Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
GMCFAGMN_10.01.00.0
GMCFAGMN_20.01.00.0
GMCFAGMN_30.01.00.0
GMCFAGMN_40.01.00.0
GMCFAGMN_50.01.00.0
GMCFAGMN_60.01.00.0
GMCFAGMN_70.01.00.0
GMCFAGMN_81.00.01.0
GMCFAGMN_90.01.00.0
GMCFAGMN_100.01.00.0
GMCFAGMN_110.01.00.0
GMCFAGMN_121.00.01.0
GMCFAGMN_130.01.00.0
GMCFAGMN_140.01.00.0
GMCFAGMN_150.01.00.0
GMCFAGMN_160.01.00.0
GMCFAGMN_170.01.00.0
GMCFAGMN_180.01.00.0
GMCFAGMN_190.01.00.0
GMCFAGMN_201.00.01.0
GMCFAGMN_210.01.00.0
GMCFAGMN_220.01.00.0
GMCFAGMN_231.00.01.0
GMCFAGMN_240.01.00.0
GMCFAGMN_250.01.00.0
GMCFAGMN_260.01.00.0
GMCFAGMN_270.01.00.0
GMCFAGMN_280.01.00.0
GMCFAGMN_300.01.00.0
GMCFAGMN_311.00.01.0
GMCFAGMN_320.01.00.0
GMCFAGMN_330.01.00.0
GMCFAGMN_340.01.00.0
GMCFAGMN_350.01.00.0
GMCFAGMN_360.01.00.0
GMCFAGMN_371.00.01.0
GMCFAGMN_381.00.01.0
GMCFAGMN_390.01.00.0
GMCFAGMN_400.01.00.0
GMCFAGMN_410.01.00.0
GMCFAGMN_421.00.01.0
GMCFAGMN_430.01.00.0
GMCFAGMN_440.01.00.0
GMCFAGMN_451.00.01.0
GMCFAGMN_461.00.01.0
GMCFAGMN_470.01.00.0
GMCFAGMN_481.00.01.0
GMCFAGMN_490.01.00.0
GMCFAGMN_501.00.01.0
GMCFAGMN_510.01.00.0
GMCFAGMN_521.00.01.0
GMCFAGMN_531.00.01.0
GMCFAGMN_540.01.00.0
GMCFAGMN_551.00.01.0
GMCFAGMN_560.01.00.0
GMCFAGMN_570.01.00.0
GMCFAGMN_580.01.00.0
GMCFAGMN_590.01.00.0
GMCFAGMN_601.00.01.0
GMCFAGMN_611.00.01.0
GMCFAGMN_620.01.00.0
GMCFAGMN_630.01.00.0
GMCFAGMN_640.01.00.0
GMCFAGMN_651.00.01.0
GMCFAGMN_660.01.00.0
GMCFAGMN_680.01.00.0
GMCFAGMN_690.01.00.0
GMCFAGMN_700.01.00.0
GMCFAGMN_710.01.00.0
GMCFAGMN_721.00.01.0
GMCFAGMN_730.01.00.0
GMCFAGMN_740.01.00.0
GMCFAGMN_751.00.01.0
GMCFAGMN_760.01.00.0
GMCFAGMN_771.00.01.0
GMCFAGMN_780.01.00.0
GMCFAGMN_790.01.00.0
GMCFAGMN_800.01.00.0
GMCFAGMN_810.01.00.0
GMCFAGMN_820.01.00.0
GMCFAGMN_830.01.00.0
GMCFAGMN_840.01.00.0
GMCFAGMN_850.01.00.0
GMCFAGMN_860.01.00.0
GMCFAGMN_870.01.00.0
GMCFAGMN_880.01.00.0
GMCFAGMN_890.01.00.0
GMCFAGMN_900.01.00.0
GMCFAGMN_920.01.00.0
GMCFAGMN_930.01.00.0
GMCFAGMN_940.01.00.0
GMCFAGMN_950.01.00.0
GMCFAGMN_961.00.01.0
GMCFAGMN_970.01.00.0
GMCFAGMN_980.01.00.0
GMCFAGMN_1001.00.01.0
GMCFAGMN_1010.01.00.0
GMCFAGMN_1020.01.00.0
GMCFAGMN_1031.00.01.0
GMCFAGMN_1041.00.01.0
GMCFAGMN_1050.01.00.0
GMCFAGMN_1061.00.01.0
GMCFAGMN_1070.01.00.0
GMCFAGMN_1080.01.00.0
GMCFAGMN_1091.00.01.0
GMCFAGMN_1120.01.00.0
GMCFAGMN_1130.01.00.0
GMCFAGMN_1240.01.00.0
GMCFAGMN_1350.01.00.0
GMCFAGMN_1460.01.00.0
GMCFAGMN_1570.01.00.0
GMCFAGMN_1680.01.00.0
GMCFAGMN_1790.01.00.0
GMCFAGMN_1850.01.00.0
GMCFAGMN_1860.01.00.0
GMCFAGMN_1870.01.00.0
GMCFAGMN_1880.01.00.0
GMCFAGMN_1890.01.00.0
GMCFAGMN_1900.01.00.0
GMCFAGMN_1910.01.00.0
GMCFAGMN_1920.01.00.0
GMCFAGMN_1930.01.00.0
GMCFAGMN_1940.01.00.0
GMCFAGMN_1950.01.00.0
GMCFAGMN_1960.01.00.0
GMCFAGMN_1970.01.00.0
GMCFAGMN_1980.01.00.0
GMCFAGMN_1990.01.00.0
GMCFAGMN_2000.01.00.0
GMCFAGMN_2010.01.00.0
GMCFAGMN_2020.01.00.0
GMCFAGMN_2030.01.00.0
GMCFAGMN_2040.01.00.0
GMCFAGMN_2050.01.00.0
GMCFAGMN_2060.01.00.0
GMCFAGMN_2070.01.00.0
GMCFAGMN_2080.01.00.0
GMCFAGMN_2090.01.00.0
GMCFAGMN_2100.01.00.0
GMCFAGMN_2110.01.00.0
GMCFAGMN_2120.01.00.0
GMCFAGMN_2130.01.00.0
GMCFAGMN_2140.01.00.0
GMCFAGMN_2150.01.00.0
GMCFAGMN_2160.01.00.0
GMCFAGMN_2170.01.00.0
GMCFAGMN_2180.01.00.0
GMCFAGMN_2190.01.00.0
GMCFAGMN_2200.01.00.0
GMCFAGMN_2210.01.00.0
GMCFAGMN_2220.01.00.0
GMCFAGMN_2230.01.00.0
GMCFAGMN_2240.01.00.0
GMCFAGMN_2250.01.00.0
GMCFAGMN_2260.01.00.0
GMCFAGMN_2270.01.00.0
GMCFAGMN_2280.01.00.0
GMCFAGMN_2290.01.00.0
GMCFAGMN_2300.01.00.0
GMCFAGMN_2310.01.00.0
GMCFAGMN_2320.01.00.0
GMCFAGMN_2331.00.01.0
GMCFAGMN_2340.01.00.0
GMCFAGMN_2350.01.00.0
GMCFAGMN_2360.01.00.0
GMCFAGMN_2370.01.00.0
GMCFAGMN_2380.01.00.0
GMCFAGMN_2390.01.00.0
GMCFAGMN_2400.01.00.0
GMCFAGMN_2410.01.00.0
GMCFAGMN_2420.01.00.0
GMCFAGMN_2430.01.00.0
GMCFAGMN_2440.01.00.0
GMCFAGMN_2450.01.00.0
GMCFAGMN_2460.01.00.0
GMCFAGMN_2471.00.01.0
GMCFAGMN_2480.01.00.0
GMCFAGMN_2490.01.00.0
GMCFAGMN_2500.01.00.0
GMCFAGMN_2511.00.01.0
GMCFAGMN_2520.01.00.0
GMCFAGMN_2531.00.01.0
GMCFAGMN_2540.01.00.0
GMCFAGMN_2550.01.00.0
GMCFAGMN_2560.01.00.0
GMCFAGMN_2570.01.00.0
GMCFAGMN_2581.00.01.0
GMCFAGMN_2590.01.00.0
GMCFAGMN_2600.01.00.0
GMCFAGMN_2610.01.00.0
GMCFAGMN_2620.01.00.0
GMCFAGMN_2630.01.00.0
GMCFAGMN_2640.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements