Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
MBOFGINP_2021458213878WalR1.98e-113transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
MBOFGINP_27933373534CspR4.81e-34cold shock protein87.88100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
MBOFGINP_3224891413repUS64930 / 95485.48JN601038
MBOFGINP_2650346068rep381046 / 110481.64CP002655

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
MBOFGINP_30.01.00.0
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MBOFGINP_3221.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
MBOFGINP_2291917156989FalseSiphoviridaeVOG0249, VOG4918, VOG0703, VOG1637, VOG7896, VOG6455, VOG4599, VOG4605, VOG6163, VOG0660, VOG0209, VOG4586, VOG0207, VOG4945, VOG0205, VOG0204, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG7540, VOG1886, VOG4581, VOG4841, VOG1345, VOG4549, VOG10904, VOG4570, VOG0198, VOG0044, VOG3643, VOG3643, VOG3307, VOG4693, VOG6623, VOG9860, VOG4584, VOG0189, VOG4566, VOG10904, VOG0226, VOG0322, VOG0321, VOG3642, VOG4967, VOG10867, VOG0181, VOG4552, VOG4552, VOG3622

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements