Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
GABJAGOC_10.01.00.0
GABJAGOC_20.01.00.0
GABJAGOC_30.01.00.0
GABJAGOC_40.01.00.0
GABJAGOC_50.01.00.0
GABJAGOC_61.00.01.0
GABJAGOC_70.01.00.0
GABJAGOC_80.01.00.0
GABJAGOC_91.00.01.0
GABJAGOC_100.01.00.0
GABJAGOC_110.01.00.0
GABJAGOC_121.00.01.0
GABJAGOC_130.01.00.0
GABJAGOC_141.00.01.0
GABJAGOC_151.00.01.0
GABJAGOC_160.01.00.0
GABJAGOC_170.01.00.0
GABJAGOC_180.01.00.0
GABJAGOC_190.01.00.0
GABJAGOC_200.01.00.0
GABJAGOC_211.00.01.0
GABJAGOC_220.01.00.0
GABJAGOC_231.00.01.0
GABJAGOC_240.01.00.0
GABJAGOC_251.00.01.0
GABJAGOC_260.01.00.0
GABJAGOC_280.01.00.0
GABJAGOC_291.00.01.0
GABJAGOC_300.01.00.0
GABJAGOC_311.00.01.0
GABJAGOC_320.01.00.0
GABJAGOC_330.01.00.0
GABJAGOC_341.00.01.0
GABJAGOC_350.01.00.0
GABJAGOC_361.00.01.0
GABJAGOC_370.01.00.0
GABJAGOC_380.01.00.0
GABJAGOC_391.00.01.0
GABJAGOC_400.01.00.0
GABJAGOC_410.01.00.0
GABJAGOC_420.01.00.0
GABJAGOC_430.01.00.0
GABJAGOC_440.01.00.0
GABJAGOC_450.01.00.0
GABJAGOC_460.01.00.0
GABJAGOC_470.01.00.0
GABJAGOC_480.01.00.0
GABJAGOC_490.01.00.0
GABJAGOC_500.01.00.0
GABJAGOC_510.01.00.0
GABJAGOC_521.00.01.0
GABJAGOC_531.00.01.0
GABJAGOC_540.01.00.0
GABJAGOC_550.01.00.0
GABJAGOC_560.01.00.0
GABJAGOC_571.00.01.0
GABJAGOC_580.01.00.0
GABJAGOC_591.00.01.0
GABJAGOC_600.01.00.0
GABJAGOC_611.00.01.0
GABJAGOC_620.01.00.0
GABJAGOC_630.01.00.0
GABJAGOC_640.01.00.0
GABJAGOC_650.01.00.0
GABJAGOC_660.01.00.0
GABJAGOC_670.01.00.0
GABJAGOC_680.01.00.0
GABJAGOC_691.00.01.0
GABJAGOC_701.00.01.0
GABJAGOC_710.01.00.0
GABJAGOC_721.00.01.0
GABJAGOC_730.01.00.0
GABJAGOC_740.01.00.0
GABJAGOC_750.01.00.0
GABJAGOC_760.01.00.0
GABJAGOC_770.01.00.0
GABJAGOC_780.01.00.0
GABJAGOC_791.00.01.0
GABJAGOC_800.01.00.0
GABJAGOC_810.01.00.0
GABJAGOC_820.01.00.0
GABJAGOC_831.00.01.0
GABJAGOC_840.01.00.0
GABJAGOC_850.01.00.0
GABJAGOC_861.00.01.0
GABJAGOC_870.01.00.0
GABJAGOC_880.01.00.0
GABJAGOC_890.01.00.0
GABJAGOC_901.00.01.0
GABJAGOC_910.01.00.0
GABJAGOC_920.01.00.0
GABJAGOC_930.01.00.0
GABJAGOC_941.00.01.0
GABJAGOC_950.01.00.0
GABJAGOC_960.01.00.0
GABJAGOC_970.01.00.0
GABJAGOC_981.00.01.0
GABJAGOC_990.01.00.0
GABJAGOC_1000.01.00.0
GABJAGOC_1011.00.01.0
GABJAGOC_1021.00.01.0
GABJAGOC_1030.01.00.0
GABJAGOC_1041.00.01.0
GABJAGOC_1051.00.01.0
GABJAGOC_1060.01.00.0
GABJAGOC_1070.01.00.0
GABJAGOC_1080.01.00.0
GABJAGOC_1090.01.00.0
GABJAGOC_1100.01.00.0
GABJAGOC_1110.01.00.0
GABJAGOC_1120.01.00.0
GABJAGOC_1131.00.01.0
GABJAGOC_1141.00.01.0
GABJAGOC_1150.01.00.0
GABJAGOC_1160.01.00.0
GABJAGOC_1171.00.01.0
GABJAGOC_1181.00.01.0
GABJAGOC_1190.01.00.0
GABJAGOC_1200.01.00.0
GABJAGOC_1210.01.00.0
GABJAGOC_1220.01.00.0
GABJAGOC_1230.01.00.0
GABJAGOC_1241.00.01.0
GABJAGOC_1251.00.01.0
GABJAGOC_1260.01.00.0
GABJAGOC_1271.00.01.0
GABJAGOC_1280.01.00.0
GABJAGOC_1291.00.01.0
GABJAGOC_1300.01.00.0
GABJAGOC_1310.01.00.0
GABJAGOC_1320.01.00.0
GABJAGOC_1331.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
GABJAGOC_108181223235FalseSiphoviridaeVOG6495,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements