Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
1001.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
MCAJOALH_1631753618270ErmGARO:3000522ErmG100.00100.00L42817.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
MCAJOALH_1631753618270erm(G)Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S100.00100.00L42817

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
MCAJOALH_1631753618267erm(G)23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(G)EXACTX100.00100.00WP_063844787.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
MCAJOALH_10.01.00.0
MCAJOALH_20.01.00.0
MCAJOALH_30.01.00.0
MCAJOALH_40.01.00.0
MCAJOALH_50.01.00.0
MCAJOALH_60.01.00.0
MCAJOALH_71.00.01.0
MCAJOALH_80.01.00.0
MCAJOALH_90.01.00.0
MCAJOALH_100.01.00.0
MCAJOALH_110.01.00.0
MCAJOALH_120.01.00.0
MCAJOALH_131.00.01.0
MCAJOALH_140.01.00.0
MCAJOALH_150.01.00.0
MCAJOALH_160.01.00.0
MCAJOALH_170.01.00.0
MCAJOALH_181.00.01.0
MCAJOALH_191.00.01.0
MCAJOALH_200.01.00.0
MCAJOALH_210.01.00.0
MCAJOALH_220.01.00.0
MCAJOALH_230.01.00.0
MCAJOALH_240.01.00.0
MCAJOALH_250.01.00.0
MCAJOALH_260.01.00.0
MCAJOALH_270.01.00.0
MCAJOALH_280.01.00.0
MCAJOALH_291.00.01.0
MCAJOALH_300.01.00.0
MCAJOALH_310.01.00.0
MCAJOALH_320.01.00.0
MCAJOALH_330.01.00.0
MCAJOALH_340.01.00.0
MCAJOALH_350.01.00.0
MCAJOALH_361.00.01.0
MCAJOALH_370.01.00.0
MCAJOALH_380.01.00.0
MCAJOALH_390.01.00.0
MCAJOALH_401.00.01.0
MCAJOALH_410.01.00.0
MCAJOALH_421.00.01.0
MCAJOALH_440.01.00.0
MCAJOALH_451.00.01.0
MCAJOALH_460.01.00.0
MCAJOALH_471.00.01.0
MCAJOALH_481.00.01.0
MCAJOALH_491.00.01.0
MCAJOALH_500.01.00.0
MCAJOALH_511.00.01.0
MCAJOALH_521.00.01.0
MCAJOALH_531.00.01.0
MCAJOALH_541.00.01.0
MCAJOALH_550.01.00.0
MCAJOALH_561.00.01.0
MCAJOALH_571.00.01.0
MCAJOALH_581.00.01.0
MCAJOALH_590.01.00.0
MCAJOALH_601.00.01.0
MCAJOALH_611.00.01.0
MCAJOALH_621.00.01.0
MCAJOALH_631.00.01.0
MCAJOALH_641.00.01.0
MCAJOALH_651.00.01.0
MCAJOALH_660.01.00.0
MCAJOALH_671.00.01.0
MCAJOALH_681.00.01.0
MCAJOALH_691.00.01.0
MCAJOALH_701.00.01.0
MCAJOALH_711.00.01.0
MCAJOALH_721.00.01.0
MCAJOALH_731.00.01.0
MCAJOALH_740.01.00.0
MCAJOALH_751.00.01.0
MCAJOALH_761.00.01.0
MCAJOALH_770.01.00.0
MCAJOALH_781.00.01.0
MCAJOALH_790.01.00.0
MCAJOALH_800.01.00.0
MCAJOALH_811.00.01.0
MCAJOALH_821.00.01.0
MCAJOALH_831.00.01.0
MCAJOALH_841.00.01.0
MCAJOALH_851.00.01.0
MCAJOALH_860.01.00.0
MCAJOALH_870.01.00.0
MCAJOALH_880.01.00.0
MCAJOALH_890.01.00.0
MCAJOALH_900.01.00.0
MCAJOALH_911.00.01.0
MCAJOALH_920.01.00.0
MCAJOALH_930.01.00.0
MCAJOALH_940.01.00.0
MCAJOALH_950.01.00.0
MCAJOALH_960.01.00.0
MCAJOALH_970.01.00.0
MCAJOALH_980.01.00.0
MCAJOALH_990.01.00.0
MCAJOALH_1000.01.00.0
MCAJOALH_1010.01.00.0
MCAJOALH_1020.01.00.0
MCAJOALH_1030.01.00.0
MCAJOALH_1040.01.00.0
MCAJOALH_1050.01.00.0
MCAJOALH_1060.01.00.0
MCAJOALH_1070.01.00.0
MCAJOALH_1080.01.00.0
MCAJOALH_1090.01.00.0
MCAJOALH_1100.01.00.0
MCAJOALH_1110.01.00.0
MCAJOALH_1120.01.00.0
MCAJOALH_1130.01.00.0
MCAJOALH_1140.01.00.0
MCAJOALH_1150.01.00.0
MCAJOALH_1160.01.00.0
MCAJOALH_1170.01.00.0
MCAJOALH_1180.01.00.0
MCAJOALH_1190.01.00.0
MCAJOALH_1200.01.00.0
MCAJOALH_1210.01.00.0
MCAJOALH_1220.01.00.0
MCAJOALH_1230.01.00.0
MCAJOALH_1240.01.00.0
MCAJOALH_1250.01.00.0
MCAJOALH_1260.01.00.0
MCAJOALH_1270.01.00.0
MCAJOALH_1280.01.00.0
MCAJOALH_1290.01.00.0
MCAJOALH_1300.01.00.0
MCAJOALH_1310.01.00.0
MCAJOALH_1320.01.00.0
MCAJOALH_1330.01.00.0
MCAJOALH_1341.00.01.0
MCAJOALH_1350.01.00.0
MCAJOALH_1360.01.00.0
MCAJOALH_1370.01.00.0
MCAJOALH_1380.01.00.0
MCAJOALH_1390.01.00.0
MCAJOALH_1400.01.00.0
MCAJOALH_1411.00.01.0
MCAJOALH_1420.01.00.0
MCAJOALH_1430.01.00.0
MCAJOALH_1440.01.00.0
MCAJOALH_1450.01.00.0
MCAJOALH_1460.01.00.0
MCAJOALH_1470.01.00.0
MCAJOALH_1480.01.00.0
MCAJOALH_1490.01.00.0
MCAJOALH_1500.01.00.0
MCAJOALH_1510.01.00.0
MCAJOALH_1520.01.00.0
MCAJOALH_1530.01.00.0
MCAJOALH_1540.01.00.0
MCAJOALH_1550.01.00.0
MCAJOALH_1560.01.00.0
MCAJOALH_1571.00.01.0
MCAJOALH_1580.01.00.0
MCAJOALH_1590.01.00.0
MCAJOALH_1600.01.00.0
MCAJOALH_1610.01.00.0
MCAJOALH_1621.00.01.0
MCAJOALH_1630.01.00.0
MCAJOALH_1640.01.00.0
MCAJOALH_1650.01.00.0
MCAJOALH_1661.00.01.0
MCAJOALH_1671.00.01.0
MCAJOALH_1680.01.00.0
MCAJOALH_1690.01.00.0
MCAJOALH_1700.01.00.0
MCAJOALH_1710.01.00.0
MCAJOALH_1720.01.00.0
MCAJOALH_1730.01.00.0
MCAJOALH_1740.01.00.0
MCAJOALH_1750.01.00.0
MCAJOALH_1760.01.00.0
MCAJOALH_1771.00.01.0
MCAJOALH_1781.00.01.0
MCAJOALH_1790.01.00.0
MCAJOALH_1800.01.00.0
MCAJOALH_1810.01.00.0
MCAJOALH_1820.01.00.0
MCAJOALH_1830.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
MCAJOALH_224703550326FalseUnknownVOG8909,
MCAJOALH_881983928255FalseUnknownVOG4573,
MCAJOALH_166257111768FalseUnknownVOG4573,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements