Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
4004.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
MFKEMLLI_556676530aadSARO:3004683aadS100.00100.00M72415.1
MFKEMLLI_543555491tet(X)ARO:3000205tet(X)99.4797.42M37699.1
MFKEMLLI_530174156tet(X1)ARO:3005166tet(X1)99.72105.57AJ311171.1
MFKEMLLI_519112711ErmFARO:3000498ErmF97.74100.00M17124.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
MFKEMLLI_519112711erm(F)Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S99.88100.00M62487
MFKEMLLI_543255491tet(X)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline, Tigecycline99.83100.00M37699

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
MFKEMLLI_556676527aadSaminoglycoside 6-adenylyltransferase AadSEXACTX100.00100.00WP_003013318.1
MFKEMLLI_543255488tet(X2)tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X2)EXACTX100.00100.00WP_008651082.1
MFKEMLLI_530174153tet(X1)tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X1)BLASTX99.74100.00WP_204376222.1
MFKEMLLI_519142711erm(F)23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(F)BLASTX99.62100.00WP_063844771.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
MFKEMLLI_10.01.00.0
MFKEMLLI_20.01.00.0
MFKEMLLI_30.01.00.0
MFKEMLLI_40.01.00.0
MFKEMLLI_50.01.00.0
MFKEMLLI_60.01.00.0
MFKEMLLI_70.01.00.0
MFKEMLLI_80.01.00.0
MFKEMLLI_90.01.00.0
MFKEMLLI_101.00.01.0
MFKEMLLI_110.01.00.0
MFKEMLLI_120.01.00.0
MFKEMLLI_130.01.00.0
MFKEMLLI_140.01.00.0
MFKEMLLI_150.01.00.0
MFKEMLLI_160.01.00.0
MFKEMLLI_170.01.00.0
MFKEMLLI_180.01.00.0
MFKEMLLI_190.01.00.0
MFKEMLLI_200.01.00.0
MFKEMLLI_210.01.00.0
MFKEMLLI_220.01.00.0
MFKEMLLI_230.01.00.0
MFKEMLLI_240.01.00.0
MFKEMLLI_250.01.00.0
MFKEMLLI_260.01.00.0
MFKEMLLI_271.00.01.0
MFKEMLLI_281.00.01.0
MFKEMLLI_290.01.00.0
MFKEMLLI_301.00.01.0
MFKEMLLI_310.01.00.0
MFKEMLLI_320.01.00.0
MFKEMLLI_330.01.00.0
MFKEMLLI_340.01.00.0
MFKEMLLI_350.01.00.0
MFKEMLLI_361.00.01.0
MFKEMLLI_370.01.00.0
MFKEMLLI_380.01.00.0
MFKEMLLI_390.01.00.0
MFKEMLLI_400.01.00.0
MFKEMLLI_411.00.01.0
MFKEMLLI_421.00.01.0
MFKEMLLI_430.01.00.0
MFKEMLLI_440.01.00.0
MFKEMLLI_450.01.00.0
MFKEMLLI_460.01.00.0
MFKEMLLI_470.01.00.0
MFKEMLLI_480.01.00.0
MFKEMLLI_491.00.01.0
MFKEMLLI_500.01.00.0
MFKEMLLI_510.01.00.0
MFKEMLLI_521.00.01.0
MFKEMLLI_530.01.00.0
MFKEMLLI_540.01.00.0
MFKEMLLI_550.01.00.0
MFKEMLLI_560.01.00.0
MFKEMLLI_570.01.00.0
MFKEMLLI_581.00.01.0
MFKEMLLI_591.00.01.0
MFKEMLLI_600.01.00.0
MFKEMLLI_610.01.00.0
MFKEMLLI_621.00.01.0
MFKEMLLI_630.01.00.0
MFKEMLLI_641.00.01.0
MFKEMLLI_650.01.00.0
MFKEMLLI_660.01.00.0
MFKEMLLI_670.01.00.0
MFKEMLLI_680.01.00.0
MFKEMLLI_690.01.00.0
MFKEMLLI_700.01.00.0
MFKEMLLI_710.01.00.0
MFKEMLLI_721.00.01.0
MFKEMLLI_731.00.01.0
MFKEMLLI_740.01.00.0
MFKEMLLI_750.01.00.0
MFKEMLLI_761.00.01.0
MFKEMLLI_770.01.00.0
MFKEMLLI_781.00.01.0
MFKEMLLI_790.01.00.0
MFKEMLLI_800.01.00.0
MFKEMLLI_810.01.00.0
MFKEMLLI_821.00.01.0
MFKEMLLI_830.01.00.0
MFKEMLLI_840.01.00.0
MFKEMLLI_851.00.01.0
MFKEMLLI_860.01.00.0
MFKEMLLI_871.00.01.0
MFKEMLLI_880.01.00.0
MFKEMLLI_890.01.00.0
MFKEMLLI_900.01.00.0
MFKEMLLI_910.01.00.0
MFKEMLLI_920.01.00.0
MFKEMLLI_930.01.00.0
MFKEMLLI_940.01.00.0
MFKEMLLI_950.01.00.0
MFKEMLLI_960.01.00.0
MFKEMLLI_970.01.00.0
MFKEMLLI_980.01.00.0
MFKEMLLI_990.01.00.0
MFKEMLLI_1001.00.01.0
MFKEMLLI_1010.01.00.0
MFKEMLLI_1020.01.00.0
MFKEMLLI_1031.00.01.0
MFKEMLLI_1040.01.00.0
MFKEMLLI_1050.01.00.0
MFKEMLLI_1061.00.01.0
MFKEMLLI_1070.01.00.0
MFKEMLLI_1081.00.01.0
MFKEMLLI_1091.00.01.0
MFKEMLLI_1100.01.00.0
MFKEMLLI_1110.01.00.0
MFKEMLLI_1120.01.00.0
MFKEMLLI_1130.01.00.0
MFKEMLLI_1140.01.00.0
MFKEMLLI_1150.01.00.0
MFKEMLLI_1161.00.01.0
MFKEMLLI_1170.01.00.0
MFKEMLLI_1181.00.01.0
MFKEMLLI_1191.00.01.0
MFKEMLLI_1200.01.00.0
MFKEMLLI_1211.00.01.0
MFKEMLLI_1220.01.00.0
MFKEMLLI_1230.01.00.0
MFKEMLLI_1241.00.01.0
MFKEMLLI_1250.01.00.0
MFKEMLLI_1260.01.00.0
MFKEMLLI_1271.00.01.0
MFKEMLLI_1280.01.00.0
MFKEMLLI_1290.01.00.0
MFKEMLLI_1301.00.01.0
MFKEMLLI_1311.00.01.0
MFKEMLLI_1321.00.01.0
MFKEMLLI_1330.01.00.0
MFKEMLLI_1341.00.01.0
MFKEMLLI_1350.01.00.0
MFKEMLLI_1360.01.00.0
MFKEMLLI_1370.01.00.0
MFKEMLLI_1380.01.00.0
MFKEMLLI_1391.00.01.0
MFKEMLLI_1400.01.00.0
MFKEMLLI_1411.00.01.0
MFKEMLLI_1420.01.00.0
MFKEMLLI_1431.00.01.0
MFKEMLLI_1440.01.00.0
MFKEMLLI_1450.01.00.0
MFKEMLLI_1460.01.00.0
MFKEMLLI_1470.01.00.0
MFKEMLLI_1481.00.01.0
MFKEMLLI_1490.01.00.0
MFKEMLLI_1500.01.00.0
MFKEMLLI_1510.01.00.0
MFKEMLLI_1520.01.00.0
MFKEMLLI_1531.00.01.0
MFKEMLLI_1540.01.00.0
MFKEMLLI_1550.01.00.0
MFKEMLLI_1560.01.00.0
MFKEMLLI_1570.01.00.0
MFKEMLLI_1581.00.01.0
MFKEMLLI_1590.01.00.0
MFKEMLLI_1601.00.01.0
MFKEMLLI_1611.00.01.0
MFKEMLLI_1621.00.01.0
MFKEMLLI_1630.01.00.0
MFKEMLLI_1640.01.00.0
MFKEMLLI_1650.01.00.0
MFKEMLLI_1660.01.00.0
MFKEMLLI_1671.00.01.0
MFKEMLLI_1680.01.00.0
MFKEMLLI_1691.00.01.0
MFKEMLLI_1700.01.00.0
MFKEMLLI_1710.01.00.0
MFKEMLLI_1721.00.01.0
MFKEMLLI_1730.01.00.0
MFKEMLLI_1740.01.00.0
MFKEMLLI_1751.00.01.0
MFKEMLLI_1761.00.01.0
MFKEMLLI_1770.01.00.0
MFKEMLLI_1780.01.00.0
MFKEMLLI_1790.01.00.0
MFKEMLLI_1801.00.01.0
MFKEMLLI_1810.01.00.0
MFKEMLLI_1821.00.01.0
MFKEMLLI_1830.01.00.0
MFKEMLLI_1840.01.00.0
MFKEMLLI_1850.01.00.0
MFKEMLLI_1860.01.00.0
MFKEMLLI_1870.01.00.0
MFKEMLLI_1880.01.00.0
MFKEMLLI_1890.01.00.0
MFKEMLLI_1901.00.01.0
MFKEMLLI_1911.00.01.0
MFKEMLLI_1920.01.00.0
MFKEMLLI_1931.00.01.0
MFKEMLLI_1941.00.01.0
MFKEMLLI_1951.00.01.0
MFKEMLLI_1961.00.01.0
MFKEMLLI_1970.01.00.0
MFKEMLLI_1981.00.01.0
MFKEMLLI_1990.01.00.0
MFKEMLLI_2000.01.00.0
MFKEMLLI_2010.01.00.0
MFKEMLLI_2020.01.00.0
MFKEMLLI_2040.01.00.0
MFKEMLLI_2051.00.01.0
MFKEMLLI_2061.00.01.0
MFKEMLLI_2070.01.00.0
MFKEMLLI_2081.00.01.0
MFKEMLLI_2091.00.01.0
MFKEMLLI_2100.01.00.0
MFKEMLLI_2110.01.00.0
MFKEMLLI_2120.01.00.0
MFKEMLLI_2131.00.01.0
MFKEMLLI_2141.00.01.0
MFKEMLLI_2150.01.00.0
MFKEMLLI_2160.01.00.0
MFKEMLLI_2171.00.01.0
MFKEMLLI_2180.01.00.0
MFKEMLLI_2190.01.00.0
MFKEMLLI_2200.01.00.0
MFKEMLLI_2210.01.00.0
MFKEMLLI_2220.01.00.0
MFKEMLLI_2230.01.00.0
MFKEMLLI_2240.01.00.0
MFKEMLLI_2250.01.00.0
MFKEMLLI_2261.00.01.0
MFKEMLLI_2270.01.00.0
MFKEMLLI_2280.01.00.0
MFKEMLLI_2290.01.00.0
MFKEMLLI_2301.00.01.0
MFKEMLLI_2310.01.00.0
MFKEMLLI_2321.00.01.0
MFKEMLLI_2330.01.00.0
MFKEMLLI_2341.00.01.0
MFKEMLLI_2351.00.01.0
MFKEMLLI_2360.01.00.0
MFKEMLLI_2371.00.01.0
MFKEMLLI_2381.00.01.0
MFKEMLLI_2391.00.01.0
MFKEMLLI_2400.01.00.0
MFKEMLLI_2411.00.01.0
MFKEMLLI_2420.01.00.0
MFKEMLLI_2430.01.00.0
MFKEMLLI_2440.01.00.0
MFKEMLLI_2451.00.01.0
MFKEMLLI_2460.01.00.0
MFKEMLLI_2471.00.01.0
MFKEMLLI_2481.00.01.0
MFKEMLLI_2490.01.00.0
MFKEMLLI_2501.00.01.0
MFKEMLLI_2511.00.01.0
MFKEMLLI_2520.01.00.0
MFKEMLLI_2530.01.00.0
MFKEMLLI_2541.00.01.0
MFKEMLLI_2550.01.00.0
MFKEMLLI_2560.01.00.0
MFKEMLLI_2571.00.01.0
MFKEMLLI_2581.00.01.0
MFKEMLLI_2591.00.01.0
MFKEMLLI_2611.00.01.0
MFKEMLLI_2621.00.01.0
MFKEMLLI_2630.01.00.0
MFKEMLLI_2640.01.00.0
MFKEMLLI_2651.00.01.0
MFKEMLLI_2660.01.00.0
MFKEMLLI_2671.00.01.0
MFKEMLLI_2681.00.01.0
MFKEMLLI_2690.01.00.0
MFKEMLLI_2701.00.01.0
MFKEMLLI_2710.01.00.0
MFKEMLLI_2721.00.01.0
MFKEMLLI_2731.00.01.0
MFKEMLLI_2740.01.00.0
MFKEMLLI_2751.00.01.0
MFKEMLLI_2761.00.01.0
MFKEMLLI_2770.01.00.0
MFKEMLLI_2781.00.01.0
MFKEMLLI_2790.01.00.0
MFKEMLLI_2801.00.01.0
MFKEMLLI_2810.01.00.0
MFKEMLLI_2820.01.00.0
MFKEMLLI_2831.00.01.0
MFKEMLLI_2841.00.01.0
MFKEMLLI_2851.00.01.0
MFKEMLLI_2861.00.01.0
MFKEMLLI_2880.01.00.0
MFKEMLLI_2891.00.01.0
MFKEMLLI_2900.01.00.0
MFKEMLLI_2911.00.01.0
MFKEMLLI_2921.00.01.0
MFKEMLLI_2931.00.01.0
MFKEMLLI_2940.01.00.0
MFKEMLLI_2950.01.00.0
MFKEMLLI_2960.01.00.0
MFKEMLLI_2971.00.01.0
MFKEMLLI_2980.01.00.0
MFKEMLLI_2990.01.00.0
MFKEMLLI_3001.00.01.0
MFKEMLLI_3010.01.00.0
MFKEMLLI_3020.01.00.0
MFKEMLLI_3031.00.01.0
MFKEMLLI_3040.01.00.0
MFKEMLLI_3051.00.01.0
MFKEMLLI_3061.00.01.0
MFKEMLLI_3071.00.01.0
MFKEMLLI_3081.00.01.0
MFKEMLLI_3090.01.00.0
MFKEMLLI_3100.01.00.0
MFKEMLLI_3111.00.01.0
MFKEMLLI_3121.00.01.0
MFKEMLLI_3130.01.00.0
MFKEMLLI_3141.00.01.0
MFKEMLLI_3151.00.01.0
MFKEMLLI_3161.00.01.0
MFKEMLLI_3170.01.00.0
MFKEMLLI_3180.01.00.0
MFKEMLLI_3190.01.00.0
MFKEMLLI_3200.01.00.0
MFKEMLLI_3210.01.00.0
MFKEMLLI_3220.01.00.0
MFKEMLLI_3231.00.01.0
MFKEMLLI_3241.00.01.0
MFKEMLLI_3250.01.00.0
MFKEMLLI_3261.00.01.0
MFKEMLLI_3271.00.01.0
MFKEMLLI_3280.01.00.0
MFKEMLLI_3291.00.01.0
MFKEMLLI_3301.00.01.0
MFKEMLLI_3311.00.01.0
MFKEMLLI_3320.01.00.0
MFKEMLLI_3330.01.00.0
MFKEMLLI_3340.01.00.0
MFKEMLLI_3351.00.01.0
MFKEMLLI_3361.00.01.0
MFKEMLLI_3371.00.01.0
MFKEMLLI_3381.00.01.0
MFKEMLLI_3390.01.00.0
MFKEMLLI_3400.01.00.0
MFKEMLLI_3410.01.00.0
MFKEMLLI_3420.01.00.0
MFKEMLLI_3430.01.00.0
MFKEMLLI_3441.00.01.0
MFKEMLLI_3451.00.01.0
MFKEMLLI_3460.01.00.0
MFKEMLLI_3470.01.00.0
MFKEMLLI_3481.00.01.0
MFKEMLLI_3491.00.01.0
MFKEMLLI_3500.01.00.0
MFKEMLLI_3510.01.00.0
MFKEMLLI_3521.00.01.0
MFKEMLLI_3530.01.00.0
MFKEMLLI_3541.00.01.0
MFKEMLLI_3550.01.00.0
MFKEMLLI_3561.00.01.0
MFKEMLLI_3570.01.00.0
MFKEMLLI_3581.00.01.0
MFKEMLLI_3591.00.01.0
MFKEMLLI_3601.00.01.0
MFKEMLLI_3610.01.00.0
MFKEMLLI_3621.00.01.0
MFKEMLLI_3631.00.01.0
MFKEMLLI_3641.00.01.0
MFKEMLLI_3650.01.00.0
MFKEMLLI_3660.01.00.0
MFKEMLLI_3681.00.01.0
MFKEMLLI_3690.01.00.0
MFKEMLLI_3701.00.01.0
MFKEMLLI_3711.00.01.0
MFKEMLLI_3720.01.00.0
MFKEMLLI_3730.01.00.0
MFKEMLLI_3741.00.01.0
MFKEMLLI_3751.00.01.0
MFKEMLLI_3760.01.00.0
MFKEMLLI_3770.01.00.0
MFKEMLLI_3780.01.00.0
MFKEMLLI_3791.00.01.0
MFKEMLLI_3800.01.00.0
MFKEMLLI_3811.00.01.0
MFKEMLLI_3820.01.00.0
MFKEMLLI_3830.01.00.0
MFKEMLLI_3840.01.00.0
MFKEMLLI_3850.01.00.0
MFKEMLLI_3860.01.00.0
MFKEMLLI_3870.01.00.0
MFKEMLLI_3880.01.00.0
MFKEMLLI_3890.01.00.0
MFKEMLLI_3900.01.00.0
MFKEMLLI_3910.01.00.0
MFKEMLLI_3920.01.00.0
MFKEMLLI_3930.01.00.0
MFKEMLLI_3940.01.00.0
MFKEMLLI_3950.01.00.0
MFKEMLLI_3960.01.00.0
MFKEMLLI_3970.01.00.0
MFKEMLLI_3980.01.00.0
MFKEMLLI_3990.01.00.0
MFKEMLLI_4000.01.00.0
MFKEMLLI_4010.01.00.0
MFKEMLLI_4020.01.00.0
MFKEMLLI_4030.01.00.0
MFKEMLLI_4040.01.00.0
MFKEMLLI_4050.01.00.0
MFKEMLLI_4060.01.00.0
MFKEMLLI_4070.01.00.0
MFKEMLLI_4080.01.00.0
MFKEMLLI_4090.01.00.0
MFKEMLLI_4100.01.00.0
MFKEMLLI_4110.01.00.0
MFKEMLLI_4120.01.00.0
MFKEMLLI_4130.01.00.0
MFKEMLLI_4140.01.00.0
MFKEMLLI_4150.01.00.0
MFKEMLLI_4161.00.01.0
MFKEMLLI_4170.01.00.0
MFKEMLLI_4180.01.00.0
MFKEMLLI_4190.01.00.0
MFKEMLLI_4200.01.00.0
MFKEMLLI_4210.01.00.0
MFKEMLLI_4220.01.00.0
MFKEMLLI_4231.00.01.0
MFKEMLLI_4240.01.00.0
MFKEMLLI_4250.01.00.0
MFKEMLLI_4260.01.00.0
MFKEMLLI_4270.01.00.0
MFKEMLLI_4280.01.00.0
MFKEMLLI_4290.01.00.0
MFKEMLLI_4300.01.00.0
MFKEMLLI_4310.01.00.0
MFKEMLLI_4320.01.00.0
MFKEMLLI_4330.01.00.0
MFKEMLLI_4340.01.00.0
MFKEMLLI_4350.01.00.0
MFKEMLLI_4361.00.01.0
MFKEMLLI_4370.01.00.0
MFKEMLLI_4380.01.00.0
MFKEMLLI_4390.01.00.0
MFKEMLLI_4400.01.00.0
MFKEMLLI_4410.01.00.0
MFKEMLLI_4420.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
MFKEMLLI_111130135144650FalseUnknownVOG0083,
MFKEMLLI_221385410623FalseUnknownVOG6366,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements