Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 4 | 0 | 0 | 4.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| KEDEJLDD_389 | 35072 | 35872 | ErmF | ARO:3000498 | ErmF | 97.74 | 100.00 | M17124.1 |
| KEDEJLDD_389 | 33627 | 34766 | tet(X1) | ARO:3005166 | tet(X1) | 99.72 | 105.57 | AJ311171.1 |
| KEDEJLDD_389 | 32292 | 33428 | tet(X) | ARO:3000205 | tet(X) | 99.47 | 97.42 | M37699.1 |
| KEDEJLDD_389 | 31253 | 32116 | aadS | ARO:3004683 | aadS | 100.00 | 100.00 | M72415.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| KEDEJLDD_389 | 35072 | 35872 | erm(F) | Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 99.88 | 100.00 | M62487 |
| KEDEJLDD_389 | 32292 | 33458 | tet(X) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline, Tigecycline | 99.83 | 100.00 | M37699 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| KEDEJLDD_389 | 31256 | 32116 | aadS | aminoglycoside 6-adenylyltransferase AadS | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_003013318.1 |
| KEDEJLDD_389 | 32295 | 33458 | tet(X2) | tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X2) | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_008651082.1 |
| KEDEJLDD_389 | 33630 | 34766 | tet(X1) | tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X1) | BLASTX | 99.74 | 100.00 | WP_204376222.1 |
| KEDEJLDD_389 | 35072 | 35869 | erm(F) | 23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(F) | BLASTX | 99.62 | 100.00 | WP_063844771.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| KEDEJLDD_211 | 316 | 995 | repUS2 | 682 / 681 | 99.27 | BFU30316 |
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| KEDEJLDD_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_2 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_23 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_26 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_34 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_49 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_50 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_58 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_62 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_63 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_67 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_68 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_70 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_71 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_72 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_74 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_75 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_76 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_78 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_80 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_81 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_85 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_90 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_94 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_96 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_100 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_102 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_107 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_109 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_113 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_119 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_125 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_126 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_127 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_129 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_132 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_134 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_136 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_141 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_142 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_146 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_147 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_148 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_150 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_152 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_153 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_154 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_155 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_158 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_160 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_161 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_162 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_164 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_165 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_167 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_168 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_169 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_171 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_172 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_173 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_175 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_176 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_178 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_179 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_180 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_181 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_183 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_184 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_185 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_186 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_187 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_188 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_189 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_190 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_191 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_192 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_193 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_194 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_195 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_196 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_197 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_198 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_199 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_200 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_201 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_203 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_204 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_205 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_206 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_207 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_208 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_209 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_210 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_211 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_212 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_213 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_214 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_215 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_216 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_217 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_218 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_219 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_220 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_221 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_222 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_223 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_224 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_225 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_226 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_227 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_228 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_229 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_230 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_231 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_232 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_233 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_234 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_235 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_236 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_237 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_238 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_239 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_240 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_241 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_242 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_243 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_244 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_245 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_246 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_247 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_248 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_249 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KEDEJLDD_250 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_251 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KEDEJLDD_252 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
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