Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 5 | 0 | 0 | 5.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NLKCACJH_9 | 13882 | 14682 | ErmF | ARO:3000498 | ErmF | 97.74 | 100.00 | M17124.1 |
| NLKCACJH_9 | 12437 | 13576 | tet(X1) | ARO:3005166 | tet(X1) | 99.72 | 105.57 | AJ311171.1 |
| NLKCACJH_9 | 11102 | 12238 | tet(X) | ARO:3000205 | tet(X) | 99.47 | 97.42 | M37699.1 |
| NLKCACJH_9 | 10063 | 10926 | aadS | ARO:3004683 | aadS | 100.00 | 100.00 | M72415.1 |
| NLKCACJH_145 | 428 | 2401 | tet(Q) | ARO:3000191 | tet(Q) | 96.65 | 100.00 | Z21523.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NLKCACJH_9 | 13882 | 14682 | erm(F) | Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 99.88 | 100.00 | M62487 |
| NLKCACJH_9 | 11102 | 12268 | tet(X) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline, Tigecycline | 99.83 | 100.00 | M37699 |
| NLKCACJH_145 | 428 | 2353 | tet(Q) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline | 99.64 | 100.00 | L33696 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NLKCACJH_9 | 10066 | 10926 | aadS | aminoglycoside 6-adenylyltransferase AadS | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_003013318.1 |
| NLKCACJH_9 | 11105 | 12268 | tet(X2) | tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X2) | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_008651082.1 |
| NLKCACJH_9 | 12440 | 13576 | tet(X1) | tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X1) | BLASTX | 99.74 | 100.00 | WP_204376222.1 |
| NLKCACJH_9 | 13882 | 14679 | erm(F) | 23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(F) | BLASTX | 99.62 | 100.00 | WP_063844771.1 |
| NLKCACJH_145 | 431 | 2353 | tet(Q) | tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q) | BLASTX | 99.22 | 100.00 | WP_063856407.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| NLKCACJH_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_5 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_7 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_8 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_11 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_26 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_28 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_38 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_40 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_41 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_47 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_48 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_57 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_58 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_59 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_62 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_65 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_67 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_68 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_70 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_71 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_72 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_75 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_76 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_80 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_81 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_82 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_85 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_87 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_91 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_93 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_96 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_97 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_102 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_104 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_105 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_106 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_107 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_109 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_114 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_115 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_117 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_119 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_121 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_123 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_125 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_126 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_127 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_128 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_129 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_131 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_132 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_134 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_136 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_137 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_138 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_140 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_141 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_146 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_147 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_148 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_150 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_151 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_153 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_154 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_155 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_156 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_157 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_160 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_161 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_162 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_163 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_164 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_167 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_169 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_170 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_171 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_172 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_173 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_174 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_176 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_178 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_179 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_180 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_181 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_182 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_183 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_184 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_185 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_186 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_187 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_188 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_189 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_190 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_191 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_192 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_193 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_194 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_195 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_196 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_197 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_198 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_199 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_200 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_201 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_202 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_203 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_204 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_205 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_206 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_207 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_208 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_209 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_210 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_211 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_212 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_213 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_214 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_215 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_216 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_217 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_218 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_219 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_220 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_221 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_222 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_223 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_224 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_225 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_226 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_227 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_228 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_229 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_230 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_231 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_232 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_233 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_234 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_235 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_236 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_237 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_238 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_239 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_240 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_241 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_242 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_243 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_244 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_245 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NLKCACJH_246 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NLKCACJH_247 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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Prophage
Phigaro
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