Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 4 | 1 | 0 | 4.12 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| OPGELKGG_363 | 59905 | 61830 | tet(Q) | ARO:3000191 | tet(Q) | 96.41 | 97.56 | Z21523.1 |
| OPGELKGG_264 | 44785 | 45990 | Mef(En2) | ARO:3004659 | Mef(En2) | 99.50 | 100.00 | AF251288.1 |
| OPGELKGG_264 | 22835 | 23737 | cepA | ARO:3003559 | cepA | 99.67 | 100.00 | U05883.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| OPGELKGG_264 | 22835 | 23737 | cepA | Unknown Beta-lactam | 99.89 | 100.00 | L13472 |
| OPGELKGG_363 | 59905 | 61830 | tet(Q) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline | 99.79 | 100.00 | L33696 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| OPGELKGG_264 | 46015 | 46524 | lnu(AN2) | lincosamide nucleotidyltransferase Lnu(AN2) | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_004308783.1 |
| OPGELKGG_264 | 22838 | 23737 | cepA | CepA family extended-spectrum class A beta-lactamase | BLASTX | 99.67 | 100.00 | WP_005795628.1 |
| OPGELKGG_363 | 59905 | 61827 | tet(Q) | tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q) | BLASTX | 99.53 | 100.00 | WP_063856407.1 |
| OPGELKGG_264 | 44785 | 45987 | mef(En2) | macrolide efflux MFS transporter Mef(En2) | BLASTX | 99.50 | 100.00 | WP_063853729.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| OPGELKGG_271 | 935 | 2128 | bft-1 | 0.0 | BFT B. fragilis toxin, subtype 1 | Exotoxin | 100.00 | 100.00 | BAA77276 |
| OPGELKGG_271 | 935 | 2128 | bft-2 | 0.0 | BFT B. fragilis toxin, subtype 2 | Exotoxin | 94.89 | 100.00 | BAA77277 |
| OPGELKGG_271 | 935 | 2128 | bft-3 | 0.0 | BFT B. fragilis toxin, subtype 3 | Exotoxin | 94.47 | 100.00 | BAA77275 |
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| OPGELKGG_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_5 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_6 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_8 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_11 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_12 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_16 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_21 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_24 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_29 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_30 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_31 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_32 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_33 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_34 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_36 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_37 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_38 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_42 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_48 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_50 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_52 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_57 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_59 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_61 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_64 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_68 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_70 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_75 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_76 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_78 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_84 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_91 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_95 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_101 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_102 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_103 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_109 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_110 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_113 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_114 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_125 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_127 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_129 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_131 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_132 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_133 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_134 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_140 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_144 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_148 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_154 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_161 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_163 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_166 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_168 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_169 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_171 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_173 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_176 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_178 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_181 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_182 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_183 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_184 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_188 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_190 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_191 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_192 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_194 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_196 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_200 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_201 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_205 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_206 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_207 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_208 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_210 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_211 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_213 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_215 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_216 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_217 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_219 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_220 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_221 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_222 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_225 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_226 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_227 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_229 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_231 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_233 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_235 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_236 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_237 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_238 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_239 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_240 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_241 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_242 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_243 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_244 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_245 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_246 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_247 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_248 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_250 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_251 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_252 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_253 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_254 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_255 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_256 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_257 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_258 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_259 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_260 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_261 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_262 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_263 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_264 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_265 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_266 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_267 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_268 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_269 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_270 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_271 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_273 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_274 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_275 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_276 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_277 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_278 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_279 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_280 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_281 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_284 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_285 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_288 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_289 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_290 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_291 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_293 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_294 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_295 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_296 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_297 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_298 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_299 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_300 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_301 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_303 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_304 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_307 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_309 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_311 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_312 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_323 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_324 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_326 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_327 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_328 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_329 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_330 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_331 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_332 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_333 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_334 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_335 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_336 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_340 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_341 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_343 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_344 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_345 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_346 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_347 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_351 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_352 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_353 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_354 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_355 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_356 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_358 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_359 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_360 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OPGELKGG_361 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_362 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OPGELKGG_363 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)