Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0011.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
ECMNMBHF_524260141897WalR5.91e-113transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
ECMNMBHF_1632569826624IMPDH0.0inosine-5'-monophosphate dehydrogenase81.2362.47ADE32434

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
ECMNMBHF_81029611330rep381046 / 110482.60CP002655

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
ECMNMBHF_11.00.01.0
ECMNMBHF_21.00.01.0
ECMNMBHF_30.01.00.0
ECMNMBHF_40.01.00.0
ECMNMBHF_51.00.01.0
ECMNMBHF_60.01.00.0
ECMNMBHF_81.00.01.0
ECMNMBHF_90.01.00.0
ECMNMBHF_131.00.01.0
ECMNMBHF_150.01.00.0
ECMNMBHF_161.00.01.0
ECMNMBHF_171.00.01.0
ECMNMBHF_180.01.00.0
ECMNMBHF_191.00.01.0
ECMNMBHF_200.01.00.0
ECMNMBHF_210.01.00.0
ECMNMBHF_220.01.00.0
ECMNMBHF_230.01.00.0
ECMNMBHF_241.00.01.0
ECMNMBHF_250.01.00.0
ECMNMBHF_270.01.00.0
ECMNMBHF_280.01.00.0
ECMNMBHF_290.01.00.0
ECMNMBHF_300.01.00.0
ECMNMBHF_310.01.00.0
ECMNMBHF_320.01.00.0
ECMNMBHF_330.01.00.0
ECMNMBHF_340.01.00.0
ECMNMBHF_350.01.00.0
ECMNMBHF_360.01.00.0
ECMNMBHF_370.01.00.0
ECMNMBHF_380.01.00.0
ECMNMBHF_390.01.00.0
ECMNMBHF_400.01.00.0
ECMNMBHF_410.01.00.0
ECMNMBHF_420.01.00.0
ECMNMBHF_430.01.00.0
ECMNMBHF_440.01.00.0
ECMNMBHF_450.01.00.0
ECMNMBHF_460.01.00.0
ECMNMBHF_470.01.00.0
ECMNMBHF_480.01.00.0
ECMNMBHF_490.01.00.0
ECMNMBHF_501.00.01.0
ECMNMBHF_510.01.00.0
ECMNMBHF_520.01.00.0
ECMNMBHF_530.01.00.0
ECMNMBHF_540.01.00.0
ECMNMBHF_550.01.00.0
ECMNMBHF_561.00.01.0
ECMNMBHF_570.01.00.0
ECMNMBHF_580.01.00.0
ECMNMBHF_591.00.01.0
ECMNMBHF_600.01.00.0
ECMNMBHF_610.01.00.0
ECMNMBHF_620.01.00.0
ECMNMBHF_630.01.00.0
ECMNMBHF_641.00.01.0
ECMNMBHF_650.01.00.0
ECMNMBHF_660.01.00.0
ECMNMBHF_670.01.00.0
ECMNMBHF_680.01.00.0
ECMNMBHF_691.00.01.0
ECMNMBHF_700.01.00.0
ECMNMBHF_710.01.00.0
ECMNMBHF_720.01.00.0
ECMNMBHF_730.01.00.0
ECMNMBHF_740.01.00.0
ECMNMBHF_751.00.01.0
ECMNMBHF_761.00.01.0
ECMNMBHF_770.01.00.0
ECMNMBHF_781.00.01.0
ECMNMBHF_790.01.00.0
ECMNMBHF_800.01.00.0
ECMNMBHF_810.01.00.0
ECMNMBHF_821.00.01.0
ECMNMBHF_841.00.01.0
ECMNMBHF_850.01.00.0
ECMNMBHF_860.01.00.0
ECMNMBHF_880.01.00.0
ECMNMBHF_890.01.00.0
ECMNMBHF_910.01.00.0
ECMNMBHF_920.01.00.0
ECMNMBHF_930.01.00.0
ECMNMBHF_940.01.00.0
ECMNMBHF_950.01.00.0
ECMNMBHF_970.01.00.0
ECMNMBHF_980.01.00.0
ECMNMBHF_990.01.00.0
ECMNMBHF_1000.01.00.0
ECMNMBHF_1010.01.00.0
ECMNMBHF_1020.01.00.0
ECMNMBHF_1030.01.00.0
ECMNMBHF_1041.00.01.0
ECMNMBHF_1050.01.00.0
ECMNMBHF_1060.01.00.0
ECMNMBHF_1071.00.01.0
ECMNMBHF_1080.01.00.0
ECMNMBHF_1090.01.00.0
ECMNMBHF_1100.01.00.0
ECMNMBHF_1111.00.01.0
ECMNMBHF_1120.01.00.0
ECMNMBHF_1131.00.01.0
ECMNMBHF_1140.01.00.0
ECMNMBHF_1150.01.00.0
ECMNMBHF_1160.01.00.0
ECMNMBHF_1170.01.00.0
ECMNMBHF_1190.01.00.0
ECMNMBHF_1200.01.00.0
ECMNMBHF_1210.01.00.0
ECMNMBHF_1221.00.01.0
ECMNMBHF_1240.01.00.0
ECMNMBHF_1250.01.00.0
ECMNMBHF_1260.01.00.0
ECMNMBHF_1270.01.00.0
ECMNMBHF_1280.01.00.0
ECMNMBHF_1290.01.00.0
ECMNMBHF_1300.01.00.0
ECMNMBHF_1310.01.00.0
ECMNMBHF_1320.01.00.0
ECMNMBHF_1330.01.00.0
ECMNMBHF_1340.01.00.0
ECMNMBHF_1351.00.01.0
ECMNMBHF_1360.01.00.0
ECMNMBHF_1370.01.00.0
ECMNMBHF_1380.01.00.0
ECMNMBHF_1390.01.00.0
ECMNMBHF_1400.01.00.0
ECMNMBHF_1410.01.00.0
ECMNMBHF_1420.01.00.0
ECMNMBHF_1430.01.00.0
ECMNMBHF_1440.01.00.0
ECMNMBHF_1460.01.00.0
ECMNMBHF_1470.01.00.0
ECMNMBHF_1480.01.00.0
ECMNMBHF_1490.01.00.0
ECMNMBHF_1501.00.01.0
ECMNMBHF_1510.01.00.0
ECMNMBHF_1520.01.00.0
ECMNMBHF_1530.01.00.0
ECMNMBHF_1541.00.01.0
ECMNMBHF_1550.01.00.0
ECMNMBHF_1560.01.00.0
ECMNMBHF_1580.01.00.0
ECMNMBHF_1590.01.00.0
ECMNMBHF_1600.01.00.0
ECMNMBHF_1610.01.00.0
ECMNMBHF_1620.01.00.0
ECMNMBHF_1630.01.00.0
ECMNMBHF_1640.01.00.0
ECMNMBHF_1650.01.00.0
ECMNMBHF_1660.01.00.0
ECMNMBHF_1670.01.00.0
ECMNMBHF_1680.01.00.0
ECMNMBHF_1690.01.00.0
ECMNMBHF_1700.01.00.0
ECMNMBHF_1710.01.00.0
ECMNMBHF_1720.01.00.0
ECMNMBHF_1730.01.00.0
ECMNMBHF_1740.01.00.0
ECMNMBHF_1751.00.01.0
ECMNMBHF_1760.01.00.0
ECMNMBHF_1770.01.00.0
ECMNMBHF_1780.01.00.0
ECMNMBHF_1800.01.00.0
ECMNMBHF_1820.01.00.0
ECMNMBHF_1830.01.00.0
ECMNMBHF_1840.01.00.0
ECMNMBHF_1850.01.00.0
ECMNMBHF_1860.01.00.0
ECMNMBHF_1870.01.00.0
ECMNMBHF_1880.01.00.0
ECMNMBHF_1890.01.00.0
ECMNMBHF_1910.01.00.0
ECMNMBHF_1930.01.00.0
ECMNMBHF_1940.01.00.0
ECMNMBHF_1950.01.00.0
ECMNMBHF_1960.01.00.0
ECMNMBHF_1970.01.00.0
ECMNMBHF_1980.01.00.0
ECMNMBHF_1990.01.00.0
ECMNMBHF_2000.01.00.0
ECMNMBHF_2010.01.00.0
ECMNMBHF_2020.01.00.0
ECMNMBHF_2030.01.00.0
ECMNMBHF_2040.01.00.0
ECMNMBHF_2050.01.00.0
ECMNMBHF_2060.01.00.0
ECMNMBHF_2080.01.00.0
ECMNMBHF_2090.01.00.0
ECMNMBHF_2100.01.00.0
ECMNMBHF_2110.01.00.0
ECMNMBHF_2120.01.00.0
ECMNMBHF_2130.01.00.0
ECMNMBHF_2140.01.00.0
ECMNMBHF_2150.01.00.0
ECMNMBHF_2190.01.00.0
ECMNMBHF_2200.01.00.0
ECMNMBHF_2210.01.00.0
ECMNMBHF_2220.01.00.0
ECMNMBHF_2240.01.00.0
ECMNMBHF_2251.00.01.0
ECMNMBHF_2261.00.01.0
ECMNMBHF_2271.00.01.0
ECMNMBHF_2291.00.01.0
ECMNMBHF_2300.01.00.0
ECMNMBHF_2310.01.00.0
ECMNMBHF_2320.01.00.0
ECMNMBHF_2330.01.00.0
ECMNMBHF_2341.00.01.0
ECMNMBHF_2350.01.00.0
ECMNMBHF_2360.01.00.0
ECMNMBHF_2371.00.01.0
ECMNMBHF_2381.00.01.0
ECMNMBHF_2390.01.00.0
ECMNMBHF_2400.01.00.0
ECMNMBHF_2410.01.00.0
ECMNMBHF_2420.01.00.0
ECMNMBHF_2430.01.00.0
ECMNMBHF_2440.01.00.0
ECMNMBHF_2450.01.00.0
ECMNMBHF_2460.01.00.0
ECMNMBHF_2470.01.00.0
ECMNMBHF_2480.01.00.0
ECMNMBHF_2490.01.00.0
ECMNMBHF_2500.01.00.0
ECMNMBHF_2510.01.00.0
ECMNMBHF_2520.01.00.0
ECMNMBHF_2530.01.00.0
ECMNMBHF_2540.01.00.0
ECMNMBHF_2560.01.00.0
ECMNMBHF_2570.01.00.0
ECMNMBHF_2580.01.00.0
ECMNMBHF_2600.01.00.0
ECMNMBHF_2620.01.00.0
ECMNMBHF_2630.01.00.0
ECMNMBHF_2640.01.00.0
ECMNMBHF_2650.01.00.0
ECMNMBHF_2661.00.01.0
ECMNMBHF_2670.01.00.0
ECMNMBHF_2680.01.00.0
ECMNMBHF_2690.01.00.0
ECMNMBHF_2700.01.00.0
ECMNMBHF_2710.01.00.0
ECMNMBHF_2720.01.00.0
ECMNMBHF_2730.01.00.0
ECMNMBHF_2740.01.00.0
ECMNMBHF_2750.01.00.0
ECMNMBHF_2760.01.00.0
ECMNMBHF_2770.01.00.0
ECMNMBHF_2780.01.00.0
ECMNMBHF_2790.01.00.0
ECMNMBHF_2800.01.00.0
ECMNMBHF_2810.01.00.0
ECMNMBHF_2820.01.00.0
ECMNMBHF_2830.01.00.0
ECMNMBHF_2840.01.00.0
ECMNMBHF_2850.01.00.0
ECMNMBHF_2860.01.00.0
ECMNMBHF_2870.01.00.0
ECMNMBHF_2880.01.00.0
ECMNMBHF_2890.01.00.0
ECMNMBHF_2900.01.00.0
ECMNMBHF_2910.01.00.0
ECMNMBHF_2930.01.00.0
ECMNMBHF_2940.01.00.0
ECMNMBHF_2950.01.00.0
ECMNMBHF_2960.01.00.0
ECMNMBHF_2970.01.00.0
ECMNMBHF_2980.01.00.0
ECMNMBHF_2990.01.00.0
ECMNMBHF_3000.01.00.0
ECMNMBHF_3011.00.01.0
ECMNMBHF_3020.01.00.0
ECMNMBHF_3031.00.01.0
ECMNMBHF_3070.01.00.0
ECMNMBHF_3080.01.00.0
ECMNMBHF_3111.00.01.0
ECMNMBHF_3121.00.01.0
ECMNMBHF_3160.01.00.0
ECMNMBHF_3180.01.00.0
ECMNMBHF_3210.01.00.0
ECMNMBHF_3220.01.00.0
ECMNMBHF_3240.01.00.0
ECMNMBHF_3270.01.00.0
ECMNMBHF_3281.00.01.0
ECMNMBHF_3310.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
ECMNMBHF_107760017847FalseSiphoviridaeVOG4589, VOG0204, VOG4568, VOG4556, VOG5051, VOG4544, VOG4581, VOG4609, VOG4632
ECMNMBHF_160224330309FalseSiphoviridaeVOG4586, VOG0207, VOG0205, VOG9975, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG1886, VOG4581, VOG4841, VOG1345, VOG4549, VOG10904, VOG4570, VOG0198, VOG0044, VOG3643, VOG0152, VOG4567, VOG9741, VOG9759, VOG4813, VOG4693, VOG7735, VOG0025, VOG4799, VOG0226, VOG0322, VOG0321, VOG3642, VOG4967, VOG10867, VOG0181, VOG3459, VOG3711, VOG4552, VOG4552, VOG11003, VOG6495, VOG8483

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements