GCA_010363715.1 - 1 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaEKBLOECO_288 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_288)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 71.1	RiPP-like	1	8,536

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaEKBLOECO_1 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_1); gnlProkkaEKBLOECO_2 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_2); gnlProkkaEKBLOECO_3 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_3); gnlProkkaEKBLOECO_4 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_4); gnlProkkaEKBLOECO_5 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_5); gnlProkkaEKBLOECO_6 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_6); gnlProkkaEKBLOECO_7 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_7); gnlProkkaEKBLOECO_8 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_8); gnlProkkaEKBLOECO_9 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_9); gnlProkkaEKBLOECO_10 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_10); gnlProkkaEKBLOECO_11 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_11); gnlProkkaEKBLOECO_12 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_12); gnlProkkaEKBLOECO_13 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_13); gnlProkkaEKBLOECO_14 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_14); gnlProkkaEKBLOECO_15 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_15); gnlProkkaEKBLOECO_16 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_16); gnlProkkaEKBLOECO_17 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_17); gnlProkkaEKBLOECO_18 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_18); gnlProkkaEKBLOECO_19 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_19); gnlProkkaEKBLOECO_20 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_20); gnlProkkaEKBLOECO_21 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_21); gnlProkkaEKBLOECO_22 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_22); gnlProkkaEKBLOECO_23 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_23); gnlProkkaEKBLOECO_24 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_24); gnlProkkaEKBLOECO_25 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_25); gnlProkkaEKBLOECO_26 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_26); gnlProkkaEKBLOECO_27 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_27); gnlProkkaEKBLOECO_28 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_28); gnlProkkaEKBLOECO_29 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_29); gnlProkkaEKBLOECO_30 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_30); gnlProkkaEKBLOECO_31 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_31); gnlProkkaEKBLOECO_32 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_32); gnlProkkaEKBLOECO_33 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_33); gnlProkkaEKBLOECO_34 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_34); gnlProkkaEKBLOECO_35 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_35); gnlProkkaEKBLOECO_36 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_36); gnlProkkaEKBLOECO_37 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_37); gnlProkkaEKBLOECO_44 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_44); gnlProkkaEKBLOECO_55 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_55); gnlProkkaEKBLOECO_66 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_66); gnlProkkaEKBLOECO_77 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_77); gnlProkkaEKBLOECO_87 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_87); gnlProkkaEKBLOECO_97 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_97); gnlProkkaEKBLOECO_107 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_107); gnlProkkaEKBLOECO_108 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_108); gnlProkkaEKBLOECO_116 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_116); gnlProkkaEKBLOECO_125 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_125); gnlProkkaEKBLOECO_133 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_133); gnlProkkaEKBLOECO_142 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_142); gnlProkkaEKBLOECO_152 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_152); gnlProkkaEKBLOECO_160 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_160); gnlProkkaEKBLOECO_168 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_168); gnlProkkaEKBLOECO_176 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_176); gnlProkkaEKBLOECO_183 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_183); gnlProkkaEKBLOECO_192 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_192); gnlProkkaEKBLOECO_193 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_193); gnlProkkaEKBLOECO_200 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_200); gnlProkkaEKBLOECO_206 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_206); gnlProkkaEKBLOECO_213 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_213); gnlProkkaEKBLOECO_220 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_220); gnlProkkaEKBLOECO_226 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_226); gnlProkkaEKBLOECO_234 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_234); gnlProkkaEKBLOECO_240 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_240); gnlProkkaEKBLOECO_247 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_247); gnlProkkaEKBLOECO_255 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_255); gnlProkkaEKBLOECO_263 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_263); gnlProkkaEKBLOECO_264 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_264); gnlProkkaEKBLOECO_270 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_270); gnlProkkaEKBLOECO_278 