QueryID	Family	Cluster	IsBegin	IsEnd	IrId	IrLen	Ngaps	OrfBegin	OrfEnd	Strand	OrfLen	Evalue	Type
JCOPJIBP_1	IS3	IS3_61	2	143	0	0	0	2	143	+	142	2.4e-11	p
JCOPJIBP_1	ISL3	ISL3_143	49036	49929	19	27	0	49138	49698	+	561	1.4e-31	p
JCOPJIBP_1	ISL3	ISL3_143	59426	60206	14	20	0	59571	60305	-	735	5.7e-34	p
JCOPJIBP_10	IS3	IS3_61	3	143	0	0	0	3	143	+	141	1.5e-13	p
JCOPJIBP_11	IS30	IS30_173	276144	276392	0	0	0	276144	276392	+	249	7.3e-13	p
JCOPJIBP_12	IS21	IS21_259	152	936	16	23	0	105	890	-	786	1.1e-71	p
JCOPJIBP_12	IS21	IS21_67	659	2423	14	18	0	893	2374	-	1482	2.2e-79	p
JCOPJIBP_14	IS3	IS3_61	1	706	11	13	0	3	833	+	831	2.1e-36	p
JCOPJIBP_17	IS3	IS3_61	127	324	0	0	0	127	324	+	198	2e-28	p
JCOPJIBP_18	IS3	IS3_61	2	253	0	0	0	2	253	+	252	1.2e-34	p
JCOPJIBP_2	IS3	IS3_61	612	950	15	20	0	567	1055	+	489	3.1e-21	p
JCOPJIBP_2	IS3	IS3_61	47583	49011	22	31	0	47995	49040	-	1046	3.7e-32	p
JCOPJIBP_2	ISL3	ISL3_147	49185	49418	0	0	0	49185	49418	+	234	6.8e-22	p
JCOPJIBP_20	IS3	IS3_61	58	252	0	0	0	58	252	-	195	4.8e-12	p
JCOPJIBP_21	IS256	IS256_376	3427	4135	15	18	0	3341	3725	+	385	3.4e-24	p
JCOPJIBP_22	IS30	IS30_173	194121	195317	31	43	0	194203	195309	+	1107	3.1e-91	c
JCOPJIBP_22	IS30	IS30_173	205600	206539	16	19	0	205519	206289	-	771	5.6e-46	p
JCOPJIBP_22	IS21	IS21_259	229232	230721	19	27	1	229370	230836	-	1467	5.1e-14	p
JCOPJIBP_22	IS3	IS3_271	274725	275772	11	13	0	274929	275891	-	963	6.3e-17	p
JCOPJIBP_23	IS21	IS21_67	244235	246176	14	17	0	244239	245892	+	1654	4.6e-68	c
JCOPJIBP_24	IS21	IS21_259	262	2109	12	14	0	130	2040	+	1911	3e-60	p
JCOPJIBP_25	IS3	IS3_61	46	1070	17	24	0	2	780	+	779	1.2e-88	c
JCOPJIBP_25	IS3	IS3_61	72746	75915	12	13	0	73057	76023	-	2967	1e-18	p
JCOPJIBP_25	IS3	IS3_176	114612	115831	19	24	0	114642	115765	-	1124	1.5e-51	c
JCOPJIBP_26	IS3	IS3_61	96732	98156	27	28	1	96779	98125	+	1347	9.9e-41	p
JCOPJIBP_28	ISL3	ISL3_147	4022	4769	23	25	0	4046	4833	-	788	4.4e-25	p
JCOPJIBP_28	IS3	IS3_479	56207	57545	21	25	0	56234	57505	-	1272	1.8e-26	p
JCOPJIBP_3	IS21	IS21_67	6789	9361	73	110	2	7046	9263	-	2218	9.9e-63	c
JCOPJIBP_4	IS481	IS481_228	37	871	15	21	0	59	721	-	663	8.6e-12	p
JCOPJIBP_5	IS21	IS21_288	386	1253	23	32	0	454	1260	+	807	2.2e-52	p
JCOPJIBP_6	IS5	IS5_417	21956	22808	23	28	0	22000	22793	+	794	1.2e-28	p
JCOPJIBP_9	IS21	IS21_35	3200	4492	12	15	0	3119	4410	+	1292	3.3e-102	p