GCA_027152805.1 - 2 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaABCOJIHK_76 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_76)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 63.1	RiPP-like	1	6,685	gassericin T	RiPP	33%

gnlProkkaABCOJIHK_107 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_107)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 86.1	RiPP-like	1	9,053	gassericin T	RiPP	22%

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaABCOJIHK_1 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_1); gnlProkkaABCOJIHK_2 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_2); gnlProkkaABCOJIHK_3 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_3); gnlProkkaABCOJIHK_4 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_4); gnlProkkaABCOJIHK_5 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_5); gnlProkkaABCOJIHK_6 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_6); gnlProkkaABCOJIHK_7 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_7); gnlProkkaABCOJIHK_9 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_9); gnlProkkaABCOJIHK_10 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_10); gnlProkkaABCOJIHK_11 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_11); gnlProkkaABCOJIHK_12 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_12); gnlProkkaABCOJIHK_13 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_13); gnlProkkaABCOJIHK_14 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_14); gnlProkkaABCOJIHK_15 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_15); gnlProkkaABCOJIHK_16 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_16); gnlProkkaABCOJIHK_17 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_17); gnlProkkaABCOJIHK_18 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_18); gnlProkkaABCOJIHK_19 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_19); gnlProkkaABCOJIHK_20 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_20); gnlProkkaABCOJIHK_21 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_21); gnlProkkaABCOJIHK_22 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_22); gnlProkkaABCOJIHK_24 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_24); gnlProkkaABCOJIHK_25 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_25); gnlProkkaABCOJIHK_26 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_26); gnlProkkaABCOJIHK_27 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_27); gnlProkkaABCOJIHK_28 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_28); gnlProkkaABCOJIHK_30 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_30); gnlProkkaABCOJIHK_31 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_31); gnlProkkaABCOJIHK_32 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_32); gnlProkkaABCOJIHK_33 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_33); gnlProkkaABCOJIHK_35 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_35); gnlProkkaABCOJIHK_37 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_37); gnlProkkaABCOJIHK_39 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_39); gnlProkkaABCOJIHK_40 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_40); gnlProkkaABCOJIHK_41 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_41); gnlProkkaABCOJIHK_42 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_42); gnlProkkaABCOJIHK_44 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_44); gnlProkkaABCOJIHK_45 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_45); gnlProkkaABCOJIHK_46 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_46); gnlProkkaABCOJIHK_47 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_47); gnlProkkaABCOJIHK_48 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_48); gnlProkkaABCOJIHK_49 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_49); gnlProkkaABCOJIHK_50 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_50); gnlProkkaABCOJIHK_51 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_51); gnlProkkaABCOJIHK_52 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_52); gnlProkkaABCOJIHK_55 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_55); gnlProkkaABCOJIHK_56 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_56); gnlProkkaABCOJIHK_57 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_57); gnlProkkaABCOJIHK_58 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_58); gnlProkkaABCOJIHK_59 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_59); gnlProkkaABCOJIHK_60 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_60); gnlProkkaABCOJIHK_61 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_61); gnlProkkaABCOJIHK_62 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_62); gnlProkkaABCOJIHK_64 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_64); gnlProkkaABCOJIHK_65 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_65); gnlProkkaABCOJIHK_66 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_66); gnlProkkaABCOJIHK_68 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_68); gnlProkkaABCOJIHK_69 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_69); gnlProkkaABCOJIHK_71 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_71); gnlProkkaABCOJIHK_72 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_72); gnlProkkaABCOJIHK_73 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_73); gnlProkkaABCOJIHK_74 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_74); gnlProkkaABCOJIHK_77 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_77); gnlProkkaABCOJIHK_78 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_78); gnlProkkaABCOJIHK_80 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_80); gnlProkkaABCOJIHK_81 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_81); gnlProkkaABCOJIHK_82 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_82); gnlProkkaABCOJIHK_83 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_83); gnlProkkaABCOJIHK_84 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_84); gnlProkkaABCOJIHK_85 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_85); gnlProkkaABCOJIHK_86 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_86); gnlProkkaABCOJIHK_87 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_87); gnlProkkaABCOJIHK_88 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_88); gnlProkkaABCOJIHK_89 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_89); gnlProkkaABCOJIHK_90 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_90); gnlProkkaABCOJIHK_93 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_93); gnlProkkaABCOJIHK_95 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_95); gnlProkkaABCOJIHK_97 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_97); gnlProkkaABCOJIHK_100 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_100); gnlProkkaABCOJIHK_101 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_101); gnlProkkaABCOJIHK_102 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_102); gnlProkkaABCOJIHK_104 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_104); gnlProkkaABCOJIHK_105 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_105); gnlProkkaABCOJIHK_106 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_106); gnlProkkaABCOJIHK_108 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_108); gnlProkkaABCOJIHK_109 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_109); gnlProkkaABCOJIHK_110 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_110); gnlProkkaABCOJIHK_111 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_111); gnlProkkaABCOJIHK_112 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_112); gnlProkkaABCOJIHK_114 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_114); gnlProkkaABCOJIHK_115 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_115); gnlProkkaABCOJIHK_116 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_116); gnlProkkaABCOJIHK_117 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_117); gnlProkkaABCOJIHK_118 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_118); gnlProkkaABCOJIHK_119 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_119); gnlProkkaABCOJIHK_120 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_120); gnlProkkaABCOJIHK_121 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_121); gnlProkkaABCOJIHK_122 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_122); gnlProkkaABCOJIHK_123 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_123); gnlProkkaABCOJIHK_125 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_125); gnlProkkaABCOJIHK_126 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_126); gnlProkkaABCOJIHK_127 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_127); gnlProkkaABCOJIHK_129 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_129); gnlProkkaABCOJIHK_130 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_130); gnlProkkaABCOJIHK_131 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_131); gnlProkkaABCOJIHK_133 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_133); gnlProkkaABCOJIHK_135 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_135); gnlProkkaABCOJIHK_136 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_136); gnlProkkaABCOJIHK_137 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_137); gnlProkkaABCOJIHK_138 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_138); gnlProkkaABCOJIHK_139 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_139); gnlProkkaABCOJIHK_140 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_140); gnlProkkaABCOJIHK_141 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_141); gnlProkkaABCOJIHK_142 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_142); gnlProkkaABCOJIHK_143 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_143); gnlProkkaABCOJIHK_144 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_144); gnlProkkaABCOJIHK_145 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_145); gnlProkkaABCOJIHK_146 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_146); gnlProkkaABCOJIHK_147 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_147); gnlProkkaABCOJIHK_149 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_149); gnlProkkaABCOJIHK_150 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_150); gnlProkkaABCOJIHK_151 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_151); gnlProkkaABCOJIHK_152 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_152); gnlProkkaABCOJIHK_153 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_153); gnlProkkaABCOJIHK_154 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_154); gnlProkkaABCOJIHK_155 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_155); gnlProkkaABCOJIHK_156 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_156); gnlProkkaABCOJIHK_157 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_157); gnlProkkaABCOJIHK_159 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_159); gnlProkkaABCOJIHK_161 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_161); gnlProkkaABCOJIHK_162 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_162); gnlProkkaABCOJIHK_163 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_163); gnlProkkaABCOJIHK_164 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_164); gnlProkkaABCOJIHK_166 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_166); gnlProkkaABCOJIHK_168 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_168); gnlProkkaABCOJIHK_169 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_169); gnlProkkaABCOJIHK_170 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_170); gnlProkkaABCOJIHK_171 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_171); gnlProkkaABCOJIHK_172 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_172); gnlProkkaABCOJIHK_173 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_173); gnlProkkaABCOJIHK_174 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_174); gnlProkkaABCOJIHK_175 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_175); gnlProkkaABCOJIHK_176 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_176); gnlProkkaABCOJIHK_178 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_178); gnlProkkaABCOJIHK_179 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_179); gnlProkkaABCOJIHK_180 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_180); gnlProkkaABCOJIHK_181 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_181); gnlProkkaABCOJIHK_182 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_182); gnlProkkaABCOJIHK_183 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_183); gnlProkkaABCOJIHK_184 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_184); gnlProkkaABCOJIHK_185 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_185); gnlProkkaABCOJIHK_186 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_186); gnlProkkaABCOJIHK_187 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_187); gnlProkkaABCOJIHK_189 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_189); gnlProkkaABCOJIHK_192 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_192); gnlProkkaABCOJIHK_193 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_193); gnlProkkaABCOJIHK_194 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_194); gnlProkkaABCOJIHK_195 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_195); gnlProkkaABCOJIHK_197 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_197); gnlProkkaABCOJIHK_198 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_198); gnlProkkaABCOJIHK_199 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_199); gnlProkkaABCOJIHK_200 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_200); gnlProkkaABCOJIHK_201 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_201); gnlProkkaABCOJIHK_203 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_203); gnlProkkaABCOJIHK_206 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_206); gnlProkkaABCOJIHK_208 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_208); gnlProkkaABCOJIHK_209 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_209); gnlProkkaABCOJIHK_210 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_210); gnlProkkaABCOJIHK_212 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_212); gnlProkkaABCOJIHK_214 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_214); gnlProkkaABCOJIHK_215 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_215); gnlProkkaABCOJIHK_216 (original name was: gnl|Prokka|ABCOJIHK_216)

Compact view

gnlProkkaABCOJIHK_76 - Region 1 - RiPP-like

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 6,685 nt. (total: 6,685 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

RiPP-like: (strepbact or Antimicrobial14 or Bacteriocin_IId or BacteriocIIc_cy or Bacteriocin_II or Bacteriocin_IIi or Lactococcin or Antimicrobial17 or Lactococcin_972 or Bacteriocin_IIc or LcnG-beta or Cloacin or Linocin_M18 or TIGR03651 or TIGR03693 or TIGR03601 or TIGR03795 or TIGR03975 or DUF692 or TIGR01193 or (YcaO or TIGR03604))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

gnlProkkaABCOJIHK_107 - Region 1 - RiPP-like

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 9,053 nt. (total: 9,053 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

RiPP-like: (strepbact or Antimicrobial14 or Bacteriocin_IId or BacteriocIIc_cy or Bacteriocin_II or Bacteriocin_IIi or Lactococcin or Antimicrobial17 or Lactococcin_972 or Bacteriocin_IIc or LcnG-beta or Cloacin or Linocin_M18 or TIGR03651 or TIGR03693 or TIGR03601 or TIGR03795 or TIGR03975 or DUF692 or TIGR01193 or (YcaO or TIGR03604))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1