Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 0 | 0 | 2 | 2.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| JMNGKCJH_160 | 46667 | 47371 | WalR | 5.14e-113 | transcriptional regulatory protein | 83.40 | 100.00 | EPH95667 |
| JMNGKCJH_2 | 15070 | 15267 | CspR | 9.92e-34 | cold shock protein | 89.39 | 100.00 | AAO82613 |
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| JMNGKCJH_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_4 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_5 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_7 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_8 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_9 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_10 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_11 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_12 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_68 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_85 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_94 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_96 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_99 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_109 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_117 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_125 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_126 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_127 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_128 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_129 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_130 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_132 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_133 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_134 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_136 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_141 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_142 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_143 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_146 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_147 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_148 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_153 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_154 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_155 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_157 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_159 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_160 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_161 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_162 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_164 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_165 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_166 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_167 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMNGKCJH_169 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMNGKCJH_170 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| JMNGKCJH_57 | 47110 | 53601 | False | Siphoviridae | VOG9667, VOG1309, VOG0186, VOG4566, VOG6238, VOG1638, VOG8987, VOG11003, VOG9860, VOG0536 |
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)