	18	24	0	0	0		1	2.2e-47	c
HKCAJAIO_1	IS200/IS605	IS200/IS605_384	1655433	1656135	0	0	0	1655522	1655960	-	439	1.4e-53	c
HKCAJAIO_1	ISL3	ISL3_126	1657172	1658587	21	28	0	1657249	1658553	+	1305	1.1e-65	c
HKCAJAIO_1	IS30	IS30_173	1731312	1732429	20	30	0	1731695	1732443	+	749	3.3e-57	c
HKCAJAIO_1	IS256	IS256_162	1743496	1744790	17	19	1	1743576	1744751	+	1176	2.2e-147	c
HKCAJAIO_1	IS30	IS30_173	1748372	1749436	11	13	0	0	0		1	3.3e-57	c
HKCAJAIO_1	IS256	IS256_162	1773315	1774598	17	19	1	0	0		1	2.2e-147	c
HKCAJAIO_1	IS256	IS256_162	1810894	1812187	17	19	1	0	0		1	2.2e-147	c
