Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
OMOJFDPJ_110.01.00.0
OMOJFDPJ_220.01.00.0
OMOJFDPJ_290.01.00.0
OMOJFDPJ_300.01.00.0
OMOJFDPJ_310.01.00.0
OMOJFDPJ_320.01.00.0
OMOJFDPJ_330.01.00.0
OMOJFDPJ_340.01.00.0
OMOJFDPJ_350.01.00.0
OMOJFDPJ_360.01.00.0
OMOJFDPJ_370.01.00.0
OMOJFDPJ_380.01.00.0
OMOJFDPJ_390.01.00.0
OMOJFDPJ_400.01.00.0
OMOJFDPJ_410.01.00.0
OMOJFDPJ_420.01.00.0
OMOJFDPJ_430.01.00.0
OMOJFDPJ_440.01.00.0
OMOJFDPJ_450.01.00.0
OMOJFDPJ_460.01.00.0
OMOJFDPJ_470.01.00.0
OMOJFDPJ_480.01.00.0
OMOJFDPJ_490.01.00.0
OMOJFDPJ_500.01.00.0
OMOJFDPJ_510.01.00.0
OMOJFDPJ_520.01.00.0
OMOJFDPJ_530.01.00.0
OMOJFDPJ_540.01.00.0
OMOJFDPJ_550.01.00.0
OMOJFDPJ_560.01.00.0
OMOJFDPJ_570.01.00.0
OMOJFDPJ_580.01.00.0
OMOJFDPJ_590.01.00.0
OMOJFDPJ_600.01.00.0
OMOJFDPJ_610.01.00.0
OMOJFDPJ_620.01.00.0
OMOJFDPJ_630.01.00.0
OMOJFDPJ_640.01.00.0
OMOJFDPJ_650.01.00.0
OMOJFDPJ_660.01.00.0
OMOJFDPJ_670.01.00.0
OMOJFDPJ_680.01.00.0
OMOJFDPJ_690.01.00.0
OMOJFDPJ_700.01.00.0
OMOJFDPJ_710.01.00.0
OMOJFDPJ_721.00.01.0
OMOJFDPJ_731.00.01.0
OMOJFDPJ_741.00.01.0
OMOJFDPJ_750.01.00.0
OMOJFDPJ_760.01.00.0
OMOJFDPJ_770.01.00.0
OMOJFDPJ_780.01.00.0
OMOJFDPJ_791.00.01.0
OMOJFDPJ_800.01.00.0
OMOJFDPJ_810.01.00.0
OMOJFDPJ_820.01.00.0
OMOJFDPJ_830.01.00.0
OMOJFDPJ_840.01.00.0
OMOJFDPJ_850.01.00.0
OMOJFDPJ_860.01.00.0
OMOJFDPJ_871.00.01.0
OMOJFDPJ_880.01.00.0
OMOJFDPJ_890.01.00.0
OMOJFDPJ_900.01.00.0
OMOJFDPJ_910.01.00.0
OMOJFDPJ_920.01.00.0
OMOJFDPJ_931.00.01.0
OMOJFDPJ_941.00.01.0
OMOJFDPJ_950.01.00.0
OMOJFDPJ_961.00.01.0
OMOJFDPJ_970.01.00.0
OMOJFDPJ_981.00.01.0
OMOJFDPJ_990.01.00.0
OMOJFDPJ_1001.00.01.0
OMOJFDPJ_1010.01.00.0
OMOJFDPJ_1030.01.00.0
OMOJFDPJ_1040.01.00.0
OMOJFDPJ_1051.00.01.0
OMOJFDPJ_1061.00.01.0
OMOJFDPJ_1070.01.00.0
OMOJFDPJ_1081.00.01.0
OMOJFDPJ_1090.01.00.0
OMOJFDPJ_1101.00.01.0
OMOJFDPJ_1121.00.01.0
OMOJFDPJ_1131.00.01.0
OMOJFDPJ_1140.01.00.0
OMOJFDPJ_1150.01.00.0
OMOJFDPJ_1160.01.00.0
OMOJFDPJ_1171.00.01.0
OMOJFDPJ_1180.01.00.0
OMOJFDPJ_1191.00.01.0
OMOJFDPJ_1201.00.01.0
OMOJFDPJ_1221.00.01.0
OMOJFDPJ_1231.00.01.0
OMOJFDPJ_1250.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
OMOJFDPJ_331359025153FalseMyoviridaeVOG0189, VOG5235, VOG0348, VOG0382, VOG0384, VOG0226, VOG2880, VOG0862, VOG8520

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements