Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
EELJGKON_11266365932WalR4.78e-113transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
EELJGKON_4196159812CspR2.97e-34cold shock protein89.39100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
EELJGKON_14029514012repUS741062 / 106299.15CP000424

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
EELJGKON_10.01.00.0
EELJGKON_31.00.01.0
EELJGKON_51.00.01.0
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EELJGKON_1451.00.01.0
EELJGKON_1461.00.01.0
EELJGKON_1470.01.00.0
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EELJGKON_1501.00.01.0
EELJGKON_1510.01.00.0
EELJGKON_1540.01.00.0
EELJGKON_1550.01.00.0
EELJGKON_1561.00.01.0
EELJGKON_1570.01.00.0
EELJGKON_1581.00.01.0
EELJGKON_1591.00.01.0
EELJGKON_1611.00.01.0
EELJGKON_1641.00.01.0
EELJGKON_1651.00.01.0
EELJGKON_1661.00.01.0
EELJGKON_1691.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
EELJGKON_2875013104428FalseSiphoviridaeVOG3304, VOG0862, VOG5353, VOG0181, VOG10867, VOG4799, VOG0189, VOG0982, VOG1298, VOG1563, VOG0198, VOG7727, VOG5427, VOG3490, VOG4841, VOG0519, VOG4544, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG4589, VOG1898, VOG4545, VOG4633, VOG4763, VOG3498, VOG0648, VOG1637
EELJGKON_60219141FalseSiphoviridaeVOG4599, VOG4605, VOG4545, VOG0800, VOG0725, VOG0799, VOG0724, VOG5660, VOG0723, VOG4713, VOG1322, VOG1887, VOG3434, VOG4555, VOG0637, VOG1183, VOG4564, VOG0720, VOG4544
EELJGKON_61943711525FalseSiphoviridaeVOG0862, VOG3479, VOG0792
EELJGKON_89458527366FalseSiphoviridaeVOG5852, VOG4586, VOG0704, VOG0539, VOG4589, VOG0562, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG4844, VOG4841, VOG1345, VOG4549, VOG4570, VOG5532, VOG0944, VOG4570, VOG0198, VOG1563, VOG3643, VOG6470, VOG0152, VOG4237, VOG9741, VOG4693, VOG7735, VOG0025, VOG4799, VOG10867, VOG0181
EELJGKON_90219663FalseSiphoviridaeVOG4599, VOG4605, VOG6163, VOG2225, VOG4586, VOG0704, VOG0539, VOG4589, VOG0204, VOG5601, VOG4553, VOG4568, VOG4556, VOG3644, VOG4544, VOG4581, VOG4841

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements