Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
OCCFFAFD_20.01.00.0
OCCFFAFD_50.01.00.0
OCCFFAFD_60.01.00.0
OCCFFAFD_70.01.00.0
OCCFFAFD_80.01.00.0
OCCFFAFD_90.01.00.0
OCCFFAFD_100.01.00.0
OCCFFAFD_110.01.00.0
OCCFFAFD_121.00.01.0
OCCFFAFD_130.01.00.0
OCCFFAFD_140.01.00.0
OCCFFAFD_151.00.01.0
OCCFFAFD_160.01.00.0
OCCFFAFD_171.00.01.0
OCCFFAFD_180.01.00.0
OCCFFAFD_190.01.00.0
OCCFFAFD_200.01.00.0
OCCFFAFD_210.01.00.0
OCCFFAFD_220.01.00.0
OCCFFAFD_230.01.00.0
OCCFFAFD_250.01.00.0
OCCFFAFD_260.01.00.0
OCCFFAFD_270.01.00.0
OCCFFAFD_280.01.00.0
OCCFFAFD_290.01.00.0
OCCFFAFD_300.01.00.0
OCCFFAFD_310.01.00.0
OCCFFAFD_361.00.01.0
OCCFFAFD_381.00.01.0
OCCFFAFD_390.01.00.0
OCCFFAFD_400.01.00.0
OCCFFAFD_410.01.00.0
OCCFFAFD_420.01.00.0
OCCFFAFD_430.01.00.0
OCCFFAFD_440.01.00.0
OCCFFAFD_450.01.00.0
OCCFFAFD_460.01.00.0
OCCFFAFD_470.01.00.0
OCCFFAFD_480.01.00.0
OCCFFAFD_490.01.00.0
OCCFFAFD_501.00.01.0
OCCFFAFD_520.01.00.0
OCCFFAFD_531.00.01.0
OCCFFAFD_540.01.00.0
OCCFFAFD_551.00.01.0
OCCFFAFD_560.01.00.0
OCCFFAFD_570.01.00.0
OCCFFAFD_580.01.00.0
OCCFFAFD_600.01.00.0
OCCFFAFD_610.01.00.0
OCCFFAFD_620.01.00.0
OCCFFAFD_630.01.00.0
OCCFFAFD_650.01.00.0
OCCFFAFD_660.01.00.0
OCCFFAFD_670.01.00.0
OCCFFAFD_680.01.00.0
OCCFFAFD_690.01.00.0
OCCFFAFD_700.01.00.0
OCCFFAFD_710.01.00.0
OCCFFAFD_720.01.00.0
OCCFFAFD_730.01.00.0
OCCFFAFD_740.01.00.0
OCCFFAFD_750.01.00.0
OCCFFAFD_760.01.00.0
OCCFFAFD_771.00.01.0
OCCFFAFD_781.00.01.0
OCCFFAFD_790.01.00.0
OCCFFAFD_821.00.01.0
OCCFFAFD_830.01.00.0
OCCFFAFD_840.01.00.0
OCCFFAFD_850.01.00.0
OCCFFAFD_861.00.01.0
OCCFFAFD_871.00.01.0
OCCFFAFD_881.00.01.0
OCCFFAFD_891.00.01.0
OCCFFAFD_900.01.00.0
OCCFFAFD_911.00.01.0
OCCFFAFD_921.00.01.0
OCCFFAFD_930.01.00.0
OCCFFAFD_940.01.00.0
OCCFFAFD_960.01.00.0
OCCFFAFD_970.01.00.0
OCCFFAFD_980.01.00.0
OCCFFAFD_990.01.00.0
OCCFFAFD_1000.01.00.0
OCCFFAFD_1010.01.00.0
OCCFFAFD_1020.01.00.0
OCCFFAFD_1030.01.00.0
OCCFFAFD_1041.00.01.0
OCCFFAFD_1051.00.01.0
OCCFFAFD_1101.00.01.0
OCCFFAFD_1121.00.01.0
OCCFFAFD_1130.01.00.0
OCCFFAFD_1141.00.01.0
OCCFFAFD_1151.00.01.0
OCCFFAFD_1171.00.01.0
OCCFFAFD_1181.00.01.0
OCCFFAFD_1191.00.01.0
OCCFFAFD_1221.00.01.0
OCCFFAFD_1230.01.00.0
OCCFFAFD_1240.01.00.0
OCCFFAFD_1271.00.01.0
OCCFFAFD_1281.00.01.0
OCCFFAFD_1290.01.00.0
OCCFFAFD_1311.00.01.0
OCCFFAFD_1350.01.00.0
OCCFFAFD_1361.00.01.0
OCCFFAFD_1371.00.01.0
OCCFFAFD_1380.01.00.0
OCCFFAFD_1401.00.01.0
OCCFFAFD_1460.01.00.0
OCCFFAFD_1500.01.00.0
OCCFFAFD_1511.00.01.0
OCCFFAFD_1541.00.01.0
OCCFFAFD_1580.01.00.0
OCCFFAFD_1601.00.01.0
OCCFFAFD_1631.00.01.0
OCCFFAFD_1680.01.00.0
OCCFFAFD_1791.00.01.0
OCCFFAFD_1840.01.00.0
OCCFFAFD_1900.01.00.0
OCCFFAFD_1921.00.01.0
OCCFFAFD_2011.00.01.0
OCCFFAFD_2120.01.00.0
OCCFFAFD_2210.01.00.0
OCCFFAFD_2220.01.00.0
OCCFFAFD_2230.01.00.0
OCCFFAFD_2240.01.00.0
OCCFFAFD_2250.01.00.0
OCCFFAFD_2260.01.00.0
OCCFFAFD_2270.01.00.0
OCCFFAFD_2280.01.00.0
OCCFFAFD_2290.01.00.0
OCCFFAFD_2310.01.00.0
OCCFFAFD_2320.01.00.0
OCCFFAFD_2340.01.00.0
OCCFFAFD_2350.01.00.0
OCCFFAFD_2380.01.00.0
OCCFFAFD_2400.01.00.0
OCCFFAFD_2410.01.00.0
OCCFFAFD_2420.01.00.0
OCCFFAFD_2440.01.00.0
OCCFFAFD_2450.01.00.0
OCCFFAFD_2460.01.00.0
OCCFFAFD_2471.00.01.0
OCCFFAFD_2480.01.00.0
OCCFFAFD_2490.01.00.0
OCCFFAFD_2500.01.00.0
OCCFFAFD_2510.01.00.0
OCCFFAFD_2520.01.00.0
OCCFFAFD_2530.01.00.0
OCCFFAFD_2540.01.00.0
OCCFFAFD_2550.01.00.0
OCCFFAFD_2560.01.00.0
OCCFFAFD_2570.01.00.0
OCCFFAFD_2580.01.00.0
OCCFFAFD_2600.01.00.0
OCCFFAFD_2610.01.00.0
OCCFFAFD_2620.01.00.0
OCCFFAFD_2631.00.01.0
OCCFFAFD_2640.01.00.0
OCCFFAFD_2650.01.00.0
OCCFFAFD_2660.01.00.0
OCCFFAFD_2670.01.00.0
OCCFFAFD_2680.01.00.0
OCCFFAFD_2690.01.00.0
OCCFFAFD_2711.00.01.0
OCCFFAFD_2720.01.00.0
OCCFFAFD_2730.01.00.0
OCCFFAFD_2740.01.00.0
OCCFFAFD_2750.01.00.0
OCCFFAFD_2760.01.00.0
OCCFFAFD_2770.01.00.0
OCCFFAFD_2780.01.00.0
OCCFFAFD_2790.01.00.0
OCCFFAFD_2800.01.00.0
OCCFFAFD_2810.01.00.0
OCCFFAFD_2820.01.00.0
OCCFFAFD_2830.01.00.0
OCCFFAFD_2841.00.01.0
OCCFFAFD_2850.01.00.0
OCCFFAFD_2860.01.00.0
OCCFFAFD_2870.01.00.0
OCCFFAFD_2880.01.00.0
OCCFFAFD_2891.00.01.0
OCCFFAFD_2900.01.00.0
OCCFFAFD_2910.01.00.0
OCCFFAFD_2920.01.00.0
OCCFFAFD_2930.01.00.0
OCCFFAFD_2940.01.00.0
OCCFFAFD_2950.01.00.0
OCCFFAFD_2960.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements