Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
OBCNMCJM_10.01.00.0
OBCNMCJM_20.01.00.0
OBCNMCJM_30.01.00.0
OBCNMCJM_40.01.00.0
OBCNMCJM_50.01.00.0
OBCNMCJM_70.01.00.0
OBCNMCJM_80.01.00.0
OBCNMCJM_90.01.00.0
OBCNMCJM_100.01.00.0
OBCNMCJM_110.01.00.0
OBCNMCJM_120.01.00.0
OBCNMCJM_130.01.00.0
OBCNMCJM_140.01.00.0
OBCNMCJM_150.01.00.0
OBCNMCJM_161.00.01.0
OBCNMCJM_170.01.00.0
OBCNMCJM_180.01.00.0
OBCNMCJM_190.01.00.0
OBCNMCJM_200.01.00.0
OBCNMCJM_211.00.01.0
OBCNMCJM_220.01.00.0
OBCNMCJM_230.01.00.0
OBCNMCJM_240.01.00.0
OBCNMCJM_250.01.00.0
OBCNMCJM_260.01.00.0
OBCNMCJM_270.01.00.0
OBCNMCJM_280.01.00.0
OBCNMCJM_290.01.00.0
OBCNMCJM_300.01.00.0
OBCNMCJM_311.00.01.0
OBCNMCJM_321.00.01.0
OBCNMCJM_330.01.00.0
OBCNMCJM_340.01.00.0
OBCNMCJM_350.01.00.0
OBCNMCJM_370.01.00.0
OBCNMCJM_380.01.00.0
OBCNMCJM_390.01.00.0
OBCNMCJM_400.01.00.0
OBCNMCJM_410.01.00.0
OBCNMCJM_420.01.00.0
OBCNMCJM_431.00.01.0
OBCNMCJM_440.01.00.0
OBCNMCJM_450.01.00.0
OBCNMCJM_460.01.00.0
OBCNMCJM_470.01.00.0
OBCNMCJM_481.00.01.0
OBCNMCJM_490.01.00.0
OBCNMCJM_500.01.00.0
OBCNMCJM_510.01.00.0
OBCNMCJM_520.01.00.0
OBCNMCJM_540.01.00.0
OBCNMCJM_550.01.00.0
OBCNMCJM_561.00.01.0
OBCNMCJM_570.01.00.0
OBCNMCJM_580.01.00.0
OBCNMCJM_600.01.00.0
OBCNMCJM_610.01.00.0
OBCNMCJM_620.01.00.0
OBCNMCJM_630.01.00.0
OBCNMCJM_640.01.00.0
OBCNMCJM_650.01.00.0
OBCNMCJM_661.00.01.0
OBCNMCJM_670.01.00.0
OBCNMCJM_680.01.00.0
OBCNMCJM_690.01.00.0
OBCNMCJM_700.01.00.0
OBCNMCJM_710.01.00.0
OBCNMCJM_720.01.00.0
OBCNMCJM_731.00.01.0
OBCNMCJM_741.00.01.0
OBCNMCJM_750.01.00.0
OBCNMCJM_760.01.00.0
OBCNMCJM_781.00.01.0
OBCNMCJM_790.01.00.0
OBCNMCJM_800.01.00.0
OBCNMCJM_900.01.00.0
OBCNMCJM_981.00.01.0
OBCNMCJM_1011.00.01.0
OBCNMCJM_1040.01.00.0
OBCNMCJM_1120.01.00.0
OBCNMCJM_1130.01.00.0
OBCNMCJM_1141.00.01.0
OBCNMCJM_1151.00.01.0
OBCNMCJM_1160.01.00.0
OBCNMCJM_1171.00.01.0
OBCNMCJM_1180.01.00.0
OBCNMCJM_1191.00.01.0
OBCNMCJM_1211.00.01.0
OBCNMCJM_1220.01.00.0
OBCNMCJM_1240.01.00.0
OBCNMCJM_1261.00.01.0
OBCNMCJM_1320.01.00.0
OBCNMCJM_1331.00.01.0
OBCNMCJM_1340.01.00.0
OBCNMCJM_1370.01.00.0
OBCNMCJM_1420.01.00.0
OBCNMCJM_1461.00.01.0
OBCNMCJM_1471.00.01.0
OBCNMCJM_1520.01.00.0
OBCNMCJM_1611.00.01.0
OBCNMCJM_1620.01.00.0
OBCNMCJM_1641.00.01.0
OBCNMCJM_1661.00.01.0
OBCNMCJM_1730.01.00.0
OBCNMCJM_1741.00.01.0
OBCNMCJM_1791.00.01.0
OBCNMCJM_1840.01.00.0
OBCNMCJM_1911.00.01.0
OBCNMCJM_1940.01.00.0
OBCNMCJM_1951.00.01.0
OBCNMCJM_1971.00.01.0
OBCNMCJM_1990.01.00.0
OBCNMCJM_2020.01.00.0
OBCNMCJM_2030.01.00.0
OBCNMCJM_2051.00.01.0
OBCNMCJM_2080.01.00.0
OBCNMCJM_2100.01.00.0
OBCNMCJM_2121.00.01.0
OBCNMCJM_2130.01.00.0
OBCNMCJM_2140.01.00.0
OBCNMCJM_2161.00.01.0
OBCNMCJM_2211.00.01.0
OBCNMCJM_2231.00.01.0
OBCNMCJM_2240.01.00.0
OBCNMCJM_2250.01.00.0
OBCNMCJM_2291.00.01.0
OBCNMCJM_2300.01.00.0
OBCNMCJM_2320.01.00.0
OBCNMCJM_2340.01.00.0
OBCNMCJM_2350.01.00.0
OBCNMCJM_2370.01.00.0
OBCNMCJM_2450.01.00.0
OBCNMCJM_2460.01.00.0
OBCNMCJM_2540.01.00.0
OBCNMCJM_2640.01.00.0
OBCNMCJM_2720.01.00.0
OBCNMCJM_2820.01.00.0
OBCNMCJM_2890.01.00.0
OBCNMCJM_2911.00.01.0
OBCNMCJM_2971.00.01.0
OBCNMCJM_3061.00.01.0
OBCNMCJM_3070.01.00.0
OBCNMCJM_3150.01.00.0
OBCNMCJM_3230.01.00.0
OBCNMCJM_3300.01.00.0
OBCNMCJM_3390.01.00.0
OBCNMCJM_3500.01.00.0
OBCNMCJM_3610.01.00.0
OBCNMCJM_3671.00.01.0
OBCNMCJM_3711.00.01.0
OBCNMCJM_3800.01.00.0
OBCNMCJM_3811.00.01.0
OBCNMCJM_3820.01.00.0
OBCNMCJM_3830.01.00.0
OBCNMCJM_3840.01.00.0
OBCNMCJM_3850.01.00.0
OBCNMCJM_3860.01.00.0
OBCNMCJM_3870.01.00.0
OBCNMCJM_3881.00.01.0
OBCNMCJM_3890.01.00.0
OBCNMCJM_3900.01.00.0
OBCNMCJM_3910.01.00.0
OBCNMCJM_3920.01.00.0
OBCNMCJM_3930.01.00.0
OBCNMCJM_3940.01.00.0
OBCNMCJM_3950.01.00.0
OBCNMCJM_3960.01.00.0
OBCNMCJM_3970.01.00.0
OBCNMCJM_3980.01.00.0
OBCNMCJM_4010.01.00.0
OBCNMCJM_4020.01.00.0
OBCNMCJM_4030.01.00.0
OBCNMCJM_4040.01.00.0
OBCNMCJM_4050.01.00.0
OBCNMCJM_4061.00.01.0
OBCNMCJM_4070.01.00.0
OBCNMCJM_4080.01.00.0
OBCNMCJM_4090.01.00.0
OBCNMCJM_4100.01.00.0
OBCNMCJM_4111.00.01.0
OBCNMCJM_4120.01.00.0
OBCNMCJM_4130.01.00.0
OBCNMCJM_4140.01.00.0
OBCNMCJM_4150.01.00.0
OBCNMCJM_4160.01.00.0
OBCNMCJM_4170.01.00.0
OBCNMCJM_4190.01.00.0
OBCNMCJM_4200.01.00.0
OBCNMCJM_4211.00.01.0
OBCNMCJM_4220.01.00.0
OBCNMCJM_4230.01.00.0
OBCNMCJM_4240.01.00.0
OBCNMCJM_4250.01.00.0
OBCNMCJM_4260.01.00.0
OBCNMCJM_4270.01.00.0
OBCNMCJM_4280.01.00.0
OBCNMCJM_4290.01.00.0
OBCNMCJM_4300.01.00.0
OBCNMCJM_4310.01.00.0
OBCNMCJM_4320.01.00.0
OBCNMCJM_4331.00.01.0
OBCNMCJM_4350.01.00.0
OBCNMCJM_4360.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
OBCNMCJM_10512937065FalseMyoviridaeVOG5334, VOG4845, VOG4691, VOG4550, VOG0573, VOG1348, VOG1433, VOG1956, VOG6163, VOG4699, VOG1352, VOG1883, VOG1881, VOG1353, VOG4778, VOG1942, VOG1915, VOG4918, VOG10904, VOG7237, VOG5027, VOG1912, VOG7407, VOG0796, VOG2545, VOG0376, VOG0198
OBCNMCJM_3942117524834FalseMyoviridae / SiphoviridaeVOG9667, VOG4566, VOG8288, VOG5458, VOG8288, VOG4799, VOG2228

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements