Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 1 | 0 | 1 | 1.41 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MJGODNEJ_381 | 1935 | 2885 | cfxA3 | Ampicillin | 86.01 | 98.34 | AF472622 |
| MJGODNEJ_381 | 1935 | 2885 | cfxA4 | Unknown Beta-lactam | 86.01 | 98.34 | AY769933 |
| MJGODNEJ_381 | 1935 | 2885 | cfxA5 | Unknown Beta-lactam | 86.01 | 98.34 | AY769934 |
| MJGODNEJ_381 | 1935 | 2885 | cfxA | Cefoxitin, Ampicillin | 86.01 | 98.34 | U38243 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MJGODNEJ_381 | 1933 | 2886 | cfxA | CfxA family broad-spectrum class A beta-lactamase | BLASTX | 83.65 | 99.07 | WP_004339683.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MJGODNEJ_420 | 1457 | 3037 | GroEL | 0.0 | folding of newly synthesized proteins, preventing misfolding and aggregation | 86.91 | 96.70 | BAA04222 |
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| MJGODNEJ_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_18 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_19 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_20 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_21 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_22 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_27 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_30 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_31 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_32 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_33 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_34 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_35 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_44 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_45 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_49 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_51 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_55 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_57 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_60 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_62 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_65 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_67 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_68 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_70 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_71 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_74 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_75 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_76 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_77 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_78 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_80 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_82 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_85 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_88 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_89 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_96 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_97 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_98 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_99 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_101 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_103 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_106 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_107 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_109 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_112 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_117 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_121 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_125 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_126 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_127 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_128 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_129 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_132 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_133 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_134 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_135 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_136 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_138 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_141 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_145 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_146 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_147 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_148 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_149 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_153 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_154 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_155 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_156 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_159 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_160 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_161 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_162 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_163 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_165 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_166 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_167 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_169 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_171 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_172 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_173 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_175 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_176 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_178 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_179 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_180 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_181 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_182 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_183 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_184 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_185 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_186 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_187 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_188 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_189 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_190 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_191 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_192 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_193 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_194 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_195 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_196 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_197 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_198 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_199 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_200 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_201 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_203 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_204 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_205 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_206 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_207 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_208 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_209 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_210 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_211 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_212 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_213 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_214 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_215 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_216 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_217 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_218 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_219 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_220 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_221 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_222 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_223 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_224 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_225 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_226 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_227 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_228 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_229 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_230 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_231 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_232 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_233 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_234 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_235 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_236 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_237 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_238 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_239 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_240 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_241 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_242 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_243 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_244 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_245 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_246 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_247 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_248 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_249 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_250 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_251 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_252 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_253 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_254 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_255 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_256 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_257 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_258 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_259 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_260 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_261 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_262 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_263 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_264 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_265 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MJGODNEJ_266 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_267 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MJGODNEJ_268 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
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