Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
EHLMDOOL_2555664655942WalR1.52e-112transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
EHLMDOOL_27162326429CspR7.70e-34cold shock protein87.88100.00AAO82613
EHLMDOOL_2921669OadB7.17e-119Na+ membrane pump80.7261.77AAX97432

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
EHLMDOOL_20.01.00.0
EHLMDOOL_30.01.00.0
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EHLMDOOL_3440.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
EHLMDOOL_1371584222410FalseSiphoviridaeVOG4589, VOG0204, VOG4568, VOG4556, VOG5051, VOG4544
EHLMDOOL_26383436727FalseSiphoviridaeVOG4918, VOG0638, VOG0054, VOG5008, VOG4828, VOG4633, VOG6163, VOG2225, VOG4586, VOG0704, VOG0539, VOG4589, VOG0204, VOG5601, VOG4553, VOG4568, VOG4556, VOG3644, VOG4544, VOG4581, VOG4841, VOG4549, VOG10904, VOG4570, VOG0198, VOG3643, VOG2820, VOG9759, VOG9741, VOG4693, VOG6623, VOG7018, VOG7735, VOG0025, VOG4799, VOG3642, VOG10867, VOG0181, VOG5423, VOG4552, VOG4552

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements