Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
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GBHEOBOC_1860.01.00.0
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PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
GBHEOBOC_1944843539FalseMyoviridaeVOG2228, VOG0321, VOG4548, VOG6450, VOG9747, VOG0322, VOG6545, VOG4632, VOG6495, VOG4609, VOG0327, VOG5461, VOG6005, VOG7186, VOG0198, VOG0796, VOG4544, VOG0720, VOG4564, VOG4555, VOG4572, VOG4623, VOG3888, VOG1900, VOG4870, VOG5612, VOG3890, VOG3891, VOG3892, VOG5793, VOG4865, VOG4885, VOG3894, VOG4550, VOG4691, VOG4862, VOG9945, VOG4705
GBHEOBOC_176409112007FalseMyoviridaeVOG7017, VOG0861, VOG4705, VOG9945, VOG5763, VOG4845, VOG4691, VOG4550, VOG0573, VOG1348, VOG1433, VOG1956, VOG6307, VOG9706, VOG4699, VOG1352, VOG1353, VOG4710, VOG1942, VOG6932, VOG1915, VOG4918, VOG4564, VOG1912, VOG7407, VOG4618, VOG4618, VOG4373, VOG0198, VOG10261, VOG0327, VOG8282, VOG5886, VOG3307, VOG4552, VOG6495, VOG9667, VOG4799, VOG0906
GBHEOBOC_51476140646FalseSiphoviridaeVOG0703, VOG7017, VOG0861, VOG4705, VOG8608, VOG4763, VOG7011, VOG4645, VOG4659, VOG4633, VOG4545, VOG0701, VOG9763, VOG0698, VOG0697, VOG0696, VOG0695, VOG1329, VOG9317, VOG0686, VOG0692, VOG0691, VOG4544, VOG5532

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements