Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
BGKKHJAO_146175651rep381048 / 110480.63CP002655

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
BGKKHJAO_10.01.00.0
BGKKHJAO_20.01.00.0
BGKKHJAO_30.01.00.0
BGKKHJAO_40.01.00.0
BGKKHJAO_50.01.00.0
BGKKHJAO_60.01.00.0
BGKKHJAO_70.01.00.0
BGKKHJAO_80.01.00.0
BGKKHJAO_90.01.00.0
BGKKHJAO_100.01.00.0
BGKKHJAO_110.01.00.0
BGKKHJAO_120.01.00.0
BGKKHJAO_130.01.00.0
BGKKHJAO_140.01.00.0
BGKKHJAO_150.01.00.0
BGKKHJAO_160.01.00.0
BGKKHJAO_170.01.00.0
BGKKHJAO_181.00.01.0
BGKKHJAO_190.01.00.0
BGKKHJAO_200.01.00.0
BGKKHJAO_210.01.00.0
BGKKHJAO_220.01.00.0
BGKKHJAO_231.00.01.0
BGKKHJAO_240.01.00.0
BGKKHJAO_250.01.00.0
BGKKHJAO_260.01.00.0
BGKKHJAO_270.01.00.0
BGKKHJAO_280.01.00.0
BGKKHJAO_290.01.00.0
BGKKHJAO_300.01.00.0
BGKKHJAO_311.00.01.0
BGKKHJAO_320.01.00.0
BGKKHJAO_330.01.00.0
BGKKHJAO_340.01.00.0
BGKKHJAO_350.01.00.0
BGKKHJAO_360.01.00.0
BGKKHJAO_370.01.00.0
BGKKHJAO_380.01.00.0
BGKKHJAO_390.01.00.0
BGKKHJAO_400.01.00.0
BGKKHJAO_410.01.00.0
BGKKHJAO_420.01.00.0
BGKKHJAO_430.01.00.0
BGKKHJAO_440.01.00.0
BGKKHJAO_450.01.00.0
BGKKHJAO_460.01.00.0
BGKKHJAO_470.01.00.0
BGKKHJAO_480.01.00.0
BGKKHJAO_490.01.00.0
BGKKHJAO_500.01.00.0
BGKKHJAO_510.01.00.0
BGKKHJAO_520.01.00.0
BGKKHJAO_530.01.00.0
BGKKHJAO_540.01.00.0
BGKKHJAO_550.01.00.0
BGKKHJAO_560.01.00.0
BGKKHJAO_570.01.00.0
BGKKHJAO_580.01.00.0
BGKKHJAO_590.01.00.0
BGKKHJAO_601.00.01.0
BGKKHJAO_610.01.00.0
BGKKHJAO_620.01.00.0
BGKKHJAO_630.01.00.0
BGKKHJAO_640.01.00.0
BGKKHJAO_650.01.00.0
BGKKHJAO_660.01.00.0
BGKKHJAO_670.01.00.0
BGKKHJAO_680.01.00.0
BGKKHJAO_690.01.00.0
BGKKHJAO_700.01.00.0
BGKKHJAO_710.01.00.0
BGKKHJAO_720.01.00.0
BGKKHJAO_730.01.00.0
BGKKHJAO_740.01.00.0
BGKKHJAO_750.01.00.0
BGKKHJAO_760.01.00.0
BGKKHJAO_771.00.01.0
BGKKHJAO_780.01.00.0
BGKKHJAO_790.01.00.0
BGKKHJAO_801.00.01.0
BGKKHJAO_810.01.00.0
BGKKHJAO_820.01.00.0
BGKKHJAO_830.01.00.0
BGKKHJAO_840.01.00.0
BGKKHJAO_850.01.00.0
BGKKHJAO_860.01.00.0
BGKKHJAO_870.01.00.0
BGKKHJAO_880.01.00.0
BGKKHJAO_890.01.00.0
BGKKHJAO_901.00.01.0
BGKKHJAO_910.01.00.0
BGKKHJAO_920.01.00.0
BGKKHJAO_930.01.00.0
BGKKHJAO_940.01.00.0
BGKKHJAO_950.01.00.0
BGKKHJAO_960.01.00.0
BGKKHJAO_970.01.00.0
BGKKHJAO_980.01.00.0
BGKKHJAO_990.01.00.0
BGKKHJAO_1000.01.00.0
BGKKHJAO_1010.01.00.0
BGKKHJAO_1020.01.00.0
BGKKHJAO_1030.01.00.0
BGKKHJAO_1041.00.01.0
BGKKHJAO_1050.01.00.0
BGKKHJAO_1060.01.00.0
BGKKHJAO_1070.01.00.0
BGKKHJAO_1080.01.00.0
BGKKHJAO_1090.01.00.0
BGKKHJAO_1100.01.00.0
BGKKHJAO_1110.01.00.0
BGKKHJAO_1120.01.00.0
BGKKHJAO_1130.01.00.0
BGKKHJAO_1140.01.00.0
BGKKHJAO_1150.01.00.0
BGKKHJAO_1160.01.00.0
BGKKHJAO_1170.01.00.0
BGKKHJAO_1190.01.00.0
BGKKHJAO_1200.01.00.0
BGKKHJAO_1210.01.00.0
BGKKHJAO_1220.01.00.0
BGKKHJAO_1230.01.00.0
BGKKHJAO_1240.01.00.0
BGKKHJAO_1251.00.01.0
BGKKHJAO_1260.01.00.0
BGKKHJAO_1271.00.01.0
BGKKHJAO_1280.01.00.0
BGKKHJAO_1291.00.01.0
BGKKHJAO_1300.01.00.0
BGKKHJAO_1310.01.00.0
BGKKHJAO_1320.01.00.0
BGKKHJAO_1330.01.00.0
BGKKHJAO_1340.01.00.0
BGKKHJAO_1350.01.00.0
BGKKHJAO_1361.00.01.0
BGKKHJAO_1370.01.00.0
BGKKHJAO_1380.01.00.0
BGKKHJAO_1390.01.00.0
BGKKHJAO_1400.01.00.0
BGKKHJAO_1410.01.00.0
BGKKHJAO_1420.01.00.0
BGKKHJAO_1430.01.00.0
BGKKHJAO_1440.01.00.0
BGKKHJAO_1450.01.00.0
BGKKHJAO_1460.01.00.0
BGKKHJAO_1470.01.00.0
BGKKHJAO_1481.00.01.0
BGKKHJAO_1490.01.00.0
BGKKHJAO_1500.01.00.0
BGKKHJAO_1510.01.00.0
BGKKHJAO_1521.00.01.0
BGKKHJAO_1530.01.00.0
BGKKHJAO_1541.00.01.0
BGKKHJAO_1551.00.01.0
BGKKHJAO_1560.01.00.0
BGKKHJAO_1571.00.01.0
BGKKHJAO_1580.01.00.0
BGKKHJAO_1590.01.00.0
BGKKHJAO_1601.00.01.0
BGKKHJAO_1611.00.01.0
BGKKHJAO_1621.00.01.0
BGKKHJAO_1630.01.00.0
BGKKHJAO_1640.01.00.0
BGKKHJAO_1651.00.01.0
BGKKHJAO_1661.00.01.0
BGKKHJAO_1671.00.01.0
BGKKHJAO_1680.01.00.0
BGKKHJAO_1691.00.01.0
BGKKHJAO_1700.01.00.0
BGKKHJAO_1711.00.01.0
BGKKHJAO_1720.01.00.0
BGKKHJAO_1730.01.00.0
BGKKHJAO_1740.01.00.0
BGKKHJAO_1750.01.00.0
BGKKHJAO_1761.00.01.0
BGKKHJAO_1770.01.00.0
BGKKHJAO_1780.01.00.0
BGKKHJAO_1790.01.00.0
BGKKHJAO_1800.01.00.0
BGKKHJAO_1810.01.00.0
BGKKHJAO_1821.00.01.0
BGKKHJAO_1831.00.01.0
BGKKHJAO_1840.01.00.0
BGKKHJAO_1850.01.00.0
BGKKHJAO_1860.01.00.0
BGKKHJAO_1871.00.01.0
BGKKHJAO_1880.01.00.0
BGKKHJAO_1890.01.00.0
BGKKHJAO_1901.00.01.0
BGKKHJAO_1911.00.01.0
BGKKHJAO_1920.01.00.0
BGKKHJAO_1930.01.00.0
BGKKHJAO_1940.01.00.0
BGKKHJAO_1951.00.01.0
BGKKHJAO_1960.01.00.0
BGKKHJAO_1970.01.00.0
BGKKHJAO_1980.01.00.0
BGKKHJAO_1990.01.00.0
BGKKHJAO_2000.01.00.0
BGKKHJAO_2011.00.01.0
BGKKHJAO_2020.01.00.0
BGKKHJAO_2031.00.01.0
BGKKHJAO_2040.01.00.0
BGKKHJAO_2051.00.01.0
BGKKHJAO_2061.00.01.0
BGKKHJAO_2070.01.00.0
BGKKHJAO_2080.01.00.0
BGKKHJAO_2090.01.00.0
BGKKHJAO_2101.00.01.0
BGKKHJAO_2110.01.00.0
BGKKHJAO_2121.00.01.0
BGKKHJAO_2130.01.00.0
BGKKHJAO_2140.01.00.0
BGKKHJAO_2150.01.00.0
BGKKHJAO_2161.00.01.0
BGKKHJAO_2170.01.00.0
BGKKHJAO_2181.00.01.0
BGKKHJAO_2191.00.01.0
BGKKHJAO_2200.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
BGKKHJAO_18449916819FalseSiphoviridaeVOG0198, VOG9779, VOG6005, VOG0327, VOG10904, VOG4966, VOG4609, VOG4632, VOG6545, VOG0322, VOG10904, VOG6495, VOG6394, VOG4548, VOG0321, VOG2228

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements