Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0133.16

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
HMKIHHLC_27614902904STER_RS052500.0CapsuleImmune modulation97.6099.86WP_011681165

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
HMKIHHLC_973863OadB2.83e-125Na+ membrane pump80.8479.50AAX97432
HMKIHHLC_2281828886WalR6.45e-123transcriptional regulatory protein82.98100.00EPH95667
HMKIHHLC_71797617779CspR3.35e-34cold shock protein89.39100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
HMKIHHLC_25419763037repUS741062 / 106299.81CP000424

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
HMKIHHLC_10.01.00.0
HMKIHHLC_20.01.00.0
HMKIHHLC_30.01.00.0
HMKIHHLC_40.01.00.0
HMKIHHLC_50.01.00.0
HMKIHHLC_60.01.00.0
HMKIHHLC_70.01.00.0
HMKIHHLC_80.01.00.0
HMKIHHLC_90.01.00.0
HMKIHHLC_100.01.00.0
HMKIHHLC_110.01.00.0
HMKIHHLC_120.01.00.0
HMKIHHLC_130.01.00.0
HMKIHHLC_140.01.00.0
HMKIHHLC_150.01.00.0
HMKIHHLC_160.01.00.0
HMKIHHLC_170.01.00.0
HMKIHHLC_180.01.00.0
HMKIHHLC_190.01.00.0
HMKIHHLC_200.01.00.0
HMKIHHLC_210.01.00.0
HMKIHHLC_220.01.00.0
HMKIHHLC_230.01.00.0
HMKIHHLC_240.01.00.0
HMKIHHLC_250.01.00.0
HMKIHHLC_260.01.00.0
HMKIHHLC_270.01.00.0
HMKIHHLC_280.01.00.0
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HMKIHHLC_300.01.00.0
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HMKIHHLC_360.01.00.0
HMKIHHLC_370.01.00.0
HMKIHHLC_380.01.00.0
HMKIHHLC_390.01.00.0
HMKIHHLC_400.01.00.0
HMKIHHLC_410.01.00.0
HMKIHHLC_420.01.00.0
HMKIHHLC_430.01.00.0
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HMKIHHLC_450.01.00.0
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HMKIHHLC_490.01.00.0
HMKIHHLC_500.01.00.0
HMKIHHLC_510.01.00.0
HMKIHHLC_520.01.00.0
HMKIHHLC_530.01.00.0
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HMKIHHLC_550.01.00.0
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HMKIHHLC_591.00.01.0
HMKIHHLC_600.01.00.0
HMKIHHLC_610.01.00.0
HMKIHHLC_620.01.00.0
HMKIHHLC_631.00.01.0
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HMKIHHLC_650.01.00.0
HMKIHHLC_660.01.00.0
HMKIHHLC_670.01.00.0
HMKIHHLC_680.01.00.0
HMKIHHLC_690.01.00.0
HMKIHHLC_701.00.01.0
HMKIHHLC_710.01.00.0
HMKIHHLC_720.01.00.0
HMKIHHLC_730.01.00.0
HMKIHHLC_740.01.00.0
HMKIHHLC_750.01.00.0
HMKIHHLC_760.01.00.0
HMKIHHLC_771.00.01.0
HMKIHHLC_780.01.00.0
HMKIHHLC_791.00.01.0
HMKIHHLC_800.01.00.0
HMKIHHLC_810.01.00.0
HMKIHHLC_821.00.01.0
HMKIHHLC_830.01.00.0
HMKIHHLC_840.01.00.0
HMKIHHLC_850.01.00.0
HMKIHHLC_860.01.00.0
HMKIHHLC_870.01.00.0
HMKIHHLC_880.01.00.0
HMKIHHLC_890.01.00.0
HMKIHHLC_900.01.00.0
HMKIHHLC_910.01.00.0
HMKIHHLC_920.01.00.0
HMKIHHLC_931.00.01.0
HMKIHHLC_940.01.00.0
HMKIHHLC_950.01.00.0
HMKIHHLC_960.01.00.0
HMKIHHLC_970.01.00.0
HMKIHHLC_980.01.00.0
HMKIHHLC_990.01.00.0
HMKIHHLC_1000.01.00.0
HMKIHHLC_1010.01.00.0
HMKIHHLC_1020.01.00.0
HMKIHHLC_1030.01.00.0
HMKIHHLC_1040.01.00.0
HMKIHHLC_1050.01.00.0
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HMKIHHLC_1080.01.00.0
HMKIHHLC_1090.01.00.0
HMKIHHLC_1100.01.00.0
HMKIHHLC_1110.01.00.0
HMKIHHLC_1120.01.00.0
HMKIHHLC_1130.01.00.0
HMKIHHLC_1140.01.00.0
HMKIHHLC_1150.01.00.0
HMKIHHLC_1160.01.00.0
HMKIHHLC_1170.01.00.0
HMKIHHLC_1180.01.00.0
HMKIHHLC_1190.01.00.0
HMKIHHLC_1201.00.01.0
HMKIHHLC_1210.01.00.0
HMKIHHLC_1220.01.00.0
HMKIHHLC_1230.01.00.0
HMKIHHLC_1240.01.00.0
HMKIHHLC_1250.01.00.0
HMKIHHLC_1260.01.00.0
HMKIHHLC_1270.01.00.0
HMKIHHLC_1281.00.01.0
HMKIHHLC_1290.01.00.0
HMKIHHLC_1300.01.00.0
HMKIHHLC_1310.01.00.0
HMKIHHLC_1320.01.00.0
HMKIHHLC_1330.01.00.0
HMKIHHLC_1340.01.00.0
HMKIHHLC_1350.01.00.0
HMKIHHLC_1360.01.00.0
HMKIHHLC_1370.01.00.0
HMKIHHLC_1380.01.00.0
HMKIHHLC_1390.01.00.0
HMKIHHLC_1400.01.00.0
HMKIHHLC_1410.01.00.0
HMKIHHLC_1420.01.00.0
HMKIHHLC_1430.01.00.0
HMKIHHLC_1440.01.00.0
HMKIHHLC_1451.00.01.0
HMKIHHLC_1460.01.00.0
HMKIHHLC_1471.00.01.0
HMKIHHLC_1480.01.00.0
HMKIHHLC_1490.01.00.0
HMKIHHLC_1500.01.00.0
HMKIHHLC_1510.01.00.0
HMKIHHLC_1520.01.00.0
HMKIHHLC_1530.01.00.0
HMKIHHLC_1540.01.00.0
HMKIHHLC_1550.01.00.0
HMKIHHLC_1560.01.00.0
HMKIHHLC_1570.01.00.0
HMKIHHLC_1580.01.00.0
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HMKIHHLC_1600.01.00.0
HMKIHHLC_1611.00.01.0
HMKIHHLC_1620.01.00.0
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HMKIHHLC_1651.00.01.0
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HMKIHHLC_1670.01.00.0
HMKIHHLC_1680.01.00.0
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HMKIHHLC_1700.01.00.0
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HMKIHHLC_1900.01.00.0
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HMKIHHLC_2120.01.00.0
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HMKIHHLC_2280.01.00.0
HMKIHHLC_2290.01.00.0
HMKIHHLC_2300.01.00.0
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HMKIHHLC_2330.01.00.0
HMKIHHLC_2341.00.01.0
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HMKIHHLC_2400.01.00.0
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HMKIHHLC_2500.01.00.0
HMKIHHLC_2511.00.01.0
HMKIHHLC_2520.01.00.0
HMKIHHLC_2530.01.00.0
HMKIHHLC_2541.00.01.0
HMKIHHLC_2560.01.00.0
HMKIHHLC_2571.00.01.0
HMKIHHLC_2581.00.01.0
HMKIHHLC_2590.01.00.0
HMKIHHLC_2600.01.00.0
HMKIHHLC_2610.01.00.0
HMKIHHLC_2621.00.01.0
HMKIHHLC_2630.01.00.0
HMKIHHLC_2640.01.00.0
HMKIHHLC_2650.01.00.0
HMKIHHLC_2661.00.01.0
HMKIHHLC_2670.01.00.0
HMKIHHLC_2681.00.01.0
HMKIHHLC_2691.00.01.0
HMKIHHLC_2700.01.00.0
HMKIHHLC_2710.01.00.0
HMKIHHLC_2720.01.00.0
HMKIHHLC_2730.01.00.0
HMKIHHLC_2740.01.00.0
HMKIHHLC_2750.01.00.0
HMKIHHLC_2761.00.01.0
HMKIHHLC_2771.00.01.0
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HMKIHHLC_2870.01.00.0
HMKIHHLC_2880.01.00.0
HMKIHHLC_2891.00.01.0
HMKIHHLC_2900.01.00.0
HMKIHHLC_2910.01.00.0
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HMKIHHLC_2930.01.00.0
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HMKIHHLC_2990.01.00.0
HMKIHHLC_3000.01.00.0
HMKIHHLC_3011.00.01.0
HMKIHHLC_3021.00.01.0
HMKIHHLC_3030.01.00.0
HMKIHHLC_3040.01.00.0
HMKIHHLC_3050.01.00.0
HMKIHHLC_3061.00.01.0
HMKIHHLC_3070.01.00.0
HMKIHHLC_3081.00.01.0
HMKIHHLC_3091.00.01.0
HMKIHHLC_3101.00.01.0
HMKIHHLC_3111.00.01.0
HMKIHHLC_3120.01.00.0
HMKIHHLC_3131.00.01.0
HMKIHHLC_3140.01.00.0
HMKIHHLC_3150.01.00.0
HMKIHHLC_3161.00.01.0
HMKIHHLC_3170.01.00.0
HMKIHHLC_3180.01.00.0
HMKIHHLC_3190.01.00.0
HMKIHHLC_3200.01.00.0
HMKIHHLC_3210.01.00.0
HMKIHHLC_3220.01.00.0
HMKIHHLC_3230.01.00.0
HMKIHHLC_3240.01.00.0
HMKIHHLC_3250.01.00.0
HMKIHHLC_3260.01.00.0
HMKIHHLC_3271.00.01.0
HMKIHHLC_3281.00.01.0
HMKIHHLC_3290.01.00.0
HMKIHHLC_3301.00.01.0
HMKIHHLC_3311.00.01.0
HMKIHHLC_3330.01.00.0
HMKIHHLC_3341.00.01.0
HMKIHHLC_3351.00.01.0
HMKIHHLC_3360.01.00.0
HMKIHHLC_3371.00.01.0
HMKIHHLC_3381.00.01.0
HMKIHHLC_3391.00.01.0
HMKIHHLC_3400.01.00.0
HMKIHHLC_3410.01.00.0
HMKIHHLC_3420.01.00.0
HMKIHHLC_3430.01.00.0
HMKIHHLC_3440.01.00.0
HMKIHHLC_3450.01.00.0
HMKIHHLC_3460.01.00.0
HMKIHHLC_3471.00.01.0
HMKIHHLC_3480.01.00.0
HMKIHHLC_3491.00.01.0
HMKIHHLC_3500.01.00.0
HMKIHHLC_3511.00.01.0
HMKIHHLC_3520.01.00.0
HMKIHHLC_3530.01.00.0
HMKIHHLC_3540.01.00.0
HMKIHHLC_3551.00.01.0
HMKIHHLC_3561.00.01.0
HMKIHHLC_3570.01.00.0
HMKIHHLC_3580.01.00.0
HMKIHHLC_3590.01.00.0
HMKIHHLC_3601.00.01.0
HMKIHHLC_3611.00.01.0
HMKIHHLC_3620.01.00.0
HMKIHHLC_3630.01.00.0
HMKIHHLC_3640.01.00.0
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HMKIHHLC_3660.01.00.0
HMKIHHLC_3670.01.00.0
HMKIHHLC_3700.01.00.0
HMKIHHLC_3710.01.00.0
HMKIHHLC_3720.01.00.0
HMKIHHLC_3731.00.01.0
HMKIHHLC_3741.00.01.0
HMKIHHLC_3750.01.00.0
HMKIHHLC_3760.01.00.0
HMKIHHLC_3770.01.00.0
HMKIHHLC_3780.01.00.0
HMKIHHLC_3791.00.01.0
HMKIHHLC_3800.01.00.0
HMKIHHLC_3811.00.01.0
HMKIHHLC_3821.00.01.0
HMKIHHLC_3831.00.01.0
HMKIHHLC_3841.00.01.0
HMKIHHLC_3851.00.01.0
HMKIHHLC_3860.01.00.0
HMKIHHLC_3871.00.01.0
HMKIHHLC_3881.00.01.0
HMKIHHLC_3891.00.01.0
HMKIHHLC_3901.00.01.0
HMKIHHLC_3910.01.00.0
HMKIHHLC_3920.01.00.0
HMKIHHLC_3931.00.01.0
HMKIHHLC_3940.01.00.0
HMKIHHLC_3950.01.00.0
HMKIHHLC_3961.00.01.0
HMKIHHLC_3971.00.01.0
HMKIHHLC_3981.00.01.0
HMKIHHLC_3990.01.00.0
HMKIHHLC_4000.01.00.0
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PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

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Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements