Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
FEKNOOML_17936394343WalR1.08e-113transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
FEKNOOML_287323520CspR2.48e-34cold shock protein89.39100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
FEKNOOML_45827023763repUS741064 / 106293.61CP000424
FEKNOOML_369427947repUS53521 / 66686.56AY425961

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
FEKNOOML_81.00.01.0
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FEKNOOML_350.01.00.0
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FEKNOOML_400.01.00.0
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FEKNOOML_4600.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
FEKNOOML_272342518074FalseSiphoviridaeVOG0204, VOG4589, VOG1898, VOG4545, VOG4633, VOG4763, VOG4763, VOG3498, VOG0648, VOG1637, VOG0054, VOG4649
FEKNOOML_294561026344FalseSiphoviridaeVOG6495, VOG2338, VOG1309, VOG0186, VOG4855, VOG0226, VOG9860, VOG0536, VOG9741, VOG0152, VOG3643, VOG1183, VOG0044, VOG1563, VOG0198, VOG6579, VOG4570, VOG3699, VOG10227, VOG0720, VOG4564, VOG4555, VOG0694, VOG1322, VOG4713, VOG1320, VOG9583, VOG1321, VOG0799

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements