QueryID	Family	Cluster	IsBegin	IsEnd	IrId	IrLen	Ngaps	OrfBegin	OrfEnd	Strand	OrfLen	Evalue	Type
BACJIHHB_1	IS21	IS21_259	54	1820	15	17	0	2	1399	+	1398	5.8e-13	p
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	10145	11481	13	18	0	0	0		1	4.9e-55	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	13498	14869	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	15656	16956	35	54	1	15865	16801	-	937	5.5e-13	p
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	22604	24023	9	10	0	0	0		1	5e-56	p
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	26636	28475	35	43	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS30	IS30_173	51363	52555	25	31	0	0	0		1	2e-24	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	93502	95339	30	39	0	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_168	108810	110014	13	14	0	108899	109529	-	631	3.2e-22	p
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	115073	116499	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	129268	130734	22	25	0	129313	130707	+	1395	2.1e-95	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	144939	146359	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	146547	147103	8	9	0	0	0		1	4.9e-55	p
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	156998	158429	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	225267	226258	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	243446	244872	0	0	0	243547	244776	+	1230	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	247828	249254	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	251271	252701	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	252733	254820	24	36	0	252830	254505	+	1676	3.4e-58	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	254685	256056	24	24	0	254816	255994	+	1179	7.5e-145	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	258473	259900	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	278263	279729	22	25	0	278308	279702	+	1395	2.1e-95	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	294142	295618	20	26	0	0	0		1	2e-84	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	317911	319344	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	325626	327055	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	333236	334201	32	35	0	0	0		1	1.1e-56	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	334330	335755	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	349663	351094	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	351148	352318	9	11	0	0	0		1	4.9e-55	p
BACJIHHB_1	IS5	IS5_435	352318	353175	17	17	0	0	0		1	1e-14	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	372925	374356	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	378490	380327	32	39	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	382315	384148	35	45	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	407971	408936	24	24	0	0	0		1	1.1e-56	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	412663	414009	13	18	0	0	0		1	4.9e-55	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	432110	433576	22	25	0	432155	433549	+	1395	2.1e-95	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	439309	440275	27	29	0	0	0		1	1e-50	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	469792	471165	21	25	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	484807	486176	20	24	0	484937	486115	+	1179	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS66	IS66_393	489593	490793	23	32	1	489837	490501	-	665	9.8e-11	p
BACJIHHB_1	IS5	IS5_435	493152	494009	16	17	0	0	0		1	1e-14	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	496764	498183	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	500183	501614	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	511687	513526	31	40	0	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	new	new_329	523652	525947	16	21	0	0	0		1	4.8e-42	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	526278	527242	27	28	0	0	0		1	1e-50	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	533274	533981	9	12	0	0	0		1	2.4e-89	p
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	534176	534649	11	14	0	0	0		1	2.4e-89	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	544742	546100	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	556919	558489	123	215	3	557047	557993	-	947	4e-33	p
BACJIHHB_1	IS21	IS21_288	564862	566089	19	26	0	564859	565822	+	964	7.7e-13	p
BACJIHHB_1	IS30	IS30_173	569290	571082	19	24	1	569632	570726	+	1095	7.7e-16	p
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	591950	593415	22	25	0	0	0		1	2.1e-95	c
BACJIHHB_1	IS5	IS5_435	602524	603386	19	20	0	602564	603226	+	663	1e-14	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	608796	611253	7	8	0	608794	611296	-	2503	2e-84	p
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	614327	615292	26	28	0	0	0		1	1e-50	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	616475	618319	35	42	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS66	IS66_393	623837	626098	26	26	0	624146	624439	+	294	6.5e-30	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	626101	627234	7	9	0	0	0		1	2.4e-89	p
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	644396	645768	6	6	0	0	0		1	5e-56	p
BACJIHHB_1	IS66	IS66_393	645801	648062	26	26	0	0	0		1	6.5e-30	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	656763	658194	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	667300	668671	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	673465	674434	33	36	0	0	0		1	1.1e-56	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	681419	682790	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	684346	685662	8	10	0	0	0		1	1.6e-53	p
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	700771	701734	27	28	0	0	0		1	1e-50	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	712166	712961	44	49	1	712190	712810	-	621	1.2e-34	p
BACJIHHB_1	IS30	IS30_223	734671	735844	20	25	0	0	0		1	1.8e-75	c
BACJIHHB_1	IS30	IS30_223	776278	777447	21	28	0	776378	777412	+	1035	3.4e-96	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	786430	787583	9	12	0	0	0		1	5e-56	p
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	787620	788991	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	789984	791405	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	838159	839584	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS30	IS30_173	844595	845783	23	29	0	0	0		1	2e-24	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_164	866932	868389	0	0	0	0	0		1	6.6e-161	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	868633	869616	28	29	0	0	0		1	1e-50	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	915983	917354	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	919928	920791	51	66	1	919968	920666	-	699	2.6e-20	p
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	941145	942516	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_168	943900	945707	21	25	0	943947	945651	-	1705	3.9e-56	c
BACJIHHB_1	IS5	IS5_435	961880	962724	19	21	0	0	0		1	1e-14	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	965389	966690	25	29	0	0	0		1	2.4e-89	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	966723	967596	35	41	0	966746	967423	-	678	2e-22	p
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	971055	972244	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS30	IS30_223	990848	992027	21	25	0	0	0		1	1.8e-75	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	992053	993319	17	21	0	0	0		1	4.8e-115	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_132	994730	995221	0	0	0	994730	995221	-	492	1e-25	p
BACJIHHB_1	IS5	IS5_435	998699	999541	16	17	0	0	0		1	1e-14	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1029846	1031236	10	14	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1032598	1034001	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS110	IS110_139	1033981	1035423	18	24	1	1034111	1035313	-	1203	5.4e-20	p
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1035913	1037241	20	24	0	0	0		1	4.8e-115	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	1048008	1049312	25	29	0	1048035	1049270	-	1236	2.4e-89	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1054252	1055673	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1073278	1075117	35	43	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS30	IS30_173	1083366	1084438	18	22	0	1083805	1084524	+	720	2.4e-29	p
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1100318	1102157	31	40	0	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1144938	1146309	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1146396	1147821	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1155940	1157306	19	21	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1185522	1186953	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1191577	1192950	21	25	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1194668	1196507	31	40	0	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_164	1203695	1205151	0	0	0	1203829	1205070	-	1242	6.6e-161	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1205182	1206643	18	25	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1209890	1211729	34	43	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1216626	1218462	33	42	2	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1223545	1225378	32	40	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	1225584	1226548	27	28	0	0	0		1	1e-50	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1241966	1243803	34	42	1	1242111	1243749	+	1639	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1299665	1301091	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1301465	1302790	0	0	0	1301465	1302790	-	1326	8.1e-86	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1306012	1307386	45	63	3	1306074	1307302	-	1229	2.9e-107	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	1312392	1313358	27	29	0	1312490	1313347	+	858	1e-50	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1314598	1315962	16	20	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	1319689	1320655	27	29	0	0	0		1	1e-50	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1321488	1322859	20	24	0	0	0		1	4.8e-115	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	1322991	1325661	14	17	0	1323141	1325675	-	2535	4.2e-90	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1328439	1329802	18	20	0	1328498	1329427	-	930	4.8e-115	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1330294	1333236	17	19	1	1330740	1332881	-	2142	9.4e-29	p
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	1334113	1334586	11	14	0	0	0		1	2.4e-89	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	1334781	1335503	8	9	0	0	0		1	2.4e-89	p
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1369541	1370966	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1384826	1386243	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1421866	1423711	35	43	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1426135	1427978	37	45	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1473723	1475154	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1482635	1484480	36	43	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	1496410	1497233	35	40	0	1496509	1497192	+	684	4.2e-20	p
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_132	1501616	1502818	0	0	0	0	0		1	3.3e-58	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	1502850	1504316	22	25	0	1502877	1504271	-	1395	2.1e-95	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	1515080	1516546	22	25	0	1515107	1516501	-	1395	2.1e-95	c
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	1519093	1520559	22	25	0	1519138	1520532	+	1395	2.1e-95	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	1536182	1537074	31	35	0	1536218	1536979	-	762	9.3e-52	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1538384	1539804	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1551313	1552713	8	9	0	0	0		1	4.9e-55	p
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_132	1556892	1558263	0	0	0	1556892	1558121	-	1230	3.3e-58	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1576413	1577830	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	new	new_329	1579169	1581464	16	21	0	0	0		1	4.8e-42	c
BACJIHHB_1	IS30	IS30_223	1584258	1585358	0	0	0	1584258	1585310	-	1053	2.9e-75	p
BACJIHHB_1	IS30	IS30_223	1589276	1590286	16	20	1	0	0		1	2.9e-75	p
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_164	1613090	1614331	0	0	0	1613090	1614331	-	1242	1.4e-155	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1618924	1620083	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS30	IS30_173	1625413	1626654	52	82	1	1625571	1626575	+	1005	1.1e-55	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1634149	1635992	37	45	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_164	1636120	1637577	0	0	0	0	0		1	6.6e-161	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1639439	1640866	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1641335	1642704	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1645684	1647104	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_164	1700878	1702163	0	0	0	0	0		1	6.6e-161	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1712849	1714268	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1718158	1719586	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	1728255	1728961	26	28	0	1728265	1728810	-	546	1.3e-18	p
BACJIHHB_1	IS30	IS30_173	1735213	1736388	20	24	0	1735312	1736360	+	1049	2e-24	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1738157	1739526	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS30	IS30_223	1739595	1740753	20	24	0	1739682	1740731	+	1050	1.8e-75	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	1742504	1743459	27	28	0	1742598	1743449	+	852	1.1e-56	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	1756208	1757173	32	35	0	0	0		1	1.1e-56	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1757207	1758402	10	14	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1758925	1760296	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1767751	1769175	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_164	1770445	1771902	0	0	0	0	0		1	6.6e-161	c
BACJIHHB_1	new	new_329	1814961	1817256	15	21	0	0	0		1	4.8e-42	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1824860	1825256	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	p
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	1832391	1833424	22	31	0	1832517	1833146	+	630	1.8e-40	p
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1835683	1837052	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS1182	IS1182_42	1840958	1842797	35	43	1	0	0		1	2.8e-153	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1851718	1853088	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS30	IS30_223	1858320	1859223	16	17	0	1858348	1859171	-	824	1.6e-46	p
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1861089	1862520	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1877062	1878433	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1881458	1882917	23	31	0	1881598	1882838	+	1241	3.6e-17	p
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1883943	1885365	10	10	0	1883972	1885236	-	1265	5e-56	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1889682	1891194	16	25	0	1889844	1891070	-	1227	1.4e-43	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_164	1892548	1892706	0	0	0	1892548	1892706	+	159	5.1e-15	p
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1904196	1905629	10	10	0	0	0		1	5e-56	c
BACJIHHB_1	ISL3	ISL3_126	1907627	1909122	17	25	0	0	0		1	1.4e-43	c
BACJIHHB_1	IS30	IS30_297	1911484	1912926	17	20	1	1911576	1912908	+	1333	5.9e-96	p
BACJIHHB_1	IS30	IS30_297	1916960	1918317	17	22	0	1917187	1917920	+	734	5.3e-56	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1918433	1919802	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS6	IS6_292	1920162	1920395	0	0	0	1920162	1920395	-	234	7.1e-25	p
BACJIHHB_1	IS3	IS3_359	1922017	1922879	14	16	0	1922205	1922555	+	351	4.3e-11	p
BACJIHHB_1	IS3	IS3_61	1936875	1938341	22	25	0	1936902	1938296	-	1395	2.1e-95	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1941581	1942952	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1949364	1950735	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1955990	1957361	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS982	IS982_260	1978606	1979570	26	28	0	1978616	1979473	-	858	1e-50	c
BACJIHHB_1	IS256	IS256_162	1988192	1989563	20	24	0	0	0		1	2.2e-145	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	1991834	1993259	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	2009097	2010524	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c
BACJIHHB_1	IS200/IS605	IS200/IS605_96	2016016	2017444	0	0	0	0	0		1	2.7e-118	c