Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
BODBKKLA_95917359877WalR3.73e-115transcriptional regulatory protein84.25100.00EPH95667
BODBKKLA_65059950405CspR4.23e-30cold shock protein84.6198.48AAO82613
BODBKKLA_65059950402CspA6.49e-30cold shock protein84.85100.00CAA62903

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
BODBKKLA_1339851758rep38774 / 903100.00CP005943
BODBKKLA_1283788repUS64787 / 95495.55JN601038

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
BODBKKLA_10.01.00.0
BODBKKLA_20.01.00.0
BODBKKLA_30.01.00.0
BODBKKLA_40.01.00.0
BODBKKLA_50.01.00.0
BODBKKLA_60.01.00.0
BODBKKLA_70.01.00.0
BODBKKLA_80.01.00.0
BODBKKLA_90.01.00.0
BODBKKLA_100.01.00.0
BODBKKLA_110.01.00.0
BODBKKLA_120.01.00.0
BODBKKLA_130.01.00.0
BODBKKLA_140.01.00.0
BODBKKLA_150.01.00.0
BODBKKLA_160.01.00.0
BODBKKLA_170.01.00.0
BODBKKLA_180.01.00.0
BODBKKLA_190.01.00.0
BODBKKLA_200.01.00.0
BODBKKLA_210.01.00.0
BODBKKLA_220.01.00.0
BODBKKLA_230.01.00.0
BODBKKLA_240.01.00.0
BODBKKLA_250.01.00.0
BODBKKLA_260.01.00.0
BODBKKLA_270.01.00.0
BODBKKLA_280.01.00.0
BODBKKLA_290.01.00.0
BODBKKLA_300.01.00.0
BODBKKLA_310.01.00.0
BODBKKLA_320.01.00.0
BODBKKLA_330.01.00.0
BODBKKLA_340.01.00.0
BODBKKLA_350.01.00.0
BODBKKLA_360.01.00.0
BODBKKLA_370.01.00.0
BODBKKLA_380.01.00.0
BODBKKLA_390.01.00.0
BODBKKLA_400.01.00.0
BODBKKLA_410.01.00.0
BODBKKLA_420.01.00.0
BODBKKLA_430.01.00.0
BODBKKLA_440.01.00.0
BODBKKLA_450.01.00.0
BODBKKLA_460.01.00.0
BODBKKLA_470.01.00.0
BODBKKLA_480.01.00.0
BODBKKLA_490.01.00.0
BODBKKLA_500.01.00.0
BODBKKLA_510.01.00.0
BODBKKLA_520.01.00.0
BODBKKLA_531.00.01.0
BODBKKLA_540.01.00.0
BODBKKLA_550.01.00.0
BODBKKLA_560.01.00.0
BODBKKLA_570.01.00.0
BODBKKLA_580.01.00.0
BODBKKLA_590.01.00.0
BODBKKLA_600.01.00.0
BODBKKLA_610.01.00.0
BODBKKLA_620.01.00.0
BODBKKLA_631.00.01.0
BODBKKLA_640.01.00.0
BODBKKLA_650.01.00.0
BODBKKLA_660.01.00.0
BODBKKLA_670.01.00.0
BODBKKLA_680.01.00.0
BODBKKLA_691.00.01.0
BODBKKLA_700.01.00.0
BODBKKLA_710.01.00.0
BODBKKLA_720.01.00.0
BODBKKLA_730.01.00.0
BODBKKLA_741.00.01.0
BODBKKLA_750.01.00.0
BODBKKLA_760.01.00.0
BODBKKLA_770.01.00.0
BODBKKLA_780.01.00.0
BODBKKLA_790.01.00.0
BODBKKLA_800.01.00.0
BODBKKLA_810.01.00.0
BODBKKLA_820.01.00.0
BODBKKLA_830.01.00.0
BODBKKLA_840.01.00.0
BODBKKLA_851.00.01.0
BODBKKLA_860.01.00.0
BODBKKLA_870.01.00.0
BODBKKLA_880.01.00.0
BODBKKLA_890.01.00.0
BODBKKLA_900.01.00.0
BODBKKLA_911.00.01.0
BODBKKLA_920.01.00.0
BODBKKLA_931.00.01.0
BODBKKLA_940.01.00.0
BODBKKLA_951.00.01.0
BODBKKLA_961.00.01.0
BODBKKLA_970.01.00.0
BODBKKLA_980.01.00.0
BODBKKLA_991.00.01.0
BODBKKLA_1000.01.00.0
BODBKKLA_1010.01.00.0
BODBKKLA_1020.01.00.0
BODBKKLA_1030.01.00.0
BODBKKLA_1041.00.01.0
BODBKKLA_1050.01.00.0
BODBKKLA_1061.00.01.0
BODBKKLA_1070.01.00.0
BODBKKLA_1081.00.01.0
BODBKKLA_1091.00.01.0
BODBKKLA_1101.00.01.0
BODBKKLA_1110.01.00.0
BODBKKLA_1120.01.00.0
BODBKKLA_1131.00.01.0
BODBKKLA_1150.01.00.0
BODBKKLA_1161.00.01.0
BODBKKLA_1170.01.00.0
BODBKKLA_1180.01.00.0
BODBKKLA_1191.00.01.0
BODBKKLA_1210.01.00.0
BODBKKLA_1220.01.00.0
BODBKKLA_1231.00.01.0
BODBKKLA_1241.00.01.0
BODBKKLA_1251.00.01.0
BODBKKLA_1261.00.01.0
BODBKKLA_1271.00.01.0
BODBKKLA_1281.00.01.0
BODBKKLA_1291.00.01.0
BODBKKLA_1301.00.01.0
BODBKKLA_1311.00.01.0
BODBKKLA_1321.00.01.0
BODBKKLA_1331.00.01.0
BODBKKLA_1340.01.00.0
BODBKKLA_1351.00.01.0
BODBKKLA_1361.00.01.0
BODBKKLA_1371.00.01.0
BODBKKLA_1380.01.00.0
BODBKKLA_1390.01.00.0
BODBKKLA_1400.01.00.0
BODBKKLA_1411.00.01.0
BODBKKLA_1420.01.00.0
BODBKKLA_1431.00.01.0
BODBKKLA_1441.00.01.0
BODBKKLA_1451.00.01.0
BODBKKLA_1460.01.00.0
BODBKKLA_1471.00.01.0
BODBKKLA_1480.01.00.0
BODBKKLA_1491.00.01.0
BODBKKLA_1501.00.01.0
BODBKKLA_1511.00.01.0
BODBKKLA_1521.00.01.0
BODBKKLA_1531.00.01.0
BODBKKLA_1540.01.00.0
BODBKKLA_1551.00.01.0
BODBKKLA_1561.00.01.0
BODBKKLA_1571.00.01.0
BODBKKLA_1581.00.01.0
BODBKKLA_1591.00.01.0
BODBKKLA_1601.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements