Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
4004.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
EFPJCCAL_456676530aadSARO:3004683aadS100.00100.00M72415.1
EFPJCCAL_443555491tet(X)ARO:3000205tet(X)99.4797.42M37699.1
EFPJCCAL_430174156tet(X1)ARO:3005166tet(X1)99.72105.57AJ311171.1
EFPJCCAL_419112711ErmFARO:3000498ErmF97.74100.00M17124.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
EFPJCCAL_419112711erm(F)Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S99.88100.00M62487
EFPJCCAL_443255491tet(X)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline, Tigecycline99.83100.00M37699

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
EFPJCCAL_456676527aadSaminoglycoside 6-adenylyltransferase AadSEXACTX100.00100.00WP_003013318.1
EFPJCCAL_443255488tet(X2)tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X2)EXACTX100.00100.00WP_008651082.1
EFPJCCAL_430174153tet(X1)tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X1)BLASTX99.74100.00WP_204376222.1
EFPJCCAL_419142711erm(F)23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(F)BLASTX99.62100.00WP_063844771.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
EFPJCCAL_10.01.00.0
EFPJCCAL_20.01.00.0
EFPJCCAL_30.01.00.0
EFPJCCAL_40.01.00.0
EFPJCCAL_50.01.00.0
EFPJCCAL_60.01.00.0
EFPJCCAL_70.01.00.0
EFPJCCAL_80.01.00.0
EFPJCCAL_90.01.00.0
EFPJCCAL_100.01.00.0
EFPJCCAL_110.01.00.0
EFPJCCAL_120.01.00.0
EFPJCCAL_130.01.00.0
EFPJCCAL_140.01.00.0
EFPJCCAL_150.01.00.0
EFPJCCAL_160.01.00.0
EFPJCCAL_170.01.00.0
EFPJCCAL_180.01.00.0
EFPJCCAL_191.00.01.0
EFPJCCAL_200.01.00.0
EFPJCCAL_210.01.00.0
EFPJCCAL_220.01.00.0
EFPJCCAL_230.01.00.0
EFPJCCAL_240.01.00.0
EFPJCCAL_251.00.01.0
EFPJCCAL_260.01.00.0
EFPJCCAL_271.00.01.0
EFPJCCAL_280.01.00.0
EFPJCCAL_290.01.00.0
EFPJCCAL_300.01.00.0
EFPJCCAL_311.00.01.0
EFPJCCAL_320.01.00.0
EFPJCCAL_330.01.00.0
EFPJCCAL_340.01.00.0
EFPJCCAL_350.01.00.0
EFPJCCAL_360.01.00.0
EFPJCCAL_370.01.00.0
EFPJCCAL_380.01.00.0
EFPJCCAL_390.01.00.0
EFPJCCAL_400.01.00.0
EFPJCCAL_410.01.00.0
EFPJCCAL_420.01.00.0
EFPJCCAL_430.01.00.0
EFPJCCAL_440.01.00.0
EFPJCCAL_451.00.01.0
EFPJCCAL_460.01.00.0
EFPJCCAL_470.01.00.0
EFPJCCAL_481.00.01.0
EFPJCCAL_491.00.01.0
EFPJCCAL_500.01.00.0
EFPJCCAL_511.00.01.0
EFPJCCAL_520.01.00.0
EFPJCCAL_530.01.00.0
EFPJCCAL_540.01.00.0
EFPJCCAL_550.01.00.0
EFPJCCAL_560.01.00.0
EFPJCCAL_571.00.01.0
EFPJCCAL_580.01.00.0
EFPJCCAL_590.01.00.0
EFPJCCAL_600.01.00.0
EFPJCCAL_610.01.00.0
EFPJCCAL_620.01.00.0
EFPJCCAL_630.01.00.0
EFPJCCAL_640.01.00.0
EFPJCCAL_650.01.00.0
EFPJCCAL_660.01.00.0
EFPJCCAL_671.00.01.0
EFPJCCAL_680.01.00.0
EFPJCCAL_691.00.01.0
EFPJCCAL_701.00.01.0
EFPJCCAL_710.01.00.0
EFPJCCAL_720.01.00.0
EFPJCCAL_731.00.01.0
EFPJCCAL_741.00.01.0
EFPJCCAL_750.01.00.0
EFPJCCAL_760.01.00.0
EFPJCCAL_770.01.00.0
EFPJCCAL_780.01.00.0
EFPJCCAL_790.01.00.0
EFPJCCAL_800.01.00.0
EFPJCCAL_811.00.01.0
EFPJCCAL_820.01.00.0
EFPJCCAL_830.01.00.0
EFPJCCAL_840.01.00.0
EFPJCCAL_851.00.01.0
EFPJCCAL_860.01.00.0
EFPJCCAL_870.01.00.0
EFPJCCAL_880.01.00.0
EFPJCCAL_891.00.01.0
EFPJCCAL_900.01.00.0
EFPJCCAL_910.01.00.0
EFPJCCAL_920.01.00.0
EFPJCCAL_931.00.01.0
EFPJCCAL_940.01.00.0
EFPJCCAL_951.00.01.0
EFPJCCAL_961.00.01.0
EFPJCCAL_971.00.01.0
EFPJCCAL_980.01.00.0
EFPJCCAL_990.01.00.0
EFPJCCAL_1000.01.00.0
EFPJCCAL_1010.01.00.0
EFPJCCAL_1021.00.01.0
EFPJCCAL_1030.01.00.0
EFPJCCAL_1040.01.00.0
EFPJCCAL_1051.00.01.0
EFPJCCAL_1061.00.01.0
EFPJCCAL_1071.00.01.0
EFPJCCAL_1080.01.00.0
EFPJCCAL_1090.01.00.0
EFPJCCAL_1100.01.00.0
EFPJCCAL_1110.01.00.0
EFPJCCAL_1120.01.00.0
EFPJCCAL_1130.01.00.0
EFPJCCAL_1140.01.00.0
EFPJCCAL_1150.01.00.0
EFPJCCAL_1161.00.01.0
EFPJCCAL_1170.01.00.0
EFPJCCAL_1181.00.01.0
EFPJCCAL_1190.01.00.0
EFPJCCAL_1200.01.00.0
EFPJCCAL_1210.01.00.0
EFPJCCAL_1220.01.00.0
EFPJCCAL_1230.01.00.0
EFPJCCAL_1241.00.01.0
EFPJCCAL_1250.01.00.0
EFPJCCAL_1260.01.00.0
EFPJCCAL_1270.01.00.0
EFPJCCAL_1280.01.00.0
EFPJCCAL_1290.01.00.0
EFPJCCAL_1300.01.00.0
EFPJCCAL_1310.01.00.0
EFPJCCAL_1320.01.00.0
EFPJCCAL_1330.01.00.0
EFPJCCAL_1341.00.01.0
EFPJCCAL_1351.00.01.0
EFPJCCAL_1360.01.00.0
EFPJCCAL_1370.01.00.0
EFPJCCAL_1380.01.00.0
EFPJCCAL_1391.00.01.0
EFPJCCAL_1400.01.00.0
EFPJCCAL_1411.00.01.0
EFPJCCAL_1420.01.00.0
EFPJCCAL_1431.00.01.0
EFPJCCAL_1440.01.00.0
EFPJCCAL_1450.01.00.0
EFPJCCAL_1461.00.01.0
EFPJCCAL_1470.01.00.0
EFPJCCAL_1480.01.00.0
EFPJCCAL_1491.00.01.0
EFPJCCAL_1500.01.00.0
EFPJCCAL_1510.01.00.0
EFPJCCAL_1521.00.01.0
EFPJCCAL_1531.00.01.0
EFPJCCAL_1540.01.00.0
EFPJCCAL_1550.01.00.0
EFPJCCAL_1560.01.00.0
EFPJCCAL_1571.00.01.0
EFPJCCAL_1581.00.01.0
EFPJCCAL_1590.01.00.0
EFPJCCAL_1601.00.01.0
EFPJCCAL_1610.01.00.0
EFPJCCAL_1621.00.01.0
EFPJCCAL_1630.01.00.0
EFPJCCAL_1640.01.00.0
EFPJCCAL_1651.00.01.0
EFPJCCAL_1660.01.00.0
EFPJCCAL_1671.00.01.0
EFPJCCAL_1680.01.00.0
EFPJCCAL_1690.01.00.0
EFPJCCAL_1700.01.00.0
EFPJCCAL_1710.01.00.0
EFPJCCAL_1721.00.01.0
EFPJCCAL_1731.00.01.0
EFPJCCAL_1740.01.00.0
EFPJCCAL_1751.00.01.0
EFPJCCAL_1760.01.00.0
EFPJCCAL_1770.01.00.0
EFPJCCAL_1780.01.00.0
EFPJCCAL_1791.00.01.0
EFPJCCAL_1800.01.00.0
EFPJCCAL_1821.00.01.0
EFPJCCAL_1831.00.01.0
EFPJCCAL_1851.00.01.0
EFPJCCAL_1861.00.01.0
EFPJCCAL_1871.00.01.0
EFPJCCAL_1880.01.00.0
EFPJCCAL_1890.01.00.0
EFPJCCAL_1901.00.01.0
EFPJCCAL_1910.01.00.0
EFPJCCAL_1920.01.00.0
EFPJCCAL_1930.01.00.0
EFPJCCAL_1940.01.00.0
EFPJCCAL_1951.00.01.0
EFPJCCAL_1961.00.01.0
EFPJCCAL_1971.00.01.0
EFPJCCAL_1981.00.01.0
EFPJCCAL_1990.01.00.0
EFPJCCAL_2000.01.00.0
EFPJCCAL_2010.01.00.0
EFPJCCAL_2020.01.00.0
EFPJCCAL_2031.00.01.0
EFPJCCAL_2041.00.01.0
EFPJCCAL_2050.01.00.0
EFPJCCAL_2061.00.01.0
EFPJCCAL_2070.01.00.0
EFPJCCAL_2080.01.00.0
EFPJCCAL_2091.00.01.0
EFPJCCAL_2100.01.00.0
EFPJCCAL_2110.01.00.0
EFPJCCAL_2121.00.01.0
EFPJCCAL_2131.00.01.0
EFPJCCAL_2140.01.00.0
EFPJCCAL_2151.00.01.0
EFPJCCAL_2161.00.01.0
EFPJCCAL_2171.00.01.0
EFPJCCAL_2180.01.00.0
EFPJCCAL_2190.01.00.0
EFPJCCAL_2201.00.01.0
EFPJCCAL_2210.01.00.0
EFPJCCAL_2220.01.00.0
EFPJCCAL_2231.00.01.0
EFPJCCAL_2241.00.01.0
EFPJCCAL_2250.01.00.0
EFPJCCAL_2261.00.01.0
EFPJCCAL_2271.00.01.0
EFPJCCAL_2280.01.00.0
EFPJCCAL_2291.00.01.0
EFPJCCAL_2300.01.00.0
EFPJCCAL_2320.01.00.0
EFPJCCAL_2330.01.00.0
EFPJCCAL_2341.00.01.0
EFPJCCAL_2350.01.00.0
EFPJCCAL_2360.01.00.0
EFPJCCAL_2370.01.00.0
EFPJCCAL_2381.00.01.0
EFPJCCAL_2391.00.01.0
EFPJCCAL_2400.01.00.0
EFPJCCAL_2411.00.01.0
EFPJCCAL_2421.00.01.0
EFPJCCAL_2431.00.01.0
EFPJCCAL_2440.01.00.0
EFPJCCAL_2450.01.00.0
EFPJCCAL_2460.01.00.0
EFPJCCAL_2471.00.01.0
EFPJCCAL_2481.00.01.0
EFPJCCAL_2491.00.01.0
EFPJCCAL_2501.00.01.0
EFPJCCAL_2520.01.00.0
EFPJCCAL_2541.00.01.0
EFPJCCAL_2550.01.00.0
EFPJCCAL_2561.00.01.0
EFPJCCAL_2590.01.00.0
EFPJCCAL_2601.00.01.0
EFPJCCAL_2610.01.00.0
EFPJCCAL_2621.00.01.0
EFPJCCAL_2631.00.01.0
EFPJCCAL_2640.01.00.0
EFPJCCAL_2651.00.01.0
EFPJCCAL_2660.01.00.0
EFPJCCAL_2671.00.01.0
EFPJCCAL_2681.00.01.0
EFPJCCAL_2691.00.01.0
EFPJCCAL_2700.01.00.0
EFPJCCAL_2711.00.01.0
EFPJCCAL_2721.00.01.0
EFPJCCAL_2730.01.00.0
EFPJCCAL_2740.01.00.0
EFPJCCAL_2751.00.01.0
EFPJCCAL_2760.01.00.0
EFPJCCAL_2770.01.00.0
EFPJCCAL_2780.01.00.0
EFPJCCAL_2791.00.01.0
EFPJCCAL_2800.01.00.0
EFPJCCAL_2811.00.01.0
EFPJCCAL_2820.01.00.0
EFPJCCAL_2831.00.01.0
EFPJCCAL_2851.00.01.0
EFPJCCAL_2860.01.00.0
EFPJCCAL_2870.01.00.0
EFPJCCAL_2880.01.00.0
EFPJCCAL_2890.01.00.0
EFPJCCAL_2900.01.00.0
EFPJCCAL_2911.00.01.0
EFPJCCAL_2921.00.01.0
EFPJCCAL_2931.00.01.0
EFPJCCAL_2940.01.00.0
EFPJCCAL_2951.00.01.0
EFPJCCAL_2961.00.01.0
EFPJCCAL_2971.00.01.0
EFPJCCAL_2981.00.01.0
EFPJCCAL_2990.01.00.0
EFPJCCAL_3001.00.01.0
EFPJCCAL_3011.00.01.0
EFPJCCAL_3021.00.01.0
EFPJCCAL_3031.00.01.0
EFPJCCAL_3041.00.01.0
EFPJCCAL_3050.01.00.0
EFPJCCAL_3060.01.00.0
EFPJCCAL_3070.01.00.0
EFPJCCAL_3080.01.00.0
EFPJCCAL_3100.01.00.0
EFPJCCAL_3111.00.01.0
EFPJCCAL_3120.01.00.0
EFPJCCAL_3130.01.00.0
EFPJCCAL_3141.00.01.0
EFPJCCAL_3151.00.01.0
EFPJCCAL_3160.01.00.0
EFPJCCAL_3170.01.00.0
EFPJCCAL_3180.01.00.0
EFPJCCAL_3190.01.00.0
EFPJCCAL_3200.01.00.0
EFPJCCAL_3210.01.00.0
EFPJCCAL_3220.01.00.0
EFPJCCAL_3231.00.01.0
EFPJCCAL_3240.01.00.0
EFPJCCAL_3251.00.01.0
EFPJCCAL_3260.01.00.0
EFPJCCAL_3270.01.00.0
EFPJCCAL_3280.01.00.0
EFPJCCAL_3290.01.00.0
EFPJCCAL_3300.01.00.0
EFPJCCAL_3310.01.00.0
EFPJCCAL_3320.01.00.0
EFPJCCAL_3330.01.00.0
EFPJCCAL_3340.01.00.0
EFPJCCAL_3350.01.00.0
EFPJCCAL_3360.01.00.0
EFPJCCAL_3370.01.00.0
EFPJCCAL_3380.01.00.0
EFPJCCAL_3390.01.00.0
EFPJCCAL_3400.01.00.0
EFPJCCAL_3410.01.00.0
EFPJCCAL_3420.01.00.0
EFPJCCAL_3430.01.00.0
EFPJCCAL_3440.01.00.0
EFPJCCAL_3450.01.00.0
EFPJCCAL_3460.01.00.0
EFPJCCAL_3470.01.00.0
EFPJCCAL_3480.01.00.0
EFPJCCAL_3490.01.00.0
EFPJCCAL_3500.01.00.0
EFPJCCAL_3510.01.00.0
EFPJCCAL_3521.00.01.0
EFPJCCAL_3530.01.00.0
EFPJCCAL_3540.01.00.0
EFPJCCAL_3550.01.00.0
EFPJCCAL_3560.01.00.0
EFPJCCAL_3570.01.00.0
EFPJCCAL_3580.01.00.0
EFPJCCAL_3590.01.00.0
EFPJCCAL_3600.01.00.0
EFPJCCAL_3610.01.00.0
EFPJCCAL_3620.01.00.0
EFPJCCAL_3630.01.00.0
EFPJCCAL_3640.01.00.0
EFPJCCAL_3650.01.00.0
EFPJCCAL_3661.00.01.0
EFPJCCAL_3670.01.00.0
EFPJCCAL_3680.01.00.0
EFPJCCAL_3690.01.00.0
EFPJCCAL_3700.01.00.0
EFPJCCAL_3710.01.00.0
EFPJCCAL_3720.01.00.0
EFPJCCAL_3730.01.00.0
EFPJCCAL_3740.01.00.0
EFPJCCAL_3751.00.01.0
EFPJCCAL_3760.01.00.0
EFPJCCAL_3770.01.00.0
EFPJCCAL_3780.01.00.0
EFPJCCAL_3790.01.00.0
EFPJCCAL_3800.01.00.0
EFPJCCAL_3810.01.00.0
EFPJCCAL_3820.01.00.0
EFPJCCAL_3830.01.00.0
EFPJCCAL_3840.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
EFPJCCAL_445321360582FalseSiphoviridaeVOG4581,
EFPJCCAL_111130135143027FalseUnknownVOG0083,
EFPJCCAL_16634816772FalseUnknownVOG8909,
EFPJCCAL_277385410623FalseUnknownVOG6366,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements