QueryID	Family	Cluster	IsBegin	IsEnd	IrId	IrLen	Ngaps	OrfBegin	OrfEnd	Strand	OrfLen	Evalue	Type
JMKPOLHC_10	IS1182	IS1182_71	25926	27693	14	18	0	25992	27290	-	1299	7e-83	c
JMKPOLHC_10	IS66	IS66_43	30865	33203	23	31	1	31354	33000	-	1647	1e-102	c
JMKPOLHC_10	IS66	IS66_393	32884	34165	36	58	1	33083	33866	-	784	3.5e-20	p
JMKPOLHC_10	IS1380	IS1380_141	57984	59600	21	27	1	58208	59599	+	1392	8.1e-15	p
JMKPOLHC_11	IS3	IS3_168	49195	50439	35	55	1	49664	50269	+	606	3.1e-41	p
JMKPOLHC_13	IS256	IS256_47	100381	100628	0	0	0	100381	100628	-	248	5.4e-19	p
JMKPOLHC_2	IS256	IS256_47	247610	248971	41	51	0	247710	248915	+	1206	3.4e-157	c
JMKPOLHC_33	IS1595	IS1595_235	391428	392547	35	54	1	391832	392374	+	543	6.6e-50	p
JMKPOLHC_44	IS256	IS256_47	138852	140432	7	8	0	139074	140004	-	931	1.9e-99	p
JMKPOLHC_44	IS256	IS256_47	271136	272732	7	8	0	0	0		1	1.9e-99	p
JMKPOLHC_45	IS1595	IS1595_235	668	2345	43	64	2	995	2118	-	1124	2.4e-63	c
JMKPOLHC_49	IS66	IS66_43	19	1164	16	22	0	1	1115	-	1115	1.1e-68	p
JMKPOLHC_49	IS66	IS66_393	1134	1918	16	22	0	1189	1915	-	727	4.9e-24	p
JMKPOLHC_52	IS1380	IS1380_141	1	1594	12	15	0	172	1398	-	1227	4.3e-11	p
JMKPOLHC_53	IS256	IS256_47	7	1461	15	17	0	205	1422	-	1218	6.3e-163	c
JMKPOLHC_54	IS110	IS110_219	230	1108	13	16	0	224	1219	+	996	6e-42	p
JMKPOLHC_55	IS3	IS3_61	380808	380990	0	0	0	380808	380990	+	183	1.6e-20	p
JMKPOLHC_56	ISAS1	ISAS1_192	1	1273	13	16	0	1	1141	-	1141	2e-74	c
JMKPOLHC_57	IS21	IS21_259	149420	151360	11	11	0	149786	151198	+	1413	1.3e-12	p
JMKPOLHC_57	IS66	IS66_43	316349	317301	20	31	0	316823	317356	-	534	5.8e-51	p