Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
4004.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
NNOIHIKA_43031424032CblA-1ARO:3002999CblA-1100.00100.00GQ343019.1
NNOIHIKA_2549462112tet(X)ARO:3000205tet(X)99.74100.00M37699.1
NNOIHIKA_44511811tet(Q)ARO:3000191tet(Q)89.2589.19Z21523.1
NNOIHIKA_38421285tet(Q)ARO:3000191tet(Q)96.5065.14Z21523.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
NNOIHIKA_25423252977erm(F)Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S100.0081.52M17808
NNOIHIKA_2549462112tet(X)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline, Tigecycline99.91100.00M37699
NNOIHIKA_38411287tet(Q)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline99.8466.82L33696

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
NNOIHIKA_43031454032cblACblA family class A beta-lactamaseEXACTX100.00100.00WP_005827792.1
NNOIHIKA_25423282975erm(F)23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(F)PARTIALX100.0081.20WP_002682030.1
NNOIHIKA_2549462109tet(X2)tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X2)BLASTX99.74100.00WP_008651082.1
NNOIHIKA_44301811tet(Q)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q)INTERNAL_STOP89.0692.67WP_063856407.1
NNOIHIKA_38421285tet(Q)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q)PARTIAL_CONTIG_ENDX99.5366.77WP_063856407.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
NNOIHIKA_27017882467repUS2682 / 68199.27BFU30316

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
NNOIHIKA_10.01.00.0
NNOIHIKA_20.01.00.0
NNOIHIKA_30.01.00.0
NNOIHIKA_41.00.01.0
NNOIHIKA_51.00.01.0
NNOIHIKA_60.01.00.0
NNOIHIKA_70.01.00.0
NNOIHIKA_80.01.00.0
NNOIHIKA_90.01.00.0
NNOIHIKA_100.01.00.0
NNOIHIKA_110.01.00.0
NNOIHIKA_120.01.00.0
NNOIHIKA_130.01.00.0
NNOIHIKA_140.01.00.0
NNOIHIKA_151.00.01.0
NNOIHIKA_160.01.00.0
NNOIHIKA_170.01.00.0
NNOIHIKA_181.00.01.0
NNOIHIKA_190.01.00.0
NNOIHIKA_200.01.00.0
NNOIHIKA_210.01.00.0
NNOIHIKA_220.01.00.0
NNOIHIKA_230.01.00.0
NNOIHIKA_240.01.00.0
NNOIHIKA_251.00.01.0
NNOIHIKA_260.01.00.0
NNOIHIKA_270.01.00.0
NNOIHIKA_281.00.01.0
NNOIHIKA_291.00.01.0
NNOIHIKA_301.00.01.0
NNOIHIKA_310.01.00.0
NNOIHIKA_320.01.00.0
NNOIHIKA_330.01.00.0
NNOIHIKA_340.01.00.0
NNOIHIKA_351.00.01.0
NNOIHIKA_360.01.00.0
NNOIHIKA_370.01.00.0
NNOIHIKA_380.01.00.0
NNOIHIKA_390.01.00.0
NNOIHIKA_400.01.00.0
NNOIHIKA_410.01.00.0
NNOIHIKA_420.01.00.0
NNOIHIKA_430.01.00.0
NNOIHIKA_440.01.00.0
NNOIHIKA_450.01.00.0
NNOIHIKA_460.01.00.0
NNOIHIKA_470.01.00.0
NNOIHIKA_481.00.01.0
NNOIHIKA_491.00.01.0
NNOIHIKA_501.00.01.0
NNOIHIKA_511.00.01.0
NNOIHIKA_520.01.00.0
NNOIHIKA_530.01.00.0
NNOIHIKA_540.01.00.0
NNOIHIKA_550.01.00.0
NNOIHIKA_560.01.00.0
NNOIHIKA_570.01.00.0
NNOIHIKA_580.01.00.0
NNOIHIKA_590.01.00.0
NNOIHIKA_600.01.00.0
NNOIHIKA_610.01.00.0
NNOIHIKA_620.01.00.0
NNOIHIKA_630.01.00.0
NNOIHIKA_640.01.00.0
NNOIHIKA_650.01.00.0
NNOIHIKA_660.01.00.0
NNOIHIKA_670.01.00.0
NNOIHIKA_680.01.00.0
NNOIHIKA_691.00.01.0
NNOIHIKA_700.01.00.0
NNOIHIKA_710.01.00.0
NNOIHIKA_720.01.00.0
NNOIHIKA_730.01.00.0
NNOIHIKA_740.01.00.0
NNOIHIKA_750.01.00.0
NNOIHIKA_760.01.00.0
NNOIHIKA_770.01.00.0
NNOIHIKA_780.01.00.0
NNOIHIKA_791.00.01.0
NNOIHIKA_800.01.00.0
NNOIHIKA_810.01.00.0
NNOIHIKA_820.01.00.0
NNOIHIKA_831.00.01.0
NNOIHIKA_840.01.00.0
NNOIHIKA_850.01.00.0
NNOIHIKA_860.01.00.0
NNOIHIKA_871.00.01.0
NNOIHIKA_880.01.00.0
NNOIHIKA_890.01.00.0
NNOIHIKA_900.01.00.0
NNOIHIKA_910.01.00.0
NNOIHIKA_920.01.00.0
NNOIHIKA_931.00.01.0
NNOIHIKA_940.01.00.0
NNOIHIKA_951.00.01.0
NNOIHIKA_960.01.00.0
NNOIHIKA_971.00.01.0
NNOIHIKA_980.01.00.0
NNOIHIKA_990.01.00.0
NNOIHIKA_1001.00.01.0
NNOIHIKA_1011.00.01.0
NNOIHIKA_1021.00.01.0
NNOIHIKA_1031.00.01.0
NNOIHIKA_1040.01.00.0
NNOIHIKA_1050.01.00.0
NNOIHIKA_1060.01.00.0
NNOIHIKA_1070.01.00.0
NNOIHIKA_1081.00.01.0
NNOIHIKA_1091.00.01.0
NNOIHIKA_1100.01.00.0
NNOIHIKA_1110.01.00.0
NNOIHIKA_1120.01.00.0
NNOIHIKA_1131.00.01.0
NNOIHIKA_1140.01.00.0
NNOIHIKA_1151.00.01.0
NNOIHIKA_1160.01.00.0
NNOIHIKA_1170.01.00.0
NNOIHIKA_1180.01.00.0
NNOIHIKA_1190.01.00.0
NNOIHIKA_1200.01.00.0
NNOIHIKA_1211.00.01.0
NNOIHIKA_1220.01.00.0
NNOIHIKA_1231.00.01.0
NNOIHIKA_1240.01.00.0
NNOIHIKA_1251.00.01.0
NNOIHIKA_1260.01.00.0
NNOIHIKA_1271.00.01.0
NNOIHIKA_1280.01.00.0
NNOIHIKA_1290.01.00.0
NNOIHIKA_1301.00.01.0
NNOIHIKA_1310.01.00.0
NNOIHIKA_1320.01.00.0
NNOIHIKA_1330.01.00.0
NNOIHIKA_1341.00.01.0
NNOIHIKA_1351.00.01.0
NNOIHIKA_1360.01.00.0
NNOIHIKA_1370.01.00.0
NNOIHIKA_1380.01.00.0
NNOIHIKA_1390.01.00.0
NNOIHIKA_1400.01.00.0
NNOIHIKA_1410.01.00.0
NNOIHIKA_1420.01.00.0
NNOIHIKA_1430.01.00.0
NNOIHIKA_1440.01.00.0
NNOIHIKA_1450.01.00.0
NNOIHIKA_1460.01.00.0
NNOIHIKA_1471.00.01.0
NNOIHIKA_1481.00.01.0
NNOIHIKA_1490.01.00.0
NNOIHIKA_1501.00.01.0
NNOIHIKA_1510.01.00.0
NNOIHIKA_1520.01.00.0
NNOIHIKA_1531.00.01.0
NNOIHIKA_1541.00.01.0
NNOIHIKA_1550.01.00.0
NNOIHIKA_1561.00.01.0
NNOIHIKA_1570.01.00.0
NNOIHIKA_1580.01.00.0
NNOIHIKA_1590.01.00.0
NNOIHIKA_1600.01.00.0
NNOIHIKA_1610.01.00.0
NNOIHIKA_1620.01.00.0
NNOIHIKA_1631.00.01.0
NNOIHIKA_1640.01.00.0
NNOIHIKA_1650.01.00.0
NNOIHIKA_1660.01.00.0
NNOIHIKA_1671.00.01.0
NNOIHIKA_1681.00.01.0
NNOIHIKA_1690.01.00.0
NNOIHIKA_1700.01.00.0
NNOIHIKA_1711.00.01.0
NNOIHIKA_1721.00.01.0
NNOIHIKA_1730.01.00.0
NNOIHIKA_1740.01.00.0
NNOIHIKA_1760.01.00.0
NNOIHIKA_1770.01.00.0
NNOIHIKA_1780.01.00.0
NNOIHIKA_1790.01.00.0
NNOIHIKA_1801.00.01.0
NNOIHIKA_1810.01.00.0
NNOIHIKA_1821.00.01.0
NNOIHIKA_1830.01.00.0
NNOIHIKA_1840.01.00.0
NNOIHIKA_1850.01.00.0
NNOIHIKA_1861.00.01.0
NNOIHIKA_1871.00.01.0
NNOIHIKA_1880.01.00.0
NNOIHIKA_1891.00.01.0
NNOIHIKA_1900.01.00.0
NNOIHIKA_1910.01.00.0
NNOIHIKA_1921.00.01.0
NNOIHIKA_1930.01.00.0
NNOIHIKA_1941.00.01.0
NNOIHIKA_1950.01.00.0
NNOIHIKA_1960.01.00.0
NNOIHIKA_1971.00.01.0
NNOIHIKA_1981.00.01.0
NNOIHIKA_1990.01.00.0
NNOIHIKA_2001.00.01.0
NNOIHIKA_2011.00.01.0
NNOIHIKA_2021.00.01.0
NNOIHIKA_2031.00.01.0
NNOIHIKA_2040.01.00.0
NNOIHIKA_2051.00.01.0
NNOIHIKA_2060.01.00.0
NNOIHIKA_2071.00.01.0
NNOIHIKA_2081.00.01.0
NNOIHIKA_2091.00.01.0
NNOIHIKA_2100.01.00.0
NNOIHIKA_2111.00.01.0
NNOIHIKA_2120.01.00.0
NNOIHIKA_2131.00.01.0
NNOIHIKA_2140.01.00.0
NNOIHIKA_2151.00.01.0
NNOIHIKA_2160.01.00.0
NNOIHIKA_2170.01.00.0
NNOIHIKA_2181.00.01.0
NNOIHIKA_2191.00.01.0
NNOIHIKA_2200.01.00.0
NNOIHIKA_2210.01.00.0
NNOIHIKA_2220.01.00.0
NNOIHIKA_2231.00.01.0
NNOIHIKA_2241.00.01.0
NNOIHIKA_2250.01.00.0
NNOIHIKA_2261.00.01.0
NNOIHIKA_2271.00.01.0
NNOIHIKA_2281.00.01.0
NNOIHIKA_2291.00.01.0
NNOIHIKA_2300.01.00.0
NNOIHIKA_2310.01.00.0
NNOIHIKA_2321.00.01.0
NNOIHIKA_2330.01.00.0
NNOIHIKA_2340.01.00.0
NNOIHIKA_2350.01.00.0
NNOIHIKA_2360.01.00.0
NNOIHIKA_2370.01.00.0
NNOIHIKA_2381.00.01.0
NNOIHIKA_2391.00.01.0
NNOIHIKA_2401.00.01.0
NNOIHIKA_2410.01.00.0
NNOIHIKA_2420.01.00.0
NNOIHIKA_2430.01.00.0
NNOIHIKA_2440.01.00.0
NNOIHIKA_2450.01.00.0
NNOIHIKA_2461.00.01.0
NNOIHIKA_2471.00.01.0
NNOIHIKA_2480.01.00.0
NNOIHIKA_2491.00.01.0
NNOIHIKA_2501.00.01.0
NNOIHIKA_2511.00.01.0
NNOIHIKA_2521.00.01.0
NNOIHIKA_2531.00.01.0
NNOIHIKA_2541.00.01.0
NNOIHIKA_2550.01.00.0
NNOIHIKA_2561.00.01.0
NNOIHIKA_2571.00.01.0
NNOIHIKA_2581.00.01.0
NNOIHIKA_2590.01.00.0
NNOIHIKA_2601.00.01.0
NNOIHIKA_2610.01.00.0
NNOIHIKA_2620.01.00.0
NNOIHIKA_2630.01.00.0
NNOIHIKA_2640.01.00.0
NNOIHIKA_2650.01.00.0
NNOIHIKA_2660.01.00.0
NNOIHIKA_2670.01.00.0
NNOIHIKA_2680.01.00.0
NNOIHIKA_2691.00.01.0
NNOIHIKA_2701.00.01.0
NNOIHIKA_2711.00.01.0
NNOIHIKA_2720.01.00.0
NNOIHIKA_2731.00.01.0
NNOIHIKA_2741.00.01.0
NNOIHIKA_2751.00.01.0
NNOIHIKA_2761.00.01.0
NNOIHIKA_2770.01.00.0
NNOIHIKA_2781.00.01.0
NNOIHIKA_2791.00.01.0
NNOIHIKA_2800.01.00.0
NNOIHIKA_2811.00.01.0
NNOIHIKA_2820.01.00.0
NNOIHIKA_2840.01.00.0
NNOIHIKA_2851.00.01.0
NNOIHIKA_2860.01.00.0
NNOIHIKA_2870.01.00.0
NNOIHIKA_2880.01.00.0
NNOIHIKA_2890.01.00.0
NNOIHIKA_2900.01.00.0
NNOIHIKA_2910.01.00.0
NNOIHIKA_2920.01.00.0
NNOIHIKA_2930.01.00.0
NNOIHIKA_2940.01.00.0
NNOIHIKA_2950.01.00.0
NNOIHIKA_2960.01.00.0
NNOIHIKA_2970.01.00.0
NNOIHIKA_2981.00.01.0
NNOIHIKA_2990.01.00.0
NNOIHIKA_3000.01.00.0
NNOIHIKA_3011.00.01.0
NNOIHIKA_3020.01.00.0
NNOIHIKA_3031.00.01.0
NNOIHIKA_3041.00.01.0
NNOIHIKA_3051.00.01.0
NNOIHIKA_3061.00.01.0
NNOIHIKA_3070.01.00.0
NNOIHIKA_3081.00.01.0
NNOIHIKA_3091.00.01.0
NNOIHIKA_3100.01.00.0
NNOIHIKA_3111.00.01.0
NNOIHIKA_3120.01.00.0
NNOIHIKA_3131.00.01.0
NNOIHIKA_3141.00.01.0
NNOIHIKA_3151.00.01.0
NNOIHIKA_3161.00.01.0
NNOIHIKA_3171.00.01.0
NNOIHIKA_3180.01.00.0
NNOIHIKA_3190.01.00.0
NNOIHIKA_3201.00.01.0
NNOIHIKA_3211.00.01.0
NNOIHIKA_3221.00.01.0
NNOIHIKA_3230.01.00.0
NNOIHIKA_3241.00.01.0
NNOIHIKA_3250.01.00.0
NNOIHIKA_3261.00.01.0
NNOIHIKA_3271.00.01.0
NNOIHIKA_3281.00.01.0
NNOIHIKA_3291.00.01.0
NNOIHIKA_3300.01.00.0
NNOIHIKA_3310.01.00.0
NNOIHIKA_3320.01.00.0
NNOIHIKA_3330.01.00.0
NNOIHIKA_3340.01.00.0
NNOIHIKA_3351.00.01.0
NNOIHIKA_3361.00.01.0
NNOIHIKA_3370.01.00.0
NNOIHIKA_3381.00.01.0
NNOIHIKA_3391.00.01.0
NNOIHIKA_3400.01.00.0
NNOIHIKA_3411.00.01.0
NNOIHIKA_3420.01.00.0
NNOIHIKA_3431.00.01.0
NNOIHIKA_3440.01.00.0
NNOIHIKA_3451.00.01.0
NNOIHIKA_3460.01.00.0
NNOIHIKA_3471.00.01.0
NNOIHIKA_3481.00.01.0
NNOIHIKA_3491.00.01.0
NNOIHIKA_3500.01.00.0
NNOIHIKA_3510.01.00.0
NNOIHIKA_3521.00.01.0
NNOIHIKA_3531.00.01.0
NNOIHIKA_3541.00.01.0
NNOIHIKA_3550.01.00.0
NNOIHIKA_3561.00.01.0
NNOIHIKA_3571.00.01.0
NNOIHIKA_3581.00.01.0
NNOIHIKA_3590.01.00.0
NNOIHIKA_3601.00.01.0
NNOIHIKA_3611.00.01.0
NNOIHIKA_3621.00.01.0
NNOIHIKA_3630.01.00.0
NNOIHIKA_3650.01.00.0
NNOIHIKA_3660.01.00.0
NNOIHIKA_3670.01.00.0
NNOIHIKA_3681.00.01.0
NNOIHIKA_3691.00.01.0
NNOIHIKA_3700.01.00.0
NNOIHIKA_3711.00.01.0
NNOIHIKA_3721.00.01.0
NNOIHIKA_3731.00.01.0
NNOIHIKA_3740.01.00.0
NNOIHIKA_3750.01.00.0
NNOIHIKA_3761.00.01.0
NNOIHIKA_3770.01.00.0
NNOIHIKA_3781.00.01.0
NNOIHIKA_3790.01.00.0
NNOIHIKA_3801.00.01.0
NNOIHIKA_3811.00.01.0
NNOIHIKA_3820.01.00.0
NNOIHIKA_3830.01.00.0
NNOIHIKA_3841.00.01.0
NNOIHIKA_3851.00.01.0
NNOIHIKA_3861.00.01.0
NNOIHIKA_3870.01.00.0
NNOIHIKA_3880.01.00.0
NNOIHIKA_3891.00.01.0
NNOIHIKA_3900.01.00.0
NNOIHIKA_3921.00.01.0
NNOIHIKA_3931.00.01.0
NNOIHIKA_3941.00.01.0
NNOIHIKA_3951.00.01.0
NNOIHIKA_3961.00.01.0
NNOIHIKA_3970.01.00.0
NNOIHIKA_3980.01.00.0
NNOIHIKA_3990.01.00.0
NNOIHIKA_4000.01.00.0
NNOIHIKA_4011.00.01.0
NNOIHIKA_4020.01.00.0
NNOIHIKA_4031.00.01.0
NNOIHIKA_4040.01.00.0
NNOIHIKA_4051.00.01.0
NNOIHIKA_4060.01.00.0
NNOIHIKA_4081.00.01.0
NNOIHIKA_4090.01.00.0
NNOIHIKA_4100.01.00.0
NNOIHIKA_4111.00.01.0
NNOIHIKA_4121.00.01.0
NNOIHIKA_4130.01.00.0
NNOIHIKA_4141.00.01.0
NNOIHIKA_4150.01.00.0
NNOIHIKA_4160.01.00.0
NNOIHIKA_4170.01.00.0
NNOIHIKA_4181.00.01.0
NNOIHIKA_4190.01.00.0
NNOIHIKA_4200.01.00.0
NNOIHIKA_4210.01.00.0
NNOIHIKA_4221.00.01.0
NNOIHIKA_4230.01.00.0
NNOIHIKA_4241.00.01.0
NNOIHIKA_4251.00.01.0
NNOIHIKA_4260.01.00.0
NNOIHIKA_4270.01.00.0
NNOIHIKA_4280.01.00.0
NNOIHIKA_4290.01.00.0
NNOIHIKA_4300.01.00.0
NNOIHIKA_4310.01.00.0
NNOIHIKA_4320.01.00.0
NNOIHIKA_4331.00.01.0
NNOIHIKA_4340.01.00.0
NNOIHIKA_4350.01.00.0
NNOIHIKA_4360.01.00.0
NNOIHIKA_4370.01.00.0
NNOIHIKA_4380.01.00.0
NNOIHIKA_4390.01.00.0
NNOIHIKA_4400.01.00.0
NNOIHIKA_4410.01.00.0
NNOIHIKA_4420.01.00.0
NNOIHIKA_4430.01.00.0
NNOIHIKA_4440.01.00.0
NNOIHIKA_4450.01.00.0
NNOIHIKA_4460.01.00.0
NNOIHIKA_4470.01.00.0
NNOIHIKA_4480.01.00.0
NNOIHIKA_4490.01.00.0
NNOIHIKA_4500.01.00.0
NNOIHIKA_4510.01.00.0
NNOIHIKA_4520.01.00.0
NNOIHIKA_4531.00.01.0
NNOIHIKA_4540.01.00.0
NNOIHIKA_4550.01.00.0
NNOIHIKA_4560.01.00.0
NNOIHIKA_4570.01.00.0
NNOIHIKA_4581.00.01.0
NNOIHIKA_4590.01.00.0
NNOIHIKA_4600.01.00.0
NNOIHIKA_4610.01.00.0
NNOIHIKA_4620.01.00.0
NNOIHIKA_4631.00.01.0
NNOIHIKA_4640.01.00.0
NNOIHIKA_4650.01.00.0
NNOIHIKA_4660.01.00.0
NNOIHIKA_4671.00.01.0
NNOIHIKA_4681.00.01.0
NNOIHIKA_4690.01.00.0
NNOIHIKA_4700.01.00.0
NNOIHIKA_4710.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements