GCA_036301345.1 - 1 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaLFAOFDKJ_43 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_43)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 43.1	ranthipeptide	1	8,395

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaLFAOFDKJ_1 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_1); gnlProkkaLFAOFDKJ_2 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_2); gnlProkkaLFAOFDKJ_3 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_3); gnlProkkaLFAOFDKJ_4 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_4); gnlProkkaLFAOFDKJ_5 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_5); gnlProkkaLFAOFDKJ_6 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_6); gnlProkkaLFAOFDKJ_7 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_7); gnlProkkaLFAOFDKJ_8 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_8); gnlProkkaLFAOFDKJ_9 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_9); gnlProkkaLFAOFDKJ_10 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_10); gnlProkkaLFAOFDKJ_11 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_11); gnlProkkaLFAOFDKJ_12 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_12); gnlProkkaLFAOFDKJ_13 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_13); gnlProkkaLFAOFDKJ_14 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_14); gnlProkkaLFAOFDKJ_15 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_15); gnlProkkaLFAOFDKJ_16 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_16); gnlProkkaLFAOFDKJ_17 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_17); gnlProkkaLFAOFDKJ_18 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_18); gnlProkkaLFAOFDKJ_19 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_19); gnlProkkaLFAOFDKJ_20 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_20); gnlProkkaLFAOFDKJ_21 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_21); gnlProkkaLFAOFDKJ_22 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_22); gnlProkkaLFAOFDKJ_23 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_23); gnlProkkaLFAOFDKJ_24 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_24); gnlProkkaLFAOFDKJ_25 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_25); gnlProkkaLFAOFDKJ_26 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_26); gnlProkkaLFAOFDKJ_27 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_27); gnlProkkaLFAOFDKJ_28 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_28); gnlProkkaLFAOFDKJ_29 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_29); gnlProkkaLFAOFDKJ_30 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_30); gnlProkkaLFAOFDKJ_31 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_31); gnlProkkaLFAOFDKJ_32 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_32); gnlProkkaLFAOFDKJ_33 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_33); gnlProkkaLFAOFDKJ_34 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_34); gnlProkkaLFAOFDKJ_35 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_35); gnlProkkaLFAOFDKJ_36 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_36); gnlProkkaLFAOFDKJ_37 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_37); gnlProkkaLFAOFDKJ_38 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_38); gnlProkkaLFAOFDKJ_39 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_39); gnlProkkaLFAOFDKJ_40 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_40); gnlProkkaLFAOFDKJ_41 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_41); gnlProkkaLFAOFDKJ_42 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_42); gnlProkkaLFAOFDKJ_44 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_44); gnlProkkaLFAOFDKJ_45 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_45); gnlProkkaLFAOFDKJ_46 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_46); gnlProkkaLFAOFDKJ_47 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_47); gnlProkkaLFAOFDKJ_48 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_48); gnlProkkaLFAOFDKJ_49 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_49); gnlProkkaLFAOFDKJ_50 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_50); gnlProkkaLFAOFDKJ_51 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_51); gnlProkkaLFAOFDKJ_52 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_52); gnlProkkaLFAOFDKJ_53 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_53); gnlProkkaLFAOFDKJ_54 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_54); gnlProkkaLFAOFDKJ_55 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_55); gnlProkkaLFAOFDKJ_56 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_56); gnlProkkaLFAOFDKJ_57 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_57); gnlProkkaLFAOFDKJ_58 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_58); gnlProkkaLFAOFDKJ_59 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_59); gnlProkkaLFAOFDKJ_60 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_60); gnlProkkaLFAOFDKJ_61 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_61); gnlProkkaLFAOFDKJ_62 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_62); gnlProkkaLFAOFDKJ_63 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_63); gnlProkkaLFAOFDKJ_64 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_64); gnlProkkaLFAOFDKJ_65 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_65); gnlProkkaLFAOFDKJ_66 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_66); gnlProkkaLFAOFDKJ_67 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_67); gnlProkkaLFAOFDKJ_68 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_68); gnlProkkaLFAOFDKJ_69 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_69); gnlProkkaLFAOFDKJ_70 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_70); gnlProkkaLFAOFDKJ_71 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_71); gnlProkkaLFAOFDKJ_72 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_72); gnlProkkaLFAOFDKJ_73 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_73); gnlProkkaLFAOFDKJ_74 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_74); gnlProkkaLFAOFDKJ_75 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_75); gnlProkkaLFAOFDKJ_76 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_76); gnlProkkaLFAOFDKJ_77 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_77); gnlProkkaLFAOFDKJ_78 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_78); gnlProkkaLFAOFDKJ_79 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_79); gnlProkkaLFAOFDKJ_80 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_80); gnlProkkaLFAOFDKJ_81 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_81); gnlProkkaLFAOFDKJ_82 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_82); gnlProkkaLFAOFDKJ_83 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_83); gnlProkkaLFAOFDKJ_84 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_84); gnlProkkaLFAOFDKJ_85 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_85); gnlProkkaLFAOFDKJ_86 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_86); gnlProkkaLFAOFDKJ_87 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_87); gnlProkkaLFAOFDKJ_88 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_88); gnlProkkaLFAOFDKJ_89 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_89); gnlProkkaLFAOFDKJ_90 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_90); gnlProkkaLFAOFDKJ_91 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_91); gnlProkkaLFAOFDKJ_92 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_92); gnlProkkaLFAOFDKJ_93 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_93); gnlProkkaLFAOFDKJ_94 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_94); gnlProkkaLFAOFDKJ_95 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_95); gnlProkkaLFAOFDKJ_96 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_96); gnlProkkaLFAOFDKJ_97 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_97); gnlProkkaLFAOFDKJ_98 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_98); gnlProkkaLFAOFDKJ_99 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_99); gnlProkkaLFAOFDKJ_100 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_100); gnlProkkaLFAOFDKJ_101 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_101); gnlProkkaLFAOFDKJ_102 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_102); gnlProkkaLFAOFDKJ_103 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_103); gnlProkkaLFAOFDKJ_104 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_104); gnlProkkaLFAOFDKJ_105 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_105); gnlProkkaLFAOFDKJ_106 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_106); gnlProkkaLFAOFDKJ_107 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_107); gnlProkkaLFAOFDKJ_108 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_108); gnlProkkaLFAOFDKJ_109 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_109); gnlProkkaLFAOFDKJ_110 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_110); gnlProkkaLFAOFDKJ_111 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_111); gnlProkkaLFAOFDKJ_112 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_112); gnlProkkaLFAOFDKJ_113 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_113); gnlProkkaLFAOFDKJ_114 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_114); gnlProkkaLFAOFDKJ_115 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_115); gnlProkkaLFAOFDKJ_116 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_116); gnlProkkaLFAOFDKJ_117 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_117); gnlProkkaLFAOFDKJ_118 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_118); gnlProkkaLFAOFDKJ_119 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_119); gnlProkkaLFAOFDKJ_120 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_120); gnlProkkaLFAOFDKJ_121 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_121); gnlProkkaLFAOFDKJ_122 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_122); gnlProkkaLFAOFDKJ_123 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_123); gnlProkkaLFAOFDKJ_124 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_124); gnlProkkaLFAOFDKJ_125 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_125); gnlProkkaLFAOFDKJ_126 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_126); gnlProkkaLFAOFDKJ_127 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_127); gnlProkkaLFAOFDKJ_128 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_128); gnlProkkaLFAOFDKJ_129 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_129); gnlProkkaLFAOFDKJ_130 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_130); gnlProkkaLFAOFDKJ_131 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_131); gnlProkkaLFAOFDKJ_132 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_132); gnlProkkaLFAOFDKJ_133 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_133); gnlProkkaLFAOFDKJ_134 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_134); gnlProkkaLFAOFDKJ_135 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_135); gnlProkkaLFAOFDKJ_136 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_136); gnlProkkaLFAOFDKJ_137 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_137); gnlProkkaLFAOFDKJ_138 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_138); gnlProkkaLFAOFDKJ_139 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_139); gnlProkkaLFAOFDKJ_140 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_140); gnlProkkaLFAOFDKJ_141 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_141); gnlProkkaLFAOFDKJ_142 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_142); gnlProkkaLFAOFDKJ_143 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_143); gnlProkkaLFAOFDKJ_144 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_144); gnlProkkaLFAOFDKJ_145 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_145); gnlProkkaLFAOFDKJ_146 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_146); gnlProkkaLFAOFDKJ_147 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_147); gnlProkkaLFAOFDKJ_148 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_148); gnlProkkaLFAOFDKJ_149 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_149); gnlProkkaLFAOFDKJ_150 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_150); gnlProkkaLFAOFDKJ_151 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_151); gnlProkkaLFAOFDKJ_152 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_152); gnlProkkaLFAOFDKJ_153 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_153); gnlProkkaLFAOFDKJ_154 (original name was: gnl|Prokka|LFAOFDKJ_154)

Compact view

gnlProkkaLFAOFDKJ_43 - Region 1 - ranthipeptide

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 8,395 nt. (total: 8,395 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

ranthipeptide: (TIGR03973 or SCIFF or (cds(PF04055 and (TIGR04085 or SPASM)) and minimum(1, [Bottromycin_Methyltransferase_RRE, Cyanobactin_D_RRE, Cytolysin_C_RRE, Goadsporin_CD_RRE, Heterocycloanthracin_C_RRE, Lanthipeptide_LanB_RRE, Lasso_Fused_RRE, Mycofactocin_RRE, NHLP_CD_RRE, Other_Sactipeptide_rSAM_RRE, Pantocin_Microcin_RRE, Plantazolicin_C_RRE, PlpY_RRE, PqqD_RRE, Proteusin_Epimerase_RRE, Proteusin_Methyltransferase_RRE, Quinohemoprotein_rSAM_RRE, Ranthipeptide_rSAM_RRE, Stand_Alone_Lasso_RRE, Streptide_RRE, Subtilosin_rSAM_RRE, Thiaglutamate_B_RRE, Thiaglutamate_G_RRE, Thiaglutamate_I_RRE, Thiopeptide_F_RRE, Thuricin_rSAM_RRE, Thurincin_rSAM_RRE, Trifolitoxin_RRE]) and not (TIGR01716 or subtilosin or TIGR02111 or TIGR03966 or TIGR04103 or (YcaO or TIGR03604))))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.