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_278); gnlProkkaEKBLOECO_284 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_284); gnlProkkaEKBLOECO_299 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_299); gnlProkkaEKBLOECO_307 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_307); gnlProkkaEKBLOECO_314 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_314); gnlProkkaEKBLOECO_321 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_321); gnlProkkaEKBLOECO_329 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_329); gnlProkkaEKBLOECO_337 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_337); gnlProkkaEKBLOECO_338 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_338); gnlProkkaEKBLOECO_345 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_345); gnlProkkaEKBLOECO_351 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_351); gnlProkkaEKBLOECO_362 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_362); gnlProkkaEKBLOECO_370 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_370); gnlProkkaEKBLOECO_380 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_380); gnlProkkaEKBLOECO_383 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_383); gnlProkkaEKBLOECO_384 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_384); gnlProkkaEKBLOECO_385 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_385); gnlProkkaEKBLOECO_386 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_386); gnlProkkaEKBLOECO_387 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_387); gnlProkkaEKBLOECO_388 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_388); gnlProkkaEKBLOECO_389 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_389); gnlProkkaEKBLOECO_390 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_390); gnlProkkaEKBLOECO_391 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_391); gnlProkkaEKBLOECO_392 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_392); gnlProkkaEKBLOECO_393 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_393); gnlProkkaEKBLOECO_394 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_394); gnlProkkaEKBLOECO_395 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_395); gnlProkkaEKBLOECO_396 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_396); gnlProkkaEKBLOECO_397 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_397); gnlProkkaEKBLOECO_398 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_398); gnlProkkaEKBLOECO_399 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_399); gnlProkkaEKBLOECO_400 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_400); gnlProkkaEKBLOECO_401 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_401); gnlProkkaEKBLOECO_402 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_402); gnlProkkaEKBLOECO_403 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_403); gnlProkkaEKBLOECO_404 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_404); gnlProkkaEKBLOECO_405 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_405); gnlProkkaEKBLOECO_406 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_406); gnlProkkaEKBLOECO_407 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_407); gnlProkkaEKBLOECO_408 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_408); gnlProkkaEKBLOECO_409 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_409); gnlProkkaEKBLOECO_410 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_410); gnlProkkaEKBLOECO_411 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_411); gnlProkkaEKBLOECO_412 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_412); gnlProkkaEKBLOECO_413 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_413); gnlProkkaEKBLOECO_414 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_414); gnlProkkaEKBLOECO_415 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_415); gnlProkkaEKBLOECO_416 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_416); gnlProkkaEKBLOECO_417 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_417); gnlProkkaEKBLOECO_418 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_418); gnlProkkaEKBLOECO_419 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_419); gnlProkkaEKBLOECO_420 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_420); gnlProkkaEKBLOECO_421 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_421); gnlProkkaEKBLOECO_422 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_422); gnlProkkaEKBLOECO_423 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_423); gnlProkkaEKBLOECO_424 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_424); gnlProkkaEKBLOECO_425 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_425); gnlProkkaEKBLOECO_426 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_426); gnlProkkaEKBLOECO_427 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_427); gnlProkkaEKBLOECO_428 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_428); gnlProkkaEKBLOECO_429 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_429); gnlProkkaEKBLOECO_430 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_430); gnlProkkaEKBLOECO_431 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_431); gnlProkkaEKBLOECO_432 (original name was: gnl|Prokka|EKBLOECO_432)

Compact view

gnlProkkaEKBLOECO_288 - Region 1 - RiPP-like

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 8,536 nt. (total: 8,536 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

RiPP-like: (strepbact or Antimicrobial14 or Bacteriocin_IId or BacteriocIIc_cy or Bacteriocin_II or Bacteriocin_IIi or Lactococcin or Antimicrobial17 or Lactococcin_972 or Bacteriocin_IIc or LcnG-beta or Cloacin or Linocin_M18 or TIGR03651 or TIGR03693 or TIGR03601 or TIGR03795 or TIGR03975 or DUF692 or TIGR01193 or (YcaO or TIGR03604))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.