Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
4104.12

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
KCJBDOBN_2431340314305cepAARO:3003559cepA99.67100.00U05883.1
KCJBDOBN_4429344859tet(Q)ARO:3000191tet(Q)96.4197.56Z21523.1
KCJBDOBN_8113122517Mef(En2)ARO:3004659Mef(En2)99.50100.00AF251288.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
KCJBDOBN_2431340314305cepAUnknown Beta-lactam99.89100.00L13472
KCJBDOBN_4429344859tet(Q)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline99.84100.00L33696

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
KCJBDOBN_817781287lnu(AN2)lincosamide nucleotidyltransferase Lnu(AN2)EXACTX100.00100.00WP_004308783.1
KCJBDOBN_2431340614305cepACepA family extended-spectrum class A beta-lactamaseBLASTX99.67100.00WP_005795628.1
KCJBDOBN_4429374859tet(Q)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q)BLASTX99.53100.00WP_063856407.1
KCJBDOBN_8113152517mef(En2)macrolide efflux MFS transporter Mef(En2)BLASTX99.50100.00WP_063853729.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
KCJBDOBN_2545581751bft-10.0BFT B. fragilis toxin, subtype 1Exotoxin100.00100.00BAA77276
KCJBDOBN_2545581751bft-20.0BFT B. fragilis toxin, subtype 2Exotoxin94.89100.00BAA77277
KCJBDOBN_2545581751bft-30.0BFT B. fragilis toxin, subtype 3Exotoxin94.47100.00BAA77275

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
KCJBDOBN_10.01.00.0
KCJBDOBN_31.00.01.0
KCJBDOBN_41.00.01.0
KCJBDOBN_51.00.01.0
KCJBDOBN_91.00.01.0
KCJBDOBN_101.00.01.0
KCJBDOBN_111.00.01.0
KCJBDOBN_120.01.00.0
KCJBDOBN_141.00.01.0
KCJBDOBN_161.00.01.0
KCJBDOBN_200.01.00.0
KCJBDOBN_211.00.01.0
KCJBDOBN_230.01.00.0
KCJBDOBN_240.01.00.0
KCJBDOBN_251.00.01.0
KCJBDOBN_260.01.00.0
KCJBDOBN_281.00.01.0
KCJBDOBN_291.00.01.0
KCJBDOBN_300.01.00.0
KCJBDOBN_311.00.01.0
KCJBDOBN_331.00.01.0
KCJBDOBN_341.00.01.0
KCJBDOBN_351.00.01.0
KCJBDOBN_361.00.01.0
KCJBDOBN_371.00.01.0
KCJBDOBN_380.01.00.0
KCJBDOBN_391.00.01.0
KCJBDOBN_401.00.01.0
KCJBDOBN_410.01.00.0
KCJBDOBN_420.01.00.0
KCJBDOBN_431.00.01.0
KCJBDOBN_440.01.00.0
KCJBDOBN_460.01.00.0
KCJBDOBN_470.01.00.0
KCJBDOBN_491.00.01.0
KCJBDOBN_501.00.01.0
KCJBDOBN_510.01.00.0
KCJBDOBN_541.00.01.0
KCJBDOBN_591.00.01.0
KCJBDOBN_610.01.00.0
KCJBDOBN_630.01.00.0
KCJBDOBN_641.00.01.0
KCJBDOBN_671.00.01.0
KCJBDOBN_681.00.01.0
KCJBDOBN_700.01.00.0
KCJBDOBN_731.00.01.0
KCJBDOBN_741.00.01.0
KCJBDOBN_771.00.01.0
KCJBDOBN_780.01.00.0
KCJBDOBN_800.01.00.0
KCJBDOBN_810.01.00.0
KCJBDOBN_820.01.00.0
KCJBDOBN_831.00.01.0
KCJBDOBN_840.01.00.0
KCJBDOBN_851.00.01.0
KCJBDOBN_860.01.00.0
KCJBDOBN_870.01.00.0
KCJBDOBN_881.00.01.0
KCJBDOBN_921.00.01.0
KCJBDOBN_941.00.01.0
KCJBDOBN_951.00.01.0
KCJBDOBN_981.00.01.0
KCJBDOBN_1001.00.01.0
KCJBDOBN_1010.01.00.0
KCJBDOBN_1021.00.01.0
KCJBDOBN_1031.00.01.0
KCJBDOBN_1040.01.00.0
KCJBDOBN_1061.00.01.0
KCJBDOBN_1070.01.00.0
KCJBDOBN_1091.00.01.0
KCJBDOBN_1121.00.01.0
KCJBDOBN_1130.01.00.0
KCJBDOBN_1141.00.01.0
KCJBDOBN_1150.01.00.0
KCJBDOBN_1171.00.01.0
KCJBDOBN_1181.00.01.0
KCJBDOBN_1190.01.00.0
KCJBDOBN_1211.00.01.0
KCJBDOBN_1230.01.00.0
KCJBDOBN_1250.01.00.0
KCJBDOBN_1270.01.00.0
KCJBDOBN_1281.00.01.0
KCJBDOBN_1291.00.01.0
KCJBDOBN_1311.00.01.0
KCJBDOBN_1321.00.01.0
KCJBDOBN_1341.00.01.0
KCJBDOBN_1351.00.01.0
KCJBDOBN_1371.00.01.0
KCJBDOBN_1391.00.01.0
KCJBDOBN_1400.01.00.0
KCJBDOBN_1431.00.01.0
KCJBDOBN_1441.00.01.0
KCJBDOBN_1461.00.01.0
KCJBDOBN_1490.01.00.0
KCJBDOBN_1511.00.01.0
KCJBDOBN_1521.00.01.0
KCJBDOBN_1531.00.01.0
KCJBDOBN_1541.00.01.0
KCJBDOBN_1571.00.01.0
KCJBDOBN_1591.00.01.0
KCJBDOBN_1601.00.01.0
KCJBDOBN_1630.01.00.0
KCJBDOBN_1640.01.00.0
KCJBDOBN_1661.00.01.0
KCJBDOBN_1671.00.01.0
KCJBDOBN_1681.00.01.0
KCJBDOBN_1690.01.00.0
KCJBDOBN_1711.00.01.0
KCJBDOBN_1730.01.00.0
KCJBDOBN_1760.01.00.0
KCJBDOBN_1770.01.00.0
KCJBDOBN_1790.01.00.0
KCJBDOBN_1801.00.01.0
KCJBDOBN_1811.00.01.0
KCJBDOBN_1820.01.00.0
KCJBDOBN_1831.00.01.0
KCJBDOBN_1840.01.00.0
KCJBDOBN_1851.00.01.0
KCJBDOBN_1860.01.00.0
KCJBDOBN_1870.01.00.0
KCJBDOBN_1880.01.00.0
KCJBDOBN_1890.01.00.0
KCJBDOBN_1900.01.00.0
KCJBDOBN_1920.01.00.0
KCJBDOBN_1930.01.00.0
KCJBDOBN_1940.01.00.0
KCJBDOBN_1950.01.00.0
KCJBDOBN_1960.01.00.0
KCJBDOBN_1970.01.00.0
KCJBDOBN_1980.01.00.0
KCJBDOBN_1990.01.00.0
KCJBDOBN_2000.01.00.0
KCJBDOBN_2010.01.00.0
KCJBDOBN_2020.01.00.0
KCJBDOBN_2030.01.00.0
KCJBDOBN_2040.01.00.0
KCJBDOBN_2050.01.00.0
KCJBDOBN_2061.00.01.0
KCJBDOBN_2070.01.00.0
KCJBDOBN_2080.01.00.0
KCJBDOBN_2090.01.00.0
KCJBDOBN_2100.01.00.0
KCJBDOBN_2110.01.00.0
KCJBDOBN_2120.01.00.0
KCJBDOBN_2141.00.01.0
KCJBDOBN_2161.00.01.0
KCJBDOBN_2171.00.01.0
KCJBDOBN_2181.00.01.0
KCJBDOBN_2190.01.00.0
KCJBDOBN_2200.01.00.0
KCJBDOBN_2210.01.00.0
KCJBDOBN_2221.00.01.0
KCJBDOBN_2230.01.00.0
KCJBDOBN_2240.01.00.0
KCJBDOBN_2250.01.00.0
KCJBDOBN_2260.01.00.0
KCJBDOBN_2280.01.00.0
KCJBDOBN_2290.01.00.0
KCJBDOBN_2300.01.00.0
KCJBDOBN_2311.00.01.0
KCJBDOBN_2320.01.00.0
KCJBDOBN_2330.01.00.0
KCJBDOBN_2340.01.00.0
KCJBDOBN_2351.00.01.0
KCJBDOBN_2370.01.00.0
KCJBDOBN_2380.01.00.0
KCJBDOBN_2391.00.01.0
KCJBDOBN_2400.01.00.0
KCJBDOBN_2410.01.00.0
KCJBDOBN_2420.01.00.0
KCJBDOBN_2430.01.00.0
KCJBDOBN_2441.00.01.0
KCJBDOBN_2450.01.00.0
KCJBDOBN_2460.01.00.0
KCJBDOBN_2481.00.01.0
KCJBDOBN_2490.01.00.0
KCJBDOBN_2500.01.00.0
KCJBDOBN_2510.01.00.0
KCJBDOBN_2520.01.00.0
KCJBDOBN_2531.00.01.0
KCJBDOBN_2540.01.00.0
KCJBDOBN_2571.00.01.0
KCJBDOBN_2580.01.00.0
KCJBDOBN_2590.01.00.0
KCJBDOBN_2601.00.01.0
KCJBDOBN_2610.01.00.0
KCJBDOBN_2620.01.00.0
KCJBDOBN_2631.00.01.0
KCJBDOBN_2641.00.01.0
KCJBDOBN_2650.01.00.0
KCJBDOBN_2660.01.00.0
KCJBDOBN_2670.01.00.0
KCJBDOBN_2700.01.00.0
KCJBDOBN_2710.01.00.0
KCJBDOBN_2720.01.00.0
KCJBDOBN_2731.00.01.0
KCJBDOBN_2741.00.01.0
KCJBDOBN_2751.00.01.0
KCJBDOBN_2760.01.00.0
KCJBDOBN_2770.01.00.0
KCJBDOBN_2781.00.01.0
KCJBDOBN_2791.00.01.0
KCJBDOBN_2801.00.01.0
KCJBDOBN_2810.01.00.0
KCJBDOBN_2820.01.00.0
KCJBDOBN_2830.01.00.0
KCJBDOBN_2840.01.00.0
KCJBDOBN_2850.01.00.0
KCJBDOBN_2860.01.00.0
KCJBDOBN_2880.01.00.0
KCJBDOBN_2891.00.01.0
KCJBDOBN_2910.01.00.0
KCJBDOBN_2920.01.00.0
KCJBDOBN_2930.01.00.0
KCJBDOBN_2940.01.00.0
KCJBDOBN_2950.01.00.0
KCJBDOBN_2960.01.00.0
KCJBDOBN_2971.00.01.0
KCJBDOBN_2981.00.01.0
KCJBDOBN_2991.00.01.0
KCJBDOBN_3000.01.00.0
KCJBDOBN_3011.00.01.0
KCJBDOBN_3030.01.00.0
KCJBDOBN_3040.01.00.0
KCJBDOBN_3050.01.00.0
KCJBDOBN_3060.01.00.0
KCJBDOBN_3070.01.00.0
KCJBDOBN_3080.01.00.0
KCJBDOBN_3090.01.00.0
KCJBDOBN_3110.01.00.0
KCJBDOBN_3121.00.01.0
KCJBDOBN_3130.01.00.0
KCJBDOBN_3140.01.00.0
KCJBDOBN_3150.01.00.0
KCJBDOBN_3160.01.00.0
KCJBDOBN_3170.01.00.0
KCJBDOBN_3180.01.00.0
KCJBDOBN_3190.01.00.0
KCJBDOBN_3200.01.00.0
KCJBDOBN_3210.01.00.0
KCJBDOBN_3220.01.00.0
KCJBDOBN_3230.01.00.0
KCJBDOBN_3240.01.00.0
KCJBDOBN_3250.01.00.0
KCJBDOBN_3260.01.00.0
KCJBDOBN_3270.01.00.0
KCJBDOBN_3280.01.00.0
KCJBDOBN_3291.00.01.0
KCJBDOBN_3301.00.01.0
KCJBDOBN_3310.01.00.0
KCJBDOBN_3320.01.00.0
KCJBDOBN_3330.01.00.0
KCJBDOBN_3370.01.00.0
KCJBDOBN_3380.01.00.0
KCJBDOBN_3390.01.00.0
KCJBDOBN_3400.01.00.0
KCJBDOBN_3410.01.00.0
KCJBDOBN_3420.01.00.0
KCJBDOBN_3440.01.00.0
KCJBDOBN_3450.01.00.0
KCJBDOBN_3461.00.01.0
KCJBDOBN_3471.00.01.0
KCJBDOBN_3481.00.01.0
KCJBDOBN_3500.01.00.0
KCJBDOBN_3510.01.00.0
KCJBDOBN_3521.00.01.0
KCJBDOBN_3530.01.00.0
KCJBDOBN_3540.01.00.0
KCJBDOBN_3551.00.01.0
KCJBDOBN_3560.01.00.0
KCJBDOBN_3620.01.00.0
KCJBDOBN_3630.01.00.0
KCJBDOBN_3640.01.00.0
KCJBDOBN_3650.01.00.0
KCJBDOBN_3661.00.01.0
KCJBDOBN_3670.01.00.0
KCJBDOBN_3680.01.00.0
KCJBDOBN_3690.01.00.0
KCJBDOBN_3700.01.00.0
KCJBDOBN_3711.00.01.0
KCJBDOBN_3720.01.00.0
KCJBDOBN_3730.01.00.0
KCJBDOBN_3740.01.00.0
KCJBDOBN_3751.00.01.0
KCJBDOBN_3761.00.01.0
KCJBDOBN_3771.00.01.0
KCJBDOBN_3781.00.01.0
KCJBDOBN_3790.01.00.0
KCJBDOBN_3800.01.00.0
KCJBDOBN_3810.01.00.0
KCJBDOBN_3820.01.00.0
KCJBDOBN_3830.01.00.0
KCJBDOBN_3840.01.00.0
KCJBDOBN_3870.01.00.0
KCJBDOBN_3880.01.00.0
KCJBDOBN_3911.00.01.0
KCJBDOBN_3921.00.01.0
KCJBDOBN_3930.01.00.0
KCJBDOBN_3940.01.00.0
KCJBDOBN_3950.01.00.0
KCJBDOBN_3961.00.01.0
KCJBDOBN_3971.00.01.0
KCJBDOBN_3981.00.01.0
KCJBDOBN_3991.00.01.0
KCJBDOBN_4000.01.00.0
KCJBDOBN_4011.00.01.0
KCJBDOBN_4020.01.00.0
KCJBDOBN_4031.00.01.0
KCJBDOBN_4040.01.00.0
KCJBDOBN_4060.01.00.0
KCJBDOBN_4071.00.01.0
KCJBDOBN_4080.01.00.0
KCJBDOBN_4090.01.00.0
KCJBDOBN_4100.01.00.0
KCJBDOBN_4110.01.00.0
KCJBDOBN_4120.01.00.0
KCJBDOBN_4131.00.01.0
KCJBDOBN_4141.00.01.0
KCJBDOBN_4151.00.01.0
KCJBDOBN_4161.00.01.0
KCJBDOBN_4170.01.00.0
KCJBDOBN_4180.01.00.0
KCJBDOBN_4190.01.00.0
KCJBDOBN_4201.00.01.0
KCJBDOBN_4210.01.00.0
KCJBDOBN_4220.01.00.0
KCJBDOBN_4240.01.00.0
KCJBDOBN_4250.01.00.0
KCJBDOBN_4260.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
KCJBDOBN_11472019013FalseUnknownVOG4772,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements