Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 1 | 0 | 0 | 1.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| OBCJLMGD_65 | 1829 | 2731 | CepA-44 | ARO:3006225 | CepA-44 | 99.00 | 100.00 | NG_050386.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| OBCJLMGD_65 | 1829 | 2731 | cepA | Unknown Beta-lactam | 99.78 | 100.00 | U05887 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| OBCJLMGD_65 | 1832 | 2731 | cepA | CepA family extended-spectrum class A beta-lactamase | BLASTX | 99.33 | 100.00 | WP_005816369.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| OBCJLMGD_432 | 583 | 1262 | repUS2 | 682 / 681 | 98.68 | BFU30316 |
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| OBCJLMGD_2 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_17 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_20 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_25 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_30 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_33 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_38 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_40 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_49 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_53 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_54 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_65 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_67 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_68 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_71 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_72 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_73 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_75 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_80 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_84 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_85 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_90 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_94 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_95 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_96 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_97 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_100 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_105 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_106 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_109 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_114 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_116 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_117 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_119 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_125 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_126 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_127 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_129 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_132 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_133 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_134 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_135 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_136 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_137 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_141 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_146 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_147 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_148 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_151 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_153 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_156 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_160 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_161 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_162 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_169 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_171 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_172 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_176 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_181 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_182 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_183 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_184 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_186 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_187 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_188 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_189 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_191 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_192 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_193 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_194 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_195 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_196 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_197 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_199 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_200 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_201 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_204 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_205 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_207 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_208 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_209 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_210 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_211 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_212 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_213 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_214 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_215 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_218 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_219 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_220 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_221 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_222 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_223 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_224 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_225 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_226 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_227 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_228 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_229 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_231 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_232 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_233 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_234 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_235 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_236 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_237 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_238 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_239 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_240 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_241 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_242 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_243 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_244 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_248 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_249 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_250 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_251 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_252 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_253 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_255 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_257 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_258 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_259 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_260 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_261 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_262 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_263 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_264 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_265 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_266 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_267 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_268 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_269 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_270 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_272 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_274 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_275 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_280 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_281 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_282 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_288 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_291 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_292 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_293 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_294 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_300 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_303 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_304 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_307 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_308 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_309 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_310 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_312 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_313 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_317 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_318 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_319 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_320 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_326 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_329 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_330 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_331 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_332 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| OBCJLMGD_334 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_335 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_336 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_337 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| OBCJLMGD_339 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
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Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)