Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
4004.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
CJGPPNMC_3252425625668tet(Q)ARO:3000191tet(Q)88.3071.54Z21523.1
CJGPPNMC_3252237723513tet(X)ARO:3000205tet(X)99.7497.42M37699.1
CJGPPNMC_3252136422164ErmFARO:3000498ErmF99.62100.00M17124.1
CJGPPNMC_8737794669CblA-1ARO:3002999CblA-1100.00100.00GQ343019.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
CJGPPNMC_3252136422164erm(F)Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S100.00100.00M17808
CJGPPNMC_3252237723543tet(X)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline, Tigecycline99.91100.00M37699
CJGPPNMC_3252425625668tet(Q)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline90.8073.36L33696

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
CJGPPNMC_8737794666cblACblA family class A beta-lactamaseEXACTX100.00100.00WP_005827792.1
CJGPPNMC_3252136422161erm(F)23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(F)EXACTX100.00100.00WP_002682030.1
CJGPPNMC_3252238023543tet(X2)tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X2)BLASTX99.74100.00WP_008651082.1
CJGPPNMC_3252425925668tet(Q)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q)PARTIAL_CONTIG_ENDX89.1573.32WP_063856407.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
CJGPPNMC_18517882467repUS2682 / 68199.27BFU30316

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
CJGPPNMC_10.01.00.0
CJGPPNMC_20.01.00.0
CJGPPNMC_30.01.00.0
CJGPPNMC_40.01.00.0
CJGPPNMC_50.01.00.0
CJGPPNMC_60.01.00.0
CJGPPNMC_70.01.00.0
CJGPPNMC_80.01.00.0
CJGPPNMC_90.01.00.0
CJGPPNMC_100.01.00.0
CJGPPNMC_110.01.00.0
CJGPPNMC_120.01.00.0
CJGPPNMC_131.00.01.0
CJGPPNMC_140.01.00.0
CJGPPNMC_150.01.00.0
CJGPPNMC_160.01.00.0
CJGPPNMC_170.01.00.0
CJGPPNMC_180.01.00.0
CJGPPNMC_190.01.00.0
CJGPPNMC_200.01.00.0
CJGPPNMC_210.01.00.0
CJGPPNMC_220.01.00.0
CJGPPNMC_230.01.00.0
CJGPPNMC_241.00.01.0
CJGPPNMC_250.01.00.0
CJGPPNMC_261.00.01.0
CJGPPNMC_271.00.01.0
CJGPPNMC_280.01.00.0
CJGPPNMC_290.01.00.0
CJGPPNMC_301.00.01.0
CJGPPNMC_310.01.00.0
CJGPPNMC_320.01.00.0
CJGPPNMC_330.01.00.0
CJGPPNMC_340.01.00.0
CJGPPNMC_351.00.01.0
CJGPPNMC_360.01.00.0
CJGPPNMC_370.01.00.0
CJGPPNMC_380.01.00.0
CJGPPNMC_390.01.00.0
CJGPPNMC_400.01.00.0
CJGPPNMC_410.01.00.0
CJGPPNMC_420.01.00.0
CJGPPNMC_431.00.01.0
CJGPPNMC_440.01.00.0
CJGPPNMC_450.01.00.0
CJGPPNMC_460.01.00.0
CJGPPNMC_470.01.00.0
CJGPPNMC_480.01.00.0
CJGPPNMC_491.00.01.0
CJGPPNMC_500.01.00.0
CJGPPNMC_511.00.01.0
CJGPPNMC_520.01.00.0
CJGPPNMC_530.01.00.0
CJGPPNMC_540.01.00.0
CJGPPNMC_550.01.00.0
CJGPPNMC_560.01.00.0
CJGPPNMC_570.01.00.0
CJGPPNMC_580.01.00.0
CJGPPNMC_590.01.00.0
CJGPPNMC_600.01.00.0
CJGPPNMC_610.01.00.0
CJGPPNMC_620.01.00.0
CJGPPNMC_630.01.00.0
CJGPPNMC_640.01.00.0
CJGPPNMC_650.01.00.0
CJGPPNMC_660.01.00.0
CJGPPNMC_670.01.00.0
CJGPPNMC_680.01.00.0
CJGPPNMC_690.01.00.0
CJGPPNMC_700.01.00.0
CJGPPNMC_711.00.01.0
CJGPPNMC_720.01.00.0
CJGPPNMC_731.00.01.0
CJGPPNMC_741.00.01.0
CJGPPNMC_751.00.01.0
CJGPPNMC_760.01.00.0
CJGPPNMC_770.01.00.0
CJGPPNMC_781.00.01.0
CJGPPNMC_791.00.01.0
CJGPPNMC_800.01.00.0
CJGPPNMC_811.00.01.0
CJGPPNMC_821.00.01.0
CJGPPNMC_830.01.00.0
CJGPPNMC_841.00.01.0
CJGPPNMC_850.01.00.0
CJGPPNMC_860.01.00.0
CJGPPNMC_870.01.00.0
CJGPPNMC_880.01.00.0
CJGPPNMC_890.01.00.0
CJGPPNMC_900.01.00.0
CJGPPNMC_911.00.01.0
CJGPPNMC_920.01.00.0
CJGPPNMC_931.00.01.0
CJGPPNMC_940.01.00.0
CJGPPNMC_951.00.01.0
CJGPPNMC_960.01.00.0
CJGPPNMC_971.00.01.0
CJGPPNMC_980.01.00.0
CJGPPNMC_991.00.01.0
CJGPPNMC_1001.00.01.0
CJGPPNMC_1010.01.00.0
CJGPPNMC_1021.00.01.0
CJGPPNMC_1030.01.00.0
CJGPPNMC_1040.01.00.0
CJGPPNMC_1051.00.01.0
CJGPPNMC_1061.00.01.0
CJGPPNMC_1070.01.00.0
CJGPPNMC_1081.00.01.0
CJGPPNMC_1090.01.00.0
CJGPPNMC_1100.01.00.0
CJGPPNMC_1110.01.00.0
CJGPPNMC_1120.01.00.0
CJGPPNMC_1130.01.00.0
CJGPPNMC_1140.01.00.0
CJGPPNMC_1151.00.01.0
CJGPPNMC_1161.00.01.0
CJGPPNMC_1170.01.00.0
CJGPPNMC_1181.00.01.0
CJGPPNMC_1190.01.00.0
CJGPPNMC_1200.01.00.0
CJGPPNMC_1211.00.01.0
CJGPPNMC_1220.01.00.0
CJGPPNMC_1230.01.00.0
CJGPPNMC_1240.01.00.0
CJGPPNMC_1250.01.00.0
CJGPPNMC_1260.01.00.0
CJGPPNMC_1271.00.01.0
CJGPPNMC_1281.00.01.0
CJGPPNMC_1291.00.01.0
CJGPPNMC_1301.00.01.0
CJGPPNMC_1311.00.01.0
CJGPPNMC_1330.01.00.0
CJGPPNMC_1340.01.00.0
CJGPPNMC_1351.00.01.0
CJGPPNMC_1360.01.00.0
CJGPPNMC_1370.01.00.0
CJGPPNMC_1380.01.00.0
CJGPPNMC_1390.01.00.0
CJGPPNMC_1401.00.01.0
CJGPPNMC_1410.01.00.0
CJGPPNMC_1421.00.01.0
CJGPPNMC_1431.00.01.0
CJGPPNMC_1440.01.00.0
CJGPPNMC_1450.01.00.0
CJGPPNMC_1461.00.01.0
CJGPPNMC_1470.01.00.0
CJGPPNMC_1480.01.00.0
CJGPPNMC_1490.01.00.0
CJGPPNMC_1500.01.00.0
CJGPPNMC_1511.00.01.0
CJGPPNMC_1520.01.00.0
CJGPPNMC_1531.00.01.0
CJGPPNMC_1541.00.01.0
CJGPPNMC_1550.01.00.0
CJGPPNMC_1560.01.00.0
CJGPPNMC_1570.01.00.0
CJGPPNMC_1581.00.01.0
CJGPPNMC_1590.01.00.0
CJGPPNMC_1600.01.00.0
CJGPPNMC_1610.01.00.0
CJGPPNMC_1621.00.01.0
CJGPPNMC_1631.00.01.0
CJGPPNMC_1641.00.01.0
CJGPPNMC_1651.00.01.0
CJGPPNMC_1660.01.00.0
CJGPPNMC_1671.00.01.0
CJGPPNMC_1681.00.01.0
CJGPPNMC_1690.01.00.0
CJGPPNMC_1701.00.01.0
CJGPPNMC_1710.01.00.0
CJGPPNMC_1721.00.01.0
CJGPPNMC_1731.00.01.0
CJGPPNMC_1740.01.00.0
CJGPPNMC_1750.01.00.0
CJGPPNMC_1760.01.00.0
CJGPPNMC_1770.01.00.0
CJGPPNMC_1781.00.01.0
CJGPPNMC_1790.01.00.0
CJGPPNMC_1800.01.00.0
CJGPPNMC_1810.01.00.0
CJGPPNMC_1821.00.01.0
CJGPPNMC_1830.01.00.0
CJGPPNMC_1841.00.01.0
CJGPPNMC_1851.00.01.0
CJGPPNMC_1860.01.00.0
CJGPPNMC_1870.01.00.0
CJGPPNMC_1880.01.00.0
CJGPPNMC_1891.00.01.0
CJGPPNMC_1900.01.00.0
CJGPPNMC_1910.01.00.0
CJGPPNMC_1921.00.01.0
CJGPPNMC_1930.01.00.0
CJGPPNMC_1941.00.01.0
CJGPPNMC_1950.01.00.0
CJGPPNMC_1961.00.01.0
CJGPPNMC_1970.01.00.0
CJGPPNMC_1981.00.01.0
CJGPPNMC_1990.01.00.0
CJGPPNMC_2000.01.00.0
CJGPPNMC_2011.00.01.0
CJGPPNMC_2021.00.01.0
CJGPPNMC_2030.01.00.0
CJGPPNMC_2041.00.01.0
CJGPPNMC_2050.01.00.0
CJGPPNMC_2061.00.01.0
CJGPPNMC_2070.01.00.0
CJGPPNMC_2081.00.01.0
CJGPPNMC_2090.01.00.0
CJGPPNMC_2100.01.00.0
CJGPPNMC_2111.00.01.0
CJGPPNMC_2121.00.01.0
CJGPPNMC_2130.01.00.0
CJGPPNMC_2141.00.01.0
CJGPPNMC_2151.00.01.0
CJGPPNMC_2160.01.00.0
CJGPPNMC_2171.00.01.0
CJGPPNMC_2180.01.00.0
CJGPPNMC_2190.01.00.0
CJGPPNMC_2201.00.01.0
CJGPPNMC_2210.01.00.0
CJGPPNMC_2220.01.00.0
CJGPPNMC_2231.00.01.0
CJGPPNMC_2240.01.00.0
CJGPPNMC_2250.01.00.0
CJGPPNMC_2261.00.01.0
CJGPPNMC_2271.00.01.0
CJGPPNMC_2281.00.01.0
CJGPPNMC_2291.00.01.0
CJGPPNMC_2301.00.01.0
CJGPPNMC_2310.01.00.0
CJGPPNMC_2320.01.00.0
CJGPPNMC_2330.01.00.0
CJGPPNMC_2341.00.01.0
CJGPPNMC_2351.00.01.0
CJGPPNMC_2360.01.00.0
CJGPPNMC_2370.01.00.0
CJGPPNMC_2381.00.01.0
CJGPPNMC_2391.00.01.0
CJGPPNMC_2401.00.01.0
CJGPPNMC_2411.00.01.0
CJGPPNMC_2421.00.01.0
CJGPPNMC_2431.00.01.0
CJGPPNMC_2440.01.00.0
CJGPPNMC_2451.00.01.0
CJGPPNMC_2460.01.00.0
CJGPPNMC_2470.01.00.0
CJGPPNMC_2480.01.00.0
CJGPPNMC_2491.00.01.0
CJGPPNMC_2500.01.00.0
CJGPPNMC_2510.01.00.0
CJGPPNMC_2521.00.01.0
CJGPPNMC_2531.00.01.0
CJGPPNMC_2541.00.01.0
CJGPPNMC_2550.01.00.0
CJGPPNMC_2561.00.01.0
CJGPPNMC_2570.01.00.0
CJGPPNMC_2581.00.01.0
CJGPPNMC_2591.00.01.0
CJGPPNMC_2600.01.00.0
CJGPPNMC_2611.00.01.0
CJGPPNMC_2620.01.00.0
CJGPPNMC_2651.00.01.0
CJGPPNMC_2660.01.00.0
CJGPPNMC_2671.00.01.0
CJGPPNMC_2681.00.01.0
CJGPPNMC_2691.00.01.0
CJGPPNMC_2700.01.00.0
CJGPPNMC_2710.01.00.0
CJGPPNMC_2721.00.01.0
CJGPPNMC_2730.01.00.0
CJGPPNMC_2751.00.01.0
CJGPPNMC_2761.00.01.0
CJGPPNMC_2770.01.00.0
CJGPPNMC_2780.01.00.0
CJGPPNMC_2791.00.01.0
CJGPPNMC_2801.00.01.0
CJGPPNMC_2811.00.01.0
CJGPPNMC_2821.00.01.0
CJGPPNMC_2831.00.01.0
CJGPPNMC_2840.01.00.0
CJGPPNMC_2850.01.00.0
CJGPPNMC_2861.00.01.0
CJGPPNMC_2871.00.01.0
CJGPPNMC_2880.01.00.0
CJGPPNMC_2891.00.01.0
CJGPPNMC_2900.01.00.0
CJGPPNMC_2910.01.00.0
CJGPPNMC_2920.01.00.0
CJGPPNMC_2930.01.00.0
CJGPPNMC_2940.01.00.0
CJGPPNMC_2950.01.00.0
CJGPPNMC_2960.01.00.0
CJGPPNMC_2971.00.01.0
CJGPPNMC_2980.01.00.0
CJGPPNMC_2990.01.00.0
CJGPPNMC_3000.01.00.0
CJGPPNMC_3010.01.00.0
CJGPPNMC_3020.01.00.0
CJGPPNMC_3030.01.00.0
CJGPPNMC_3040.01.00.0
CJGPPNMC_3051.00.01.0
CJGPPNMC_3060.01.00.0
CJGPPNMC_3070.01.00.0
CJGPPNMC_3080.01.00.0
CJGPPNMC_3090.01.00.0
CJGPPNMC_3100.01.00.0
CJGPPNMC_3110.01.00.0
CJGPPNMC_3121.00.01.0
CJGPPNMC_3130.01.00.0
CJGPPNMC_3140.01.00.0
CJGPPNMC_3150.01.00.0
CJGPPNMC_3160.01.00.0
CJGPPNMC_3170.01.00.0
CJGPPNMC_3180.01.00.0
CJGPPNMC_3190.01.00.0
CJGPPNMC_3200.01.00.0
CJGPPNMC_3210.01.00.0
CJGPPNMC_3220.01.00.0
CJGPPNMC_3230.01.00.0
CJGPPNMC_3240.01.00.0
CJGPPNMC_3250.01.00.0
CJGPPNMC_3260.01.00.0
CJGPPNMC_3271.00.01.0
CJGPPNMC_3280.01.00.0
CJGPPNMC_3290.01.00.0
CJGPPNMC_3300.01.00.0
CJGPPNMC_3310.01.00.0
CJGPPNMC_3321.00.01.0
CJGPPNMC_3330.01.00.0
CJGPPNMC_3340.01.00.0
CJGPPNMC_3350.01.00.0
CJGPPNMC_3360.01.00.0
CJGPPNMC_3370.01.00.0
CJGPPNMC_3380.01.00.0
CJGPPNMC_3390.01.00.0
CJGPPNMC_3400.01.00.0
CJGPPNMC_3410.01.00.0
CJGPPNMC_3421.00.01.0
CJGPPNMC_3430.01.00.0
CJGPPNMC_3440.01.00.0
CJGPPNMC_3450.01.00.0
CJGPPNMC_3460.01.00.0
CJGPPNMC_3470.01.00.0
CJGPPNMC_3480.01.00.0
CJGPPNMC_3491.00.01.0
CJGPPNMC_3500.01.00.0
CJGPPNMC_3510.01.00.0
CJGPPNMC_3520.01.00.0
CJGPPNMC_3531.00.01.0
CJGPPNMC_3540.01.00.0
CJGPPNMC_3550.01.00.0
CJGPPNMC_3560.01.00.0
CJGPPNMC_3570.01.00.0
CJGPPNMC_3580.01.00.0
CJGPPNMC_3590.01.00.0
CJGPPNMC_3600.01.00.0
CJGPPNMC_3610.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements