GCA_003346235.1 - 4 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaHEGBPLAD_98 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_98)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 76.1	T3PKS	1	24,682

gnlProkkaHEGBPLAD_100 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_100)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 78.1	RiPP-like	1	7,281

gnlProkkaHEGBPLAD_133 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_133)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 111.1	terpene	2,015	15,881

gnlProkkaHEGBPLAD_144 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_144)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 122.1	cyclic-lactone-autoinducer	1	11,584

Region	Type	From	To	Similarity
Region 76.1	T3PKS	1	24,682
Region 78.1	RiPP-like	1	7,281
Region 111.1	terpene	2,015	15,881
Region 122.1	cyclic-lactone-autoinducer	1	11,584

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaHEGBPLAD_1 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_1); gnlProkkaHEGBPLAD_2 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_2); gnlProkkaHEGBPLAD_3 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_3); gnlProkkaHEGBPLAD_4 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_4); gnlProkkaHEGBPLAD_5 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_5); gnlProkkaHEGBPLAD_6 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_6); gnlProkkaHEGBPLAD_7 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_7); gnlProkkaHEGBPLAD_8 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_8); gnlProkkaHEGBPLAD_9 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_9); gnlProkkaHEGBPLAD_10 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_10); gnlProkkaHEGBPLAD_11 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_11); gnlProkkaHEGBPLAD_12 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_12); gnlProkkaHEGBPLAD_13 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_13); gnlProkkaHEGBPLAD_14 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_14); gnlProkkaHEGBPLAD_15 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_15); gnlProkkaHEGBPLAD_16 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_16); gnlProkkaHEGBPLAD_17 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_17); gnlProkkaHEGBPLAD_18 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_18); gnlProkkaHEGBPLAD_19 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_19); gnlProkkaHEGBPLAD_20 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_20); gnlProkkaHEGBPLAD_21 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_21); gnlProkkaHEGBPLAD_22 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_22); gnlProkkaHEGBPLAD_23 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_23); gnlProkkaHEGBPLAD_24 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_24); gnlProkkaHEGBPLAD_25 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_25); gnlProkkaHEGBPLAD_26 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_26); gnlProkkaHEGBPLAD_27 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_27); gnlProkkaHEGBPLAD_28 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_28); gnlProkkaHEGBPLAD_29 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_29); gnlProkkaHEGBPLAD_30 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_30); gnlProkkaHEGBPLAD_31 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_31); gnlProkkaHEGBPLAD_32 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_32); gnlProkkaHEGBPLAD_33 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_33); gnlProkkaHEGBPLAD_34 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_34); gnlProkkaHEGBPLAD_35 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_35); gnlProkkaHEGBPLAD_36 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_36); gnlProkkaHEGBPLAD_37 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_37); gnlProkkaHEGBPLAD_38 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_38); gnlProkkaHEGBPLAD_39 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_39); gnlProkkaHEGBPLAD_40 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_40); gnlProkkaHEGBPLAD_41 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_41); gnlProkkaHEGBPLAD_42 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_42); gnlProkkaHEGBPLAD_43 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_43); gnlProkkaHEGBPLAD_44 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_44); gnlProkkaHEGBPLAD_45 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_45); gnlProkkaHEGBPLAD_46 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_46); gnlProkkaHEGBPLAD_47 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_47); gnlProkkaHEGBPLAD_48 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_48); gnlProkkaHEGBPLAD_49 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_49); gnlProkkaHEGBPLAD_50 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_50); gnlProkkaHEGBPLAD_51 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_51); gnlProkkaHEGBPLAD_52 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_52); gnlProkkaHEGBPLAD_53 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_53); gnlProkkaHEGBPLAD_54 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_54); gnlProkkaHEGBPLAD_55 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_55); gnlProkkaHEGBPLAD_56 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_56); gnlProkkaHEGBPLAD_57 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_57); gnlProkkaHEGBPLAD_58 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_58); gnlProkkaHEGBPLAD_59 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_59); gnlProkkaHEGBPLAD_60 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_60); gnlProkkaHEGBPLAD_61 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_61); gnlProkkaHEGBPLAD_62 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_62); gnlProkkaHEGBPLAD_66 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_66); gnlProkkaHEGBPLAD_77 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_77); gnlProkkaHEGBPLAD_87 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_87); gnlProkkaHEGBPLAD_88 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_88); gnlProkkaHEGBPLAD_89 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_89); gnlProkkaHEGBPLAD_90 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_90); gnlProkkaHEGBPLAD_91 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_91); gnlProkkaHEGBPLAD_92 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_92); gnlProkkaHEGBPLAD_93 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_93); gnlProkkaHEGBPLAD_94 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_94); gnlProkkaHEGBPLAD_95 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_95); gnlProkkaHEGBPLAD_96 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_96); gnlProkkaHEGBPLAD_97 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_97); gnlProkkaHEGBPLAD_99 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_99); gnlProkkaHEGBPLAD_101 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_101); gnlProkkaHEGBPLAD_102 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_102); gnlProkkaHEGBPLAD_103 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_103); gnlProkkaHEGBPLAD_104 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_104); gnlProkkaHEGBPLAD_105 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_105); gnlProkkaHEGBPLAD_106 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_106); gnlProkkaHEGBPLAD_107 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_107); gnlProkkaHEGBPLAD_108 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_108); gnlProkkaHEGBPLAD_109 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_109); gnlProkkaHEGBPLAD_110 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_110); gnlProkkaHEGBPLAD_111 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_111); gnlProkkaHEGBPLAD_112 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_112); gnlProkkaHEGBPLAD_113 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_113); gnlProkkaHEGBPLAD_114 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_114); gnlProkkaHEGBPLAD_115 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_115); gnlProkkaHEGBPLAD_116 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_116); gnlProkkaHEGBPLAD_117 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_117); gnlProkkaHEGBPLAD_118 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_118); gnlProkkaHEGBPLAD_119 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_119); gnlProkkaHEGBPLAD_120 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_120); gnlProkkaHEGBPLAD_121 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_121); gnlProkkaHEGBPLAD_122 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_122); gnlProkkaHEGBPLAD_123 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_123); gnlProkkaHEGBPLAD_124 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_124); gnlProkkaHEGBPLAD_125 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_125); gnlProkkaHEGBPLAD_126 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_126); gnlProkkaHEGBPLAD_127 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_127); gnlProkkaHEGBPLAD_128 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_128); gnlProkkaHEGBPLAD_129 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_129); gnlProkkaHEGBPLAD_130 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_130); gnlProkkaHEGBPLAD_131 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_131); gnlProkkaHEGBPLAD_132 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_132); gnlProkkaHEGBPLAD_134 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_134); gnlProkkaHEGBPLAD_135 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_135); gnlProkkaHEGBPLAD_136 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_136); gnlProkkaHEGBPLAD_137 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_137); gnlProkkaHEGBPLAD_138 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_138); gnlProkkaHEGBPLAD_139 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_139); gnlProkkaHEGBPLAD_140 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_140); gnlProkkaHEGBPLAD_141 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_141); gnlProkkaHEGBPLAD_142 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_142); gnlProkkaHEGBPLAD_143 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_143); gnlProkkaHEGBPLAD_145 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_145); gnlProkkaHEGBPLAD_146 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_146); gnlProkkaHEGBPLAD_147 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_147); gnlProkkaHEGBPLAD_148 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_148); gnlProkkaHEGBPLAD_149 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_149); gnlProkkaHEGBPLAD_150 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_150); gnlProkkaHEGBPLAD_151 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_151); gnlProkkaHEGBPLAD_152 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_152); gnlProkkaHEGBPLAD_153 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_153); gnlProkkaHEGBPLAD_154 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_154); gnlProkkaHEGBPLAD_155 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_155); gnlProkkaHEGBPLAD_156 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_156); gnlProkkaHEGBPLAD_157 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_157); gnlProkkaHEGBPLAD_158 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_158); gnlProkkaHEGBPLAD_159 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_159); gnlProkkaHEGBPLAD_160 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_160); gnlProkkaHEGBPLAD_161 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_161); gnlProkkaHEGBPLAD_162 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_162); gnlProkkaHEGBPLAD_163 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_163); gnlProkkaHEGBPLAD_164 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_164); gnlProkkaHEGBPLAD_165 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_165); gnlProkkaHEGBPLAD_166 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_166); gnlProkkaHEGBPLAD_167 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_167); gnlProkkaHEGBPLAD_168 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_168); gnlProkkaHEGBPLAD_169 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_169); gnlProkkaHEGBPLAD_170 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_170); gnlProkkaHEGBPLAD_171 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_171); gnlProkkaHEGBPLAD_172 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_172); gnlProkkaHEGBPLAD_173 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_173); gnlProkkaHEGBPLAD_174 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_174); gnlProkkaHEGBPLAD_175 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_175); gnlProkkaHEGBPLAD_176 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_176); gnlProkkaHEGBPLAD_177 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_177); gnlProkkaHEGBPLAD_178 (original name was: gnl|Prokka|HEGBPLAD_178)

