GCA_039615375.1 - 1 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaPIEMDFDJ_7 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_7)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 7.1	RiPP-like	18,929	36,710

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaPIEMDFDJ_1 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_1); gnlProkkaPIEMDFDJ_2 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_2); gnlProkkaPIEMDFDJ_3 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_3); gnlProkkaPIEMDFDJ_4 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_4); gnlProkkaPIEMDFDJ_5 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_5); gnlProkkaPIEMDFDJ_6 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_6); gnlProkkaPIEMDFDJ_8 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_8); gnlProkkaPIEMDFDJ_9 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_9); gnlProkkaPIEMDFDJ_10 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_10); gnlProkkaPIEMDFDJ_11 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_11); gnlProkkaPIEMDFDJ_12 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_12); gnlProkkaPIEMDFDJ_13 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_13); gnlProkkaPIEMDFDJ_14 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_14); gnlProkkaPIEMDFDJ_15 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_15); gnlProkkaPIEMDFDJ_16 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_16); gnlProkkaPIEMDFDJ_17 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_17); gnlProkkaPIEMDFDJ_18 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_18); gnlProkkaPIEMDFDJ_19 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_19); gnlProkkaPIEMDFDJ_20 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_20); gnlProkkaPIEMDFDJ_21 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_21); gnlProkkaPIEMDFDJ_22 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_22); gnlProkkaPIEMDFDJ_23 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_23); gnlProkkaPIEMDFDJ_24 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_24); gnlProkkaPIEMDFDJ_25 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_25); gnlProkkaPIEMDFDJ_26 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_26); gnlProkkaPIEMDFDJ_27 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_27); gnlProkkaPIEMDFDJ_28 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_28); gnlProkkaPIEMDFDJ_29 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_29); gnlProkkaPIEMDFDJ_30 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_30); gnlProkkaPIEMDFDJ_31 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_31); gnlProkkaPIEMDFDJ_32 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_32); gnlProkkaPIEMDFDJ_33 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_33); gnlProkkaPIEMDFDJ_34 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_34); gnlProkkaPIEMDFDJ_35 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_35); gnlProkkaPIEMDFDJ_36 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_36); gnlProkkaPIEMDFDJ_37 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_37); gnlProkkaPIEMDFDJ_38 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_38); gnlProkkaPIEMDFDJ_39 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_39); gnlProkkaPIEMDFDJ_40 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_40); gnlProkkaPIEMDFDJ_41 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_41); gnlProkkaPIEMDFDJ_42 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_42); gnlProkkaPIEMDFDJ_43 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_43); gnlProkkaPIEMDFDJ_44 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_44); gnlProkkaPIEMDFDJ_45 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_45); gnlProkkaPIEMDFDJ_46 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_46); gnlProkkaPIEMDFDJ_47 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_47); gnlProkkaPIEMDFDJ_48 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_48); gnlProkkaPIEMDFDJ_49 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_49); gnlProkkaPIEMDFDJ_50 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_50); gnlProkkaPIEMDFDJ_51 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_51); gnlProkkaPIEMDFDJ_52 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_52); gnlProkkaPIEMDFDJ_53 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_53); gnlProkkaPIEMDFDJ_54 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_54); gnlProkkaPIEMDFDJ_55 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_55); gnlProkkaPIEMDFDJ_56 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_56); gnlProkkaPIEMDFDJ_57 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_57); gnlProkkaPIEMDFDJ_58 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_58); gnlProkkaPIEMDFDJ_59 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_59); gnlProkkaPIEMDFDJ_60 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_60); gnlProkkaPIEMDFDJ_61 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_61); gnlProkkaPIEMDFDJ_62 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_62); gnlProkkaPIEMDFDJ_63 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_63); gnlProkkaPIEMDFDJ_64 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_64); gnlProkkaPIEMDFDJ_65 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_65); gnlProkkaPIEMDFDJ_66 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_66); gnlProkkaPIEMDFDJ_67 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_67); gnlProkkaPIEMDFDJ_68 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_68); gnlProkkaPIEMDFDJ_69 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_69); gnlProkkaPIEMDFDJ_70 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_70); gnlProkkaPIEMDFDJ_71 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_71); gnlProkkaPIEMDFDJ_72 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_72); gnlProkkaPIEMDFDJ_73 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_73); gnlProkkaPIEMDFDJ_74 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_74); gnlProkkaPIEMDFDJ_75 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_75); gnlProkkaPIEMDFDJ_76 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_76); gnlProkkaPIEMDFDJ_77 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_77); gnlProkkaPIEMDFDJ_78 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_78); gnlProkkaPIEMDFDJ_86 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_86); gnlProkkaPIEMDFDJ_87 (original name was: gnl|Prokka|PIEMDFDJ_87)

Compact view

gnlProkkaPIEMDFDJ_7 - Region 1 - RiPP-like

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 18,929 - 36,710 nt. (total: 17,782 nt) Show pHMM detection rules used

RiPP-like: (strepbact or Antimicrobial14 or Bacteriocin_IId or BacteriocIIc_cy or Bacteriocin_II or Bacteriocin_IIi or Lactococcin or Antimicrobial17 or Lactococcin_972 or Bacteriocin_IIc or LcnG-beta or Cloacin or Linocin_M18 or TIGR03651 or TIGR03693 or TIGR03601 or TIGR03795 or TIGR03975 or DUF692 or TIGR01193 or (YcaO or TIGR03604))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.