GCA_008694845.1 - 2 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaIMMEKCJJ_7 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_7)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 7.1	RiPP-like	41,841	49,932

gnlProkkaIMMEKCJJ_11 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_11)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 11.1	RiPP-like	216,473	222,746

Region	Type	From	To	Most similar known cluster	Similarity
Region 7.1	RiPP-like	41,841	49,932
Region 11.1	RiPP-like	216,473	222,746

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaIMMEKCJJ_1 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_1); gnlProkkaIMMEKCJJ_2 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_2); gnlProkkaIMMEKCJJ_3 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_3); gnlProkkaIMMEKCJJ_4 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_4); gnlProkkaIMMEKCJJ_5 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_5); gnlProkkaIMMEKCJJ_6 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_6); gnlProkkaIMMEKCJJ_8 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_8); gnlProkkaIMMEKCJJ_9 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_9); gnlProkkaIMMEKCJJ_10 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_10); gnlProkkaIMMEKCJJ_12 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_12); gnlProkkaIMMEKCJJ_13 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_13); gnlProkkaIMMEKCJJ_14 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_14); gnlProkkaIMMEKCJJ_15 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_15); gnlProkkaIMMEKCJJ_16 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_16); gnlProkkaIMMEKCJJ_17 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_17); gnlProkkaIMMEKCJJ_18 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_18); gnlProkkaIMMEKCJJ_19 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_19); gnlProkkaIMMEKCJJ_20 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_20); gnlProkkaIMMEKCJJ_21 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_21); gnlProkkaIMMEKCJJ_22 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_22); gnlProkkaIMMEKCJJ_23 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_23); gnlProkkaIMMEKCJJ_24 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_24); gnlProkkaIMMEKCJJ_25 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_25); gnlProkkaIMMEKCJJ_26 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_26); gnlProkkaIMMEKCJJ_27 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_27); gnlProkkaIMMEKCJJ_28 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_28); gnlProkkaIMMEKCJJ_29 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_29); gnlProkkaIMMEKCJJ_30 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_30); gnlProkkaIMMEKCJJ_31 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_31); gnlProkkaIMMEKCJJ_32 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_32); gnlProkkaIMMEKCJJ_33 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_33); gnlProkkaIMMEKCJJ_34 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_34); gnlProkkaIMMEKCJJ_35 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_35); gnlProkkaIMMEKCJJ_36 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_36); gnlProkkaIMMEKCJJ_37 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_37); gnlProkkaIMMEKCJJ_38 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_38); gnlProkkaIMMEKCJJ_39 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_39); gnlProkkaIMMEKCJJ_40 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_40); gnlProkkaIMMEKCJJ_41 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_41); gnlProkkaIMMEKCJJ_42 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_42); gnlProkkaIMMEKCJJ_44 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_44); gnlProkkaIMMEKCJJ_55 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_55); gnlProkkaIMMEKCJJ_66 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_66); gnlProkkaIMMEKCJJ_68 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_68); gnlProkkaIMMEKCJJ_69 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_69); gnlProkkaIMMEKCJJ_70 (original name was: gnl|Prokka|IMMEKCJJ_70)

Compact view

gnlProkkaIMMEKCJJ_7 - Region 1 - RiPP-like

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 41,841 - 49,932 nt. (total: 8,092 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

RiPP-like: (strepbact or Antimicrobial14 or Bacteriocin_IId or BacteriocIIc_cy or Bacteriocin_II or Bacteriocin_IIi or Lactococcin or Antimicrobial17 or Lactococcin_972 or Bacteriocin_IIc or LcnG-beta or Cloacin or Linocin_M18 or TIGR03651 or TIGR03693 or TIGR03601 or TIGR03795 or TIGR03975 or DUF692 or TIGR01193 or (YcaO or TIGR03604))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.

gnlProkkaIMMEKCJJ_11 - Region 1 - RiPP-like