Compact view

gnlProkkaHEGBPLAD_98 - Region 1 - T3PKS

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 24,682 nt. (total: 24,682 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

T3PKS: (Chal_sti_synt_C or Chal_sti_synt_N)

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.

gnlProkkaHEGBPLAD_100 - Region 1 - RiPP-like

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 7,281 nt. (total: 7,281 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

RiPP-like: (strepbact or Antimicrobial14 or Bacteriocin_IId or BacteriocIIc_cy or Bacteriocin_II or Bacteriocin_IIi or Lactococcin or Antimicrobial17 or Lactococcin_972 or Bacteriocin_IIc or LcnG-beta or Cloacin or Linocin_M18 or TIGR03651 or TIGR03693 or TIGR03601 or TIGR03795 or TIGR03975 or DUF692 or TIGR01193 or (YcaO or TIGR03604))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.

gnlProkkaHEGBPLAD_133 - Region 1 - terpene

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 2,015 - 15,881 nt. (total: 13,867 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

terpene: (Terpene_synth or Terpene_synth_C or phytoene_synt or Lycopene_cycl or terpene_cyclase or NapT7 or fung_ggpps or fung_ggpps2 or trichodiene_synth or TRI5)

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.

gnlProkkaHEGBPLAD_144 - Region 1 - cyclic-lactone-autoinducer

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 11,584 nt. (total: 11,584 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

cyclic-lactone-autoinducer: (TIGR04223 or AgrB)

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.