Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 5 | 0 | 0 | 5.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MEGPPFDI_12 | 5667 | 6530 | aadS | ARO:3004683 | aadS | 100.00 | 100.00 | M72415.1 |
| MEGPPFDI_12 | 4355 | 5491 | tet(X) | ARO:3000205 | tet(X) | 99.47 | 97.42 | M37699.1 |
| MEGPPFDI_12 | 3017 | 4156 | tet(X1) | ARO:3005166 | tet(X1) | 99.72 | 105.57 | AJ311171.1 |
| MEGPPFDI_12 | 1911 | 2711 | ErmF | ARO:3000498 | ErmF | 97.74 | 100.00 | M17124.1 |
| MEGPPFDI_213 | 428 | 2401 | tet(Q) | ARO:3000191 | tet(Q) | 96.96 | 100.00 | Z21523.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MEGPPFDI_12 | 1911 | 2711 | erm(F) | Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 99.88 | 100.00 | M62487 |
| MEGPPFDI_12 | 4325 | 5491 | tet(X) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline, Tigecycline | 99.83 | 100.00 | M37699 |
| MEGPPFDI_213 | 428 | 2353 | tet(Q) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline | 99.22 | 100.00 | X58717 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MEGPPFDI_12 | 5667 | 6527 | aadS | aminoglycoside 6-adenylyltransferase AadS | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_003013318.1 |
| MEGPPFDI_12 | 4325 | 5488 | tet(X2) | tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X2) | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_008651082.1 |
| MEGPPFDI_12 | 3017 | 4153 | tet(X1) | tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X1) | BLASTX | 99.74 | 100.00 | WP_204376222.1 |
| MEGPPFDI_12 | 1914 | 2711 | erm(F) | 23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(F) | BLASTX | 99.62 | 100.00 | WP_063844771.1 |
| MEGPPFDI_213 | 431 | 2353 | tet(Q) | tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q) | BLASTX | 99.22 | 100.00 | WP_004293868.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MEGPPFDI_231 | 1742 | 2421 | repUS2 | 682 / 681 | 99.27 | BFU30316 |
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| MEGPPFDI_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_23 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_25 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_31 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_41 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_42 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_43 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_53 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_61 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_64 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_67 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_68 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_71 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_75 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_76 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_80 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_85 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_87 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_89 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_92 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_94 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_95 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_96 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_98 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_108 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_109 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_114 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_122 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_124 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_125 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_127 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_129 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_130 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_132 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_134 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_135 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_136 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_137 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_138 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_141 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_146 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_147 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_148 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_149 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_150 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_152 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_153 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_154 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_155 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_157 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_158 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_160 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_161 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_162 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_163 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_167 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_169 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_171 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_172 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_173 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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| MEGPPFDI_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_178 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_179 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_180 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_181 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_182 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_183 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_184 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_185 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_186 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_187 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_188 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_189 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_190 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_191 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_192 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_193 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_194 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_195 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_196 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_197 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_198 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_199 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_200 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_201 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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| MEGPPFDI_206 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_207 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_208 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
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| MEGPPFDI_210 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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| MEGPPFDI_218 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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| MEGPPFDI_220 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_221 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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| MEGPPFDI_223 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_224 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_225 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_226 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_227 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_228 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_229 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_230 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_231 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_232 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_233 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_234 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_235 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_236 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_237 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_238 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_239 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_240 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_241 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_242 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_243 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MEGPPFDI_244 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_245 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MEGPPFDI_246 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
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Prophage
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