GCA_958442015.1 - 1 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaDMPLABDE_6 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_6)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 6.1	RRE-containing	16,923	37,240

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaDMPLABDE_1 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_1); gnlProkkaDMPLABDE_2 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_2); gnlProkkaDMPLABDE_3 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_3); gnlProkkaDMPLABDE_4 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_4); gnlProkkaDMPLABDE_5 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_5); gnlProkkaDMPLABDE_7 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_7); gnlProkkaDMPLABDE_8 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_8); gnlProkkaDMPLABDE_9 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_9); gnlProkkaDMPLABDE_10 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_10); gnlProkkaDMPLABDE_11 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_11); gnlProkkaDMPLABDE_12 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_12); gnlProkkaDMPLABDE_13 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_13); gnlProkkaDMPLABDE_14 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_14); gnlProkkaDMPLABDE_15 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_15); gnlProkkaDMPLABDE_16 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_16); gnlProkkaDMPLABDE_17 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_17); gnlProkkaDMPLABDE_18 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_18); gnlProkkaDMPLABDE_19 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_19); gnlProkkaDMPLABDE_20 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_20); gnlProkkaDMPLABDE_21 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_21); gnlProkkaDMPLABDE_22 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_22); gnlProkkaDMPLABDE_23 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_23); gnlProkkaDMPLABDE_24 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_24); gnlProkkaDMPLABDE_25 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_25); gnlProkkaDMPLABDE_26 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_26); gnlProkkaDMPLABDE_27 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_27); gnlProkkaDMPLABDE_28 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_28); gnlProkkaDMPLABDE_29 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_29); gnlProkkaDMPLABDE_30 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_30); gnlProkkaDMPLABDE_31 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_31); gnlProkkaDMPLABDE_32 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_32); gnlProkkaDMPLABDE_33 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_33); gnlProkkaDMPLABDE_34 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_34); gnlProkkaDMPLABDE_35 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_35); gnlProkkaDMPLABDE_36 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_36); gnlProkkaDMPLABDE_37 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_37); gnlProkkaDMPLABDE_38 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_38); gnlProkkaDMPLABDE_39 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_39); gnlProkkaDMPLABDE_40 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_40); gnlProkkaDMPLABDE_41 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_41); gnlProkkaDMPLABDE_42 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_42); gnlProkkaDMPLABDE_43 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_43); gnlProkkaDMPLABDE_44 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_44); gnlProkkaDMPLABDE_45 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_45); gnlProkkaDMPLABDE_46 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_46); gnlProkkaDMPLABDE_47 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_47); gnlProkkaDMPLABDE_48 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_48); gnlProkkaDMPLABDE_49 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_49); gnlProkkaDMPLABDE_50 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_50); gnlProkkaDMPLABDE_51 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_51); gnlProkkaDMPLABDE_52 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_52); gnlProkkaDMPLABDE_53 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_53); gnlProkkaDMPLABDE_54 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_54); gnlProkkaDMPLABDE_55 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_55); gnlProkkaDMPLABDE_56 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_56); gnlProkkaDMPLABDE_57 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_57); gnlProkkaDMPLABDE_58 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_58); gnlProkkaDMPLABDE_59 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_59); gnlProkkaDMPLABDE_60 (original name was: gnl|Prokka|DMPLABDE_60)

Compact view

gnlProkkaDMPLABDE_6 - Region 1 - RRE-containing

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 16,923 - 37,240 nt. (total: 20,318 nt) Show pHMM detection rules used

RRE-containing: minimum(1, [Bottromycin_Methyltransferase_RRE, Cyanobactin_D_RRE, Cytolysin_C_RRE, Goadsporin_CD_RRE, Heterocycloanthracin_C_RRE, Lanthipeptide_LanB_RRE, Lasso_Fused_RRE, Mycofactocin_RRE, NHLP_CD_RRE, Other_Sactipeptide_rSAM_RRE, Pantocin_Microcin_RRE, Plantazolicin_C_RRE, PlpY_RRE, PqqD_RRE, Proteusin_Epimerase_RRE, Proteusin_Methyltransferase_RRE, Quinohemoprotein_rSAM_RRE, Ranthipeptide_rSAM_RRE, Stand_Alone_Lasso_RRE, Streptide_RRE, Subtilosin_rSAM_RRE, Thiaglutamate_B_RRE, Thiaglutamate_G_RRE, Thiaglutamate_I_RRE, Thiopeptide_F_RRE, Thuricin_rSAM_RRE, Thurincin_rSAM_RRE, Trifolitoxin_RRE])

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.