Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
FKCDADPL_80121057121761WalR9.09e-115transcriptional regulatory protein84.25100.00EPH95667
FKCDADPL_8370217215CspR9.33e-31cold shock protein84.6198.48AAO82613
FKCDADPL_8370217218CspA1.43e-30cold shock protein84.85100.00CAA62903

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
FKCDADPL_10.01.00.0
FKCDADPL_20.01.00.0
FKCDADPL_30.01.00.0
FKCDADPL_40.01.00.0
FKCDADPL_60.01.00.0
FKCDADPL_71.00.01.0
FKCDADPL_80.01.00.0
FKCDADPL_90.01.00.0
FKCDADPL_100.01.00.0
FKCDADPL_110.01.00.0
FKCDADPL_120.01.00.0
FKCDADPL_130.01.00.0
FKCDADPL_160.01.00.0
FKCDADPL_200.01.00.0
FKCDADPL_210.01.00.0
FKCDADPL_220.01.00.0
FKCDADPL_240.01.00.0
FKCDADPL_260.01.00.0
FKCDADPL_290.01.00.0
FKCDADPL_330.01.00.0
FKCDADPL_360.01.00.0
FKCDADPL_370.01.00.0
FKCDADPL_380.01.00.0
FKCDADPL_410.01.00.0
FKCDADPL_420.01.00.0
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FKCDADPL_460.01.00.0
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FKCDADPL_770.01.00.0
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FKCDADPL_791.00.01.0
FKCDADPL_800.01.00.0
FKCDADPL_810.01.00.0
FKCDADPL_820.01.00.0
FKCDADPL_830.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
FKCDADPL_126650194518FalseSiphoviridaeVOG0602, VOG1637, VOG8917, VOG9997, VOG3498, VOG4619, VOG0801, VOG6163, VOG0541, VOG4586, VOG0704, VOG0539, VOG4589, VOG0562, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG4844, VOG4673, VOG3643, VOG0044, VOG0327, VOG4609, VOG4632, VOG6545
FKCDADPL_53166911197609FalseSiphoviridaeVOG10957, VOG4599, VOG4605, VOG5904, VOG0660, VOG0209, VOG4586, VOG0207, VOG0205, VOG0204, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG0202, VOG1886, VOG4581, VOG4841, VOG7466, VOG0198, VOG4799, VOG0514, VOG0226, VOG0283, VOG0685, VOG1302
FKCDADPL_80108964120137FalseSiphoviridaeVOG4632, VOG4609, VOG0205, VOG4841, VOG4581, VOG4544, VOG2935, VOG4556, VOG4568, VOG0204, VOG0198

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements