Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
DAGHJEBL_10.01.00.0
DAGHJEBL_20.01.00.0
DAGHJEBL_30.01.00.0
DAGHJEBL_41.00.01.0
DAGHJEBL_51.00.01.0
DAGHJEBL_61.00.01.0
DAGHJEBL_70.01.00.0
DAGHJEBL_80.01.00.0
DAGHJEBL_90.01.00.0
DAGHJEBL_100.01.00.0
DAGHJEBL_110.01.00.0
DAGHJEBL_120.01.00.0
DAGHJEBL_130.01.00.0
DAGHJEBL_140.01.00.0
DAGHJEBL_150.01.00.0
DAGHJEBL_160.01.00.0
DAGHJEBL_170.01.00.0
DAGHJEBL_181.00.01.0
DAGHJEBL_191.00.01.0
DAGHJEBL_200.01.00.0
DAGHJEBL_211.00.01.0
DAGHJEBL_230.01.00.0
DAGHJEBL_240.01.00.0
DAGHJEBL_250.01.00.0
DAGHJEBL_260.01.00.0
DAGHJEBL_271.00.01.0
DAGHJEBL_280.01.00.0
DAGHJEBL_290.01.00.0
DAGHJEBL_320.01.00.0
DAGHJEBL_331.00.01.0
DAGHJEBL_341.00.01.0
DAGHJEBL_350.01.00.0
DAGHJEBL_360.01.00.0
DAGHJEBL_370.01.00.0
DAGHJEBL_380.01.00.0
DAGHJEBL_390.01.00.0
DAGHJEBL_400.01.00.0
DAGHJEBL_420.01.00.0
DAGHJEBL_430.01.00.0
DAGHJEBL_440.01.00.0
DAGHJEBL_450.01.00.0
DAGHJEBL_460.01.00.0
DAGHJEBL_470.01.00.0
DAGHJEBL_480.01.00.0
DAGHJEBL_490.01.00.0
DAGHJEBL_501.00.01.0
DAGHJEBL_510.01.00.0
DAGHJEBL_520.01.00.0
DAGHJEBL_530.01.00.0
DAGHJEBL_540.01.00.0
DAGHJEBL_550.01.00.0
DAGHJEBL_560.01.00.0
DAGHJEBL_570.01.00.0
DAGHJEBL_591.00.01.0
DAGHJEBL_600.01.00.0
DAGHJEBL_610.01.00.0
DAGHJEBL_621.00.01.0
DAGHJEBL_631.00.01.0
DAGHJEBL_641.00.01.0
DAGHJEBL_650.01.00.0
DAGHJEBL_660.01.00.0
DAGHJEBL_671.00.01.0
DAGHJEBL_680.01.00.0
DAGHJEBL_690.01.00.0
DAGHJEBL_790.01.00.0
DAGHJEBL_900.01.00.0
DAGHJEBL_1010.01.00.0
DAGHJEBL_1120.01.00.0
DAGHJEBL_1131.00.01.0
DAGHJEBL_1210.01.00.0
DAGHJEBL_1240.01.00.0
DAGHJEBL_1251.00.01.0
DAGHJEBL_1311.00.01.0
DAGHJEBL_1321.00.01.0
DAGHJEBL_1330.01.00.0
DAGHJEBL_1350.01.00.0
DAGHJEBL_1391.00.01.0
DAGHJEBL_1421.00.01.0
DAGHJEBL_1430.01.00.0
DAGHJEBL_1440.01.00.0
DAGHJEBL_1450.01.00.0
DAGHJEBL_1461.00.01.0
DAGHJEBL_1501.00.01.0
DAGHJEBL_1560.01.00.0
DAGHJEBL_1571.00.01.0
DAGHJEBL_1590.01.00.0
DAGHJEBL_1621.00.01.0
DAGHJEBL_1661.00.01.0
DAGHJEBL_1670.01.00.0
DAGHJEBL_1741.00.01.0
DAGHJEBL_1751.00.01.0
DAGHJEBL_1761.00.01.0
DAGHJEBL_1780.01.00.0
DAGHJEBL_1850.01.00.0
DAGHJEBL_1880.01.00.0
DAGHJEBL_1891.00.01.0
DAGHJEBL_1921.00.01.0
DAGHJEBL_1951.00.01.0
DAGHJEBL_1960.01.00.0
DAGHJEBL_2001.00.01.0
DAGHJEBL_2060.01.00.0
DAGHJEBL_2071.00.01.0
DAGHJEBL_2100.01.00.0
DAGHJEBL_2111.00.01.0
DAGHJEBL_2121.00.01.0
DAGHJEBL_2141.00.01.0
DAGHJEBL_2200.01.00.0
DAGHJEBL_2210.01.00.0
DAGHJEBL_2250.01.00.0
DAGHJEBL_2261.00.01.0
DAGHJEBL_2301.00.01.0
DAGHJEBL_2320.01.00.0
DAGHJEBL_2350.01.00.0
DAGHJEBL_2361.00.01.0
DAGHJEBL_2410.01.00.0
DAGHJEBL_2430.01.00.0
DAGHJEBL_2451.00.01.0
DAGHJEBL_2460.01.00.0
DAGHJEBL_2521.00.01.0
DAGHJEBL_2531.00.01.0
DAGHJEBL_2540.01.00.0
DAGHJEBL_2551.00.01.0
DAGHJEBL_2621.00.01.0
DAGHJEBL_2641.00.01.0
DAGHJEBL_2661.00.01.0
DAGHJEBL_2670.01.00.0
DAGHJEBL_2710.01.00.0
DAGHJEBL_2720.01.00.0
DAGHJEBL_2740.01.00.0
DAGHJEBL_2751.00.01.0
DAGHJEBL_2781.00.01.0
DAGHJEBL_2850.01.00.0
DAGHJEBL_2960.01.00.0
DAGHJEBL_3070.01.00.0
DAGHJEBL_3160.01.00.0
DAGHJEBL_3261.00.01.0
DAGHJEBL_3270.01.00.0
DAGHJEBL_3360.01.00.0
DAGHJEBL_3380.01.00.0
DAGHJEBL_3480.01.00.0
DAGHJEBL_3591.00.01.0
DAGHJEBL_3631.00.01.0
DAGHJEBL_3691.00.01.0
DAGHJEBL_3790.01.00.0
DAGHJEBL_3870.01.00.0
DAGHJEBL_3980.01.00.0
DAGHJEBL_4041.00.01.0
DAGHJEBL_4061.00.01.0
DAGHJEBL_4080.01.00.0
DAGHJEBL_4180.01.00.0
DAGHJEBL_4290.01.00.0
DAGHJEBL_4300.01.00.0
DAGHJEBL_4350.01.00.0
DAGHJEBL_4410.01.00.0
DAGHJEBL_4510.01.00.0
DAGHJEBL_4600.01.00.0
DAGHJEBL_4610.01.00.0
DAGHJEBL_4620.01.00.0
DAGHJEBL_4630.01.00.0
DAGHJEBL_4640.01.00.0
DAGHJEBL_4650.01.00.0
DAGHJEBL_4660.01.00.0
DAGHJEBL_4670.01.00.0
DAGHJEBL_4680.01.00.0
DAGHJEBL_4690.01.00.0
DAGHJEBL_4700.01.00.0
DAGHJEBL_4710.01.00.0
DAGHJEBL_4720.01.00.0
DAGHJEBL_4731.00.01.0
DAGHJEBL_4740.01.00.0
DAGHJEBL_4750.01.00.0
DAGHJEBL_4761.00.01.0
DAGHJEBL_4770.01.00.0
DAGHJEBL_4780.01.00.0
DAGHJEBL_4790.01.00.0
DAGHJEBL_4800.01.00.0
DAGHJEBL_4811.00.01.0
DAGHJEBL_4820.01.00.0
DAGHJEBL_4830.01.00.0
DAGHJEBL_4840.01.00.0
DAGHJEBL_4860.01.00.0
DAGHJEBL_4870.01.00.0
DAGHJEBL_4880.01.00.0
DAGHJEBL_4890.01.00.0
DAGHJEBL_4901.00.01.0
DAGHJEBL_4910.01.00.0
DAGHJEBL_4920.01.00.0
DAGHJEBL_4930.01.00.0
DAGHJEBL_4941.00.01.0
DAGHJEBL_4950.01.00.0
DAGHJEBL_4960.01.00.0
DAGHJEBL_4970.01.00.0
DAGHJEBL_4990.01.00.0
DAGHJEBL_5000.01.00.0
DAGHJEBL_5010.01.00.0
DAGHJEBL_5020.01.00.0
DAGHJEBL_5030.01.00.0
DAGHJEBL_5040.01.00.0
DAGHJEBL_5050.01.00.0
DAGHJEBL_5060.01.00.0
DAGHJEBL_5070.01.00.0
DAGHJEBL_5080.01.00.0
DAGHJEBL_5090.01.00.0
DAGHJEBL_5100.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
DAGHJEBL_451222999FalseMyoviridaeVOG0573, VOG1348, VOG1433, VOG1956, VOG6307, VOG4699, VOG1352, VOG1883, VOG1881, VOG1353, VOG4778, VOG1942, VOG6932, VOG1915, VOG4865, VOG5027, VOG1912, VOG7407, VOG0796, VOG0686, VOG0198
DAGHJEBL_31641407878FalseSiphoviridaeVOG9667, VOG4603, VOG4552, VOG2703, VOG0234
DAGHJEBL_3161318839792FalseSiphoviridaeVOG1422, VOG4664, VOG4618, VOG5532, VOG4544, VOG0691, VOG0692, VOG0686, VOG4555, VOG1329, VOG0695, VOG0696, VOG0697, VOG0698, VOG9763, VOG0701, VOG4760, VOG4633, VOG4659, VOG4645, VOG4856
DAGHJEBL_4652758450798FalseSiphoviridaeVOG0327, VOG8222, VOG0198, VOG4841, VOG4581, VOG10115, VOG1886, VOG0202, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG0205, VOG4727, VOG0207, VOG4586, VOG0209, VOG0660, VOG8263, VOG4633, VOG4659, VOG8355
DAGHJEBL_510301228345FalseMyoviridaeVOG4845, VOG4691, VOG4550, VOG0573, VOG1348, VOG1433, VOG1956, VOG6163, VOG4699, VOG1352, VOG1883, VOG1881, VOG1353, VOG4778, VOG1942, VOG1915, VOG4918, VOG5027, VOG1912, VOG7407, VOG0796, VOG2545, VOG0376

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements