Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
4004.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
FOBPMGJP_6762959621Bifidobacterium bifidum ileS conferring resistance to mupirocinARO:3003730Bbif_ileS_MUP99.55100.09CP001840.1
FOBPMGJP_3854705841Mycobacterium tuberculosis rpsL mutations conferring resistance to StreptomycinARO:3003395Mtub_rpsL_STR82.9399.19NC_000962.3
FOBPMGJP_1412443163tet(W)ARO:3000194tet(W)97.81100.00AJ222769.3
FOBPMGJP_2971683668Bifidobacterium adolescentis rpoB mutants conferring resistance to rifampicinARO:3004480Bado_rpoB_RIF91.6798.40NC_008618.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
FOBPMGJP_1412443163tet(W)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline99.38100.00FN396364

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
FOBPMGJP_1412473163tet(W)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(W)BLASTX99.37100.00WP_000691721.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
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FOBPMGJP_5410.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements