Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
MAIMMJDM_1083127630572WalR8.38e-113transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
MAIMMJDM_801384614043CspR9.88e-34cold shock protein89.39100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
MAIMMJDM_12557636821repUS751059 / 1059100.00CP002393

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
MAIMMJDM_10.01.00.0
MAIMMJDM_20.01.00.0
MAIMMJDM_30.01.00.0
MAIMMJDM_41.00.01.0
MAIMMJDM_81.00.01.0
MAIMMJDM_121.00.01.0
MAIMMJDM_131.00.01.0
MAIMMJDM_151.00.01.0
MAIMMJDM_180.01.00.0
MAIMMJDM_190.01.00.0
MAIMMJDM_210.01.00.0
MAIMMJDM_220.01.00.0
MAIMMJDM_230.01.00.0
MAIMMJDM_241.00.01.0
MAIMMJDM_250.01.00.0
MAIMMJDM_280.01.00.0
MAIMMJDM_301.00.01.0
MAIMMJDM_330.01.00.0
MAIMMJDM_341.00.01.0
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MAIMMJDM_381.00.01.0
MAIMMJDM_391.00.01.0
MAIMMJDM_400.01.00.0
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MAIMMJDM_431.00.01.0
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MAIMMJDM_450.01.00.0
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MAIMMJDM_1130.01.00.0
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MAIMMJDM_1180.01.00.0
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MAIMMJDM_1200.01.00.0
MAIMMJDM_1210.01.00.0
MAIMMJDM_1220.01.00.0
MAIMMJDM_1230.01.00.0
MAIMMJDM_1240.01.00.0
MAIMMJDM_1251.00.01.0
MAIMMJDM_1261.00.01.0
MAIMMJDM_1270.01.00.0
MAIMMJDM_1280.01.00.0
MAIMMJDM_1290.01.00.0
MAIMMJDM_1330.01.00.0
MAIMMJDM_1340.01.00.0
MAIMMJDM_1360.01.00.0
MAIMMJDM_1400.01.00.0
MAIMMJDM_1420.01.00.0
MAIMMJDM_1451.00.01.0
MAIMMJDM_1480.01.00.0
MAIMMJDM_1500.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
MAIMMJDM_74154163163236FalseSiphoviridaeVOG4632, VOG4609, VOG0205, VOG4841, VOG4581, VOG4544, VOG5051, VOG4556
MAIMMJDM_803354643615FalseUnknownVOG9667, VOG6495, VOG1333, VOG4965, VOG6179, VOG11003, VOG11003, VOG6495, VOG7236, VOG8241, VOG1309, VOG0186, VOG4566, VOG0189
MAIMMJDM_804518867961FalseSiphoviridaeVOG3307, VOG0198, VOG4570, VOG3699, VOG4544, VOG0720, VOG4564, VOG5616, VOG1300, VOG4555, VOG3434, VOG1887, VOG4713, VOG0723, VOG5660, VOG0724, VOG0799, VOG0725, VOG0800, VOG4545, VOG4605, VOG4599, VOG4705, VOG1637

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements