Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
3103.16

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
BGJMNBAA_1822263723539CepA-49ARO:3006226CepA-49100.00100.00NG_050387.1
BGJMNBAA_141295014923tet(Q)ARO:3000191tet(Q)100.00100.00Z21523.1
BGJMNBAA_1017931530ErmBARO:3000375ErmB98.3798.79AF242872.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
BGJMNBAA_1822263723539cepA-49Unknown Beta-lactam100.00100.00U05886
BGJMNBAA_141299814923tet(Q)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline100.00100.00Z21523
BGJMNBAA_1017931530erm(B)Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S99.86100.00U18931

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
BGJMNBAA_1822264023539cepA-49extended-spectrum class A beta-lactamase CepA-49ALLELEX100.00100.00WP_008659027.1
BGJMNBAA_141299814920tet(Q)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q)EXACTX100.00100.00WP_002560998.1
BGJMNBAA_1017931527erm(B)23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(B)BLASTX99.59100.00WP_002292226.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
BGJMNBAA_1975901783bft-10.0BFT B. fragilis toxin, subtype 1Exotoxin100.00100.00BAA77276
BGJMNBAA_1975901783bft-20.0BFT B. fragilis toxin, subtype 2Exotoxin94.89100.00BAA77277
BGJMNBAA_1975901783bft-30.0BFT B. fragilis toxin, subtype 3Exotoxin94.47100.00BAA77275

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
BGJMNBAA_634171096repUS2682 / 68198.53BFU30316

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
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PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements