Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 0 | 0 | 2 | 2.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HEGBPLAD_22 | 48574 | 49278 | WalR | 3.13e-115 | transcriptional regulatory protein | 84.25 | 100.00 | EPH95667 |
| HEGBPLAD_137 | 242 | 436 | CspR | 6.05e-31 | cold shock protein | 84.61 | 98.48 | AAO82613 |
| HEGBPLAD_137 | 242 | 439 | CspA | 9.28e-31 | cold shock protein | 84.85 | 100.00 | CAA62903 |
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| HEGBPLAD_20 | 1913 | 2839 | repUS64 | 928 / 954 | 88.90 | JN601038 |
| HEGBPLAD_18 | 3095 | 3753 | rep28 | 660 / 936 | 82.58 | CP005948 |
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| HEGBPLAD_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_4 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_6 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_14 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_15 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_16 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_17 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_18 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_20 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_21 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_26 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_27 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_28 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_34 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_35 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_37 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_38 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_40 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_41 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_42 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_43 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_45 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_46 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_49 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_50 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_51 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_52 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_53 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_54 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_57 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_59 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_60 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_61 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_62 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_94 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_96 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_109 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_125 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_126 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_127 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_129 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_132 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_134 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_136 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_138 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_141 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_143 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_146 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_147 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_148 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_153 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_154 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_155 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_158 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_159 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_160 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_161 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_162 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_167 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_169 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_171 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_172 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_173 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_175 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_176 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HEGBPLAD_177 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HEGBPLAD_178 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| HEGBPLAD_55 | 6074 | 45445 | False | Siphoviridae | VOG0205, VOG4581, VOG4544, VOG4556, VOG4553, VOG0204, VOG0198, VOG0275, VOG10653, VOG4602, VOG6495, VOG3556, VOG1638, VOG11003, VOG6495, VOG9655, VOG0181, VOG7298, VOG3049, VOG0283, VOG0226, VOG4566, VOG4552, VOG4693, VOG1599, VOG0044, VOG0198, VOG0796, VOG10227, VOG0720, VOG4564, VOG4555, VOG1329, VOG4713, VOG9583, VOG0724, VOG0799, VOG0725 |
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)