Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
KGPLIOGJ_10.01.00.0
KGPLIOGJ_20.01.00.0
KGPLIOGJ_30.01.00.0
KGPLIOGJ_41.00.01.0
KGPLIOGJ_50.01.00.0
KGPLIOGJ_61.00.01.0
KGPLIOGJ_70.01.00.0
KGPLIOGJ_80.01.00.0
KGPLIOGJ_90.01.00.0
KGPLIOGJ_100.01.00.0
KGPLIOGJ_110.01.00.0
KGPLIOGJ_120.01.00.0
KGPLIOGJ_130.01.00.0
KGPLIOGJ_140.01.00.0
KGPLIOGJ_150.01.00.0
KGPLIOGJ_160.01.00.0
KGPLIOGJ_170.01.00.0
KGPLIOGJ_180.01.00.0
KGPLIOGJ_190.01.00.0
KGPLIOGJ_200.01.00.0
KGPLIOGJ_210.01.00.0
KGPLIOGJ_220.01.00.0
KGPLIOGJ_230.01.00.0
KGPLIOGJ_240.01.00.0
KGPLIOGJ_250.01.00.0
KGPLIOGJ_261.00.01.0
KGPLIOGJ_270.01.00.0
KGPLIOGJ_280.01.00.0
KGPLIOGJ_291.00.01.0
KGPLIOGJ_301.00.01.0
KGPLIOGJ_310.01.00.0
KGPLIOGJ_320.01.00.0
KGPLIOGJ_331.00.01.0
KGPLIOGJ_340.01.00.0
KGPLIOGJ_350.01.00.0
KGPLIOGJ_361.00.01.0
KGPLIOGJ_370.01.00.0
KGPLIOGJ_380.01.00.0
KGPLIOGJ_390.01.00.0
KGPLIOGJ_400.01.00.0
KGPLIOGJ_410.01.00.0
KGPLIOGJ_420.01.00.0
KGPLIOGJ_430.01.00.0
KGPLIOGJ_440.01.00.0
KGPLIOGJ_451.00.01.0
KGPLIOGJ_460.01.00.0
KGPLIOGJ_471.00.01.0
KGPLIOGJ_480.01.00.0
KGPLIOGJ_490.01.00.0
KGPLIOGJ_500.01.00.0
KGPLIOGJ_510.01.00.0
KGPLIOGJ_521.00.01.0
KGPLIOGJ_531.00.01.0
KGPLIOGJ_540.01.00.0
KGPLIOGJ_551.00.01.0
KGPLIOGJ_560.01.00.0
KGPLIOGJ_570.01.00.0
KGPLIOGJ_580.01.00.0
KGPLIOGJ_590.01.00.0
KGPLIOGJ_600.01.00.0
KGPLIOGJ_611.00.01.0
KGPLIOGJ_620.01.00.0
KGPLIOGJ_640.01.00.0
KGPLIOGJ_650.01.00.0
KGPLIOGJ_660.01.00.0
KGPLIOGJ_670.01.00.0
KGPLIOGJ_681.00.01.0
KGPLIOGJ_690.01.00.0
KGPLIOGJ_700.01.00.0
KGPLIOGJ_710.01.00.0
KGPLIOGJ_720.01.00.0
KGPLIOGJ_730.01.00.0
KGPLIOGJ_740.01.00.0
KGPLIOGJ_750.01.00.0
KGPLIOGJ_760.01.00.0
KGPLIOGJ_770.01.00.0
KGPLIOGJ_781.00.01.0
KGPLIOGJ_790.01.00.0
KGPLIOGJ_801.00.01.0
KGPLIOGJ_811.00.01.0
KGPLIOGJ_821.00.01.0
KGPLIOGJ_830.01.00.0
KGPLIOGJ_840.01.00.0
KGPLIOGJ_851.00.01.0
KGPLIOGJ_861.00.01.0
KGPLIOGJ_870.01.00.0
KGPLIOGJ_880.01.00.0
KGPLIOGJ_891.00.01.0
KGPLIOGJ_900.01.00.0
KGPLIOGJ_1000.01.00.0
KGPLIOGJ_1100.01.00.0
KGPLIOGJ_1110.01.00.0
KGPLIOGJ_1211.00.01.0
KGPLIOGJ_1340.01.00.0
KGPLIOGJ_1360.01.00.0
KGPLIOGJ_1370.01.00.0
KGPLIOGJ_1391.00.01.0
KGPLIOGJ_1410.01.00.0
KGPLIOGJ_1461.00.01.0
KGPLIOGJ_1471.00.01.0
KGPLIOGJ_1481.00.01.0
KGPLIOGJ_1491.00.01.0
KGPLIOGJ_1510.01.00.0
KGPLIOGJ_1530.01.00.0
KGPLIOGJ_1551.00.01.0
KGPLIOGJ_1570.01.00.0
KGPLIOGJ_1591.00.01.0
KGPLIOGJ_1610.01.00.0
KGPLIOGJ_1621.00.01.0
KGPLIOGJ_1650.01.00.0
KGPLIOGJ_1710.01.00.0
KGPLIOGJ_1720.01.00.0
KGPLIOGJ_1741.00.01.0
KGPLIOGJ_1751.00.01.0
KGPLIOGJ_1761.00.01.0
KGPLIOGJ_1771.00.01.0
KGPLIOGJ_1790.01.00.0
KGPLIOGJ_1800.01.00.0
KGPLIOGJ_1861.00.01.0
KGPLIOGJ_1871.00.01.0
KGPLIOGJ_1880.01.00.0
KGPLIOGJ_1901.00.01.0
KGPLIOGJ_1921.00.01.0
KGPLIOGJ_1940.01.00.0
KGPLIOGJ_1951.00.01.0
KGPLIOGJ_1980.01.00.0
KGPLIOGJ_2001.00.01.0
KGPLIOGJ_2011.00.01.0
KGPLIOGJ_2031.00.01.0
KGPLIOGJ_2040.01.00.0
KGPLIOGJ_2130.01.00.0
KGPLIOGJ_2151.00.01.0
KGPLIOGJ_2160.01.00.0
KGPLIOGJ_2170.01.00.0
KGPLIOGJ_2180.01.00.0
KGPLIOGJ_2190.01.00.0
KGPLIOGJ_2210.01.00.0
KGPLIOGJ_2220.01.00.0
KGPLIOGJ_2240.01.00.0
KGPLIOGJ_2251.00.01.0
KGPLIOGJ_2260.01.00.0
KGPLIOGJ_2270.01.00.0
KGPLIOGJ_2280.01.00.0
KGPLIOGJ_2290.01.00.0
KGPLIOGJ_2300.01.00.0
KGPLIOGJ_2310.01.00.0
KGPLIOGJ_2320.01.00.0
KGPLIOGJ_2330.01.00.0
KGPLIOGJ_2350.01.00.0
KGPLIOGJ_2360.01.00.0
KGPLIOGJ_2370.01.00.0
KGPLIOGJ_2380.01.00.0
KGPLIOGJ_2390.01.00.0
KGPLIOGJ_2400.01.00.0
KGPLIOGJ_2410.01.00.0
KGPLIOGJ_2420.01.00.0
KGPLIOGJ_2431.00.01.0
KGPLIOGJ_2440.01.00.0
KGPLIOGJ_2450.01.00.0
KGPLIOGJ_2461.00.01.0
KGPLIOGJ_2470.01.00.0
KGPLIOGJ_2480.01.00.0
KGPLIOGJ_2490.01.00.0
KGPLIOGJ_2500.01.00.0
KGPLIOGJ_2510.01.00.0
KGPLIOGJ_2520.01.00.0
KGPLIOGJ_2530.01.00.0
KGPLIOGJ_2540.01.00.0
KGPLIOGJ_2550.01.00.0
KGPLIOGJ_2560.01.00.0
KGPLIOGJ_2570.01.00.0
KGPLIOGJ_2580.01.00.0
KGPLIOGJ_2590.01.00.0
KGPLIOGJ_2600.01.00.0
KGPLIOGJ_2610.01.00.0
KGPLIOGJ_2620.01.00.0
KGPLIOGJ_2630.01.00.0
KGPLIOGJ_2640.01.00.0
KGPLIOGJ_2650.01.00.0
KGPLIOGJ_2661.00.01.0
KGPLIOGJ_2671.00.01.0
KGPLIOGJ_2681.00.01.0
KGPLIOGJ_2690.01.00.0
KGPLIOGJ_2700.01.00.0
KGPLIOGJ_2710.01.00.0
KGPLIOGJ_2720.01.00.0
KGPLIOGJ_2730.01.00.0
KGPLIOGJ_2740.01.00.0
KGPLIOGJ_2750.01.00.0
KGPLIOGJ_2760.01.00.0
KGPLIOGJ_2770.01.00.0
KGPLIOGJ_2781.00.01.0
KGPLIOGJ_2790.01.00.0
KGPLIOGJ_2800.01.00.0
KGPLIOGJ_2811.00.01.0
KGPLIOGJ_2820.01.00.0
KGPLIOGJ_2830.01.00.0
KGPLIOGJ_2851.00.01.0
KGPLIOGJ_2860.01.00.0
KGPLIOGJ_2870.01.00.0
KGPLIOGJ_2880.01.00.0
KGPLIOGJ_2890.01.00.0
KGPLIOGJ_2900.01.00.0
KGPLIOGJ_2910.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
KGPLIOGJ_1461243545407FalseMyoviridaeVOG0861, VOG4705, VOG9945, VOG4397, VOG5913, VOG0173, VOG4620, VOG4691, VOG4550, VOG0573, VOG1348, VOG1433, VOG1956, VOG6307, VOG4699, VOG1352, VOG1883, VOG1881, VOG1353, VOG4778, VOG1942, VOG6932, VOG1915, VOG4865, VOG5027, VOG1912, VOG7407, VOG0796, VOG0686, VOG0198, VOG4847
KGPLIOGJ_2742764852916FalseSiphoviridaeVOG0327, VOG3349, VOG0198, VOG4841, VOG4581, VOG10115, VOG1886, VOG0202, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG0205, VOG0207, VOG4586, VOG0209, VOG0660, VOG4545, VOG4633, VOG4659, VOG8355, VOG1594, VOG0566

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements