Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 0 | 0 | 2 | 2.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FHAKMBNC_22 | 19928 | 19224 | WalR | 8.18e-114 | transcriptional regulatory protein | 83.40 | 100.00 | EPH95667 |
| FHAKMBNC_23 | 182 | 379 | CspR | 1.65e-33 | cold shock protein | 87.88 | 100.00 | AAO82613 |
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| FHAKMBNC_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_60 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_67 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_68 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_71 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_75 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_76 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_80 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_81 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_85 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_94 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_95 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_96 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_109 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_116 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_122 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_125 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_126 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_127 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_128 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_129 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_132 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_134 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_136 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_140 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_141 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_145 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_146 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_147 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_148 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_151 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_153 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_154 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_155 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_156 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_160 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_161 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_162 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_167 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_168 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_169 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_172 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_173 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_176 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_178 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_179 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FHAKMBNC_180 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_181 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_182 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FHAKMBNC_183 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| FHAKMBNC_7 | 12503 | 23778 | False | Siphoviridae | VOG10397, VOG1581, VOG4632, VOG4609, VOG4581, VOG4544, VOG5051, VOG4556, VOG4568, VOG0204, VOG4589 |
| FHAKMBNC_13 | 4562 | 39660 | False | Siphoviridae | VOG4552, VOG4552, VOG0181, VOG10867, VOG3642, VOG4799, VOG0025, VOG7735, VOG7018, VOG6623, VOG4693, VOG9741, VOG9759, VOG2820, VOG3643, VOG0198, VOG4570, VOG10904, VOG4549, VOG4841, VOG4581, VOG4544, VOG3644, VOG4556, VOG4568, VOG4553, VOG5601, VOG0204, VOG4589, VOG0539, VOG0704, VOG4586, VOG2225, VOG6163, VOG4633, VOG4828, VOG5008, VOG1637, VOG0054, VOG0638 |
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)