Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
OOAENHAD_1182403723333WalR1.90e-113transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
OOAENHAD_732072520922CspR1.07e-33cold shock protein89.39100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
OOAENHAD_13043105371repUS741062 / 106299.72CP000424

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
OOAENHAD_10.01.00.0
OOAENHAD_21.00.01.0
OOAENHAD_31.00.01.0
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OOAENHAD_1401.00.01.0
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OOAENHAD_1671.00.01.0
OOAENHAD_1681.00.01.0
OOAENHAD_1691.00.01.0
OOAENHAD_1721.00.01.0
OOAENHAD_1770.01.00.0
OOAENHAD_1781.00.01.0
OOAENHAD_1801.00.01.0
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OOAENHAD_1851.00.01.0
OOAENHAD_1861.00.01.0
OOAENHAD_1871.00.01.0
OOAENHAD_1881.00.01.0
OOAENHAD_1891.00.01.0
OOAENHAD_1901.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
OOAENHAD_68294129779FalseSiphoviridaeVOG0181, VOG10867, VOG4600, VOG1309, VOG4566, VOG0189, VOG4900, VOG5998, VOG5562, VOG4693, VOG0744, VOG4673, VOG4841, VOG0519, VOG4544, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG4589, VOG1898, VOG4545, VOG4633, VOG4763, VOG3498, VOG0648, VOG1637
OOAENHAD_953323570439FalseSiphoviridaeVOG4918, VOG0703, VOG7017, VOG0861, VOG4705, VOG4599, VOG4605, VOG4545, VOG0800, VOG0725, VOG0799, VOG0724, VOG5660, VOG0723, VOG4713, VOG1322, VOG1887, VOG3434, VOG4555, VOG4564, VOG0720, VOG4544, VOG0796, VOG4570, VOG3691, VOG0198, VOG0044, VOG3643, VOG2820, VOG0195, VOG9741, VOG0536, VOG9860, VOG7018, VOG0189, VOG0226, VOG0322, VOG0535, VOG2215

